RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000001872.4

Hoxd13-201, Transcript of Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxd13, Length 2,483 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Mgat5Q8R4G6 740 aa20.61■□□□□ 0.89
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Tdrd3Q91W18 743 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Sugt1Q9CX34 336 aa20.61■□□□□ 0.89
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Psmd8Q9CX56 353 aa20.61■□□□□ 0.89
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Nt5c3aQ9D020 331 aa20.61■□□□□ 0.89
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Krt16Q9Z2K1 469 aa20.61■□□□□ 0.89
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Gm29554A0A087WNW4 188 aa20.6■□□□□ 0.89
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 AfmO89020 608 aa20.6■□□□□ 0.89
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Il1rapl1P59823 695 aa20.6■□□□□ 0.89
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 InhbaQ04998 424 aa20.6■□□□□ 0.89
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Pou6f1Q07916 301 aa20.6■□□□□ 0.89
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Trim72Q1XH17 477 aa20.6■□□□□ 0.89
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Arid5aQ3U108 590 aa20.6■□□□□ 0.89
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Vat1lQ80TB8 417 aa20.6■□□□□ 0.89
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Ccdc68Q8BVC4 333 aa20.6■□□□□ 0.89
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Slc38a7Q8BWH0 463 aa20.6■□□□□ 0.89
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Smtnl2Q8CI12 456 aa20.6■□□□□ 0.89
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Chrac1Q9JKP8 129 aa20.6■□□□□ 0.89
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 AlbP07724 608 aa20.6■□□□□ 0.89
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 AmhP27106 555 aa20.6■□□□□ 0.89
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Hoxc13P50207 328 aa20.6■□□□□ 0.89
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Nub1P54729 614 aa20.6■□□□□ 0.89
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Olfm3P63056 478 aa20.6■□□□□ 0.89
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Gata6Q61169 589 aa20.6■□□□□ 0.89
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Osbpl6Q8BXR9 959 aa20.6■□□□□ 0.89
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 WdpcpQ8C456 722 aa20.6■□□□□ 0.89
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 GatbQ99JT1 557 aa20.6■□□□□ 0.89
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Slc25a11Q9CR62 314 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Thap12Q9CUX1 758 aa20.6■□□□□ 0.89
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Ankef1Q9D2J7 775 aa20.6■□□□□ 0.89
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Drc3Q9D5E4 523 aa20.6■□□□□ 0.89
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Olr1Q9EQ09 363 aa20.6■□□□□ 0.89
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Rdh14Q9ERI6 334 aa20.6■□□□□ 0.89
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Pdpk1Q9Z2A0 559 aa20.6■□□□□ 0.89
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Taf1Q80UV9 1891 aa20.59■□□□□ 0.89
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Nr3c1P06537 783 aa20.59■□□□□ 0.89
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Zfp42P22227 288 aa20.59■□□□□ 0.89
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Prkaa1Q5EG47 559 aa20.59■□□□□ 0.89
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Il17aQ62386 158 aa20.59■□□□□ 0.89
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Vgll2Q8BGW8 322 aa20.59■□□□□ 0.89
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Prkag2Q91WG5 566 aa20.59■□□□□ 0.89
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Nme5Q99MH5 211 aa20.59■□□□□ 0.89
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Wars2Q9CYK1 360 aa20.59■□□□□ 0.89
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Aldh18a1Q9Z110 795 aa20.59■□□□□ 0.89
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Dsc2P55292 902 aa20.59■□□□□ 0.89
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Kif11Q6P9P6 1052 aa20.59■□□□□ 0.89
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Arhgef18Q6P9R4 1021 aa20.59■□□□□ 0.89
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Arhgap29Q8CGF1 1266 aa20.59■□□□□ 0.89
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Def8Q99J78 448 aa20.59■□□□□ 0.89
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Fam90a1bQ9D4F3 419 aa20.59■□□□□ 0.89
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 ParvaQ9EPC1 372 aa20.59■□□□□ 0.89
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 DpysQ9EQF5 519 aa20.59■□□□□ 0.89
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Lima1Q9ERG0 753 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Gm3424L7N298 263 aa20.58■□□□□ 0.89
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Gm8246M0QWX9 263 aa20.58■□□□□ 0.89
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 ItgavP43406 1044 aa20.58■□□□□ 0.89
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 VegfaQ00731 214 aa20.58■□□□□ 0.89
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Sema3dQ8BH34 777 aa20.58■□□□□ 0.89
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Usp37Q8C0R0 979 aa20.58■□□□□ 0.89
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Gpc5Q8CAL5 572 aa20.58■□□□□ 0.89
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Med21Q9CQ39 144 aa20.58■□□□□ 0.89
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Plscr2Q9DCW2 307 aa20.58■□□□□ 0.89
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 FibpQ9JI19 357 aa20.58■□□□□ 0.89
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 PolhQ9JJN0 694 aa20.58■□□□□ 0.89
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Tmod4Q9JLH8 345 aa20.58■□□□□ 0.89
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Angptl2Q9R045 493 aa20.58■□□□□ 0.89
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Cntnap5cQ0V8T7 1305 aa20.58■□□□□ 0.88
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Arhgef10Q8C033 1345 aa20.58■□□□□ 0.88
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Gm4846B2RWH8 538 aa20.58■□□□□ 0.88
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Ifi207E9Q3L4 978 aa20.58■□□□□ 0.88
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 YwhagP61982 247 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.88
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Erbb2P70424 1256 aa20.58■□□□□ 0.88
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Pdlim7Q3TJD7 457 aa20.58■□□□□ 0.88
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Slc26a2Q62273 739 aa20.58■□□□□ 0.88
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Lrrc27Q80YS5 523 aa20.58■□□□□ 0.88
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Fbxo28Q8BIG4 368 aa20.58■□□□□ 0.88
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Sap130Q8BIH0 1057 aa20.58■□□□□ 0.88
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Clic5Q8BXK9 251 aa20.58■□□□□ 0.88
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 PaoxQ8C0L6 504 aa20.58■□□□□ 0.88
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Efhc1Q9D9T8 648 aa20.58■□□□□ 0.88
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Rsph3bQ9DA80 389 aa20.58■□□□□ 0.88
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Rassf7Q9DD19 359 aa20.58■□□□□ 0.88
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Copg2Q9QXK3 871 aa20.58■□□□□ 0.88
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Cntnap4Q99P47 1310 aa20.57■□□□□ 0.88
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Mageb4A2A9R3 556 aa20.57■□□□□ 0.88
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Ccdc144bE9PVZ3 520 aa20.57■□□□□ 0.88
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 LdhbP16125 334 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Lzts1P60853 599 aa20.57■□□□□ 0.88
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Vars2Q3U2A8 1060 aa20.57■□□□□ 0.88
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Gm29609Q3UU56 907 aa20.57■□□□□ 0.88
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Fam129aQ3UW53 926 aa20.57■□□□□ 0.88
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Sfi1Q3UZY0 1216 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2700097O09RikQ6PGK3 301 aa20.57■□□□□ 0.88
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Cacna2d2Q6PHS9 1154 aa20.57■□□□□ 0.88
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Usp8Q80U87 1080 aa20.57■□□□□ 0.88
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Gtf3c2Q8BL74 907 aa20.57■□□□□ 0.88
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Ppme1Q8BVQ5 386 aa20.57■□□□□ 0.88
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Hdac7Q8C2B3 938 aa20.57■□□□□ 0.88
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Taco1Q8K0Z7 294 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Fcho1Q8K285 873 aa20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 48.8 ms