RNA–Protein interactions for RNA: YPR179C

HDA3, Transcript of Subunit of the HDA1 histone deacetylase complex, yeastyeast

Gene HDA3, Length 1,968 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HDA3YPR179C NAT5Q08689 176 aa0.41□□□□□ -2.34
HDA3YPR179C RPL40AP0CH08 128 aaKnown RBP0.41□□□□□ -2.34
HDA3YPR179C RPL40BP0CH09 128 aaKnown RBP0.41□□□□□ -2.34
HDA3YPR179C FUN14P18411 198 aa0.41□□□□□ -2.34
HDA3YPR179C ANB1P19211 157 aa0.41□□□□□ -2.34
HDA3YPR179C SFT2P38166 215 aa0.41□□□□□ -2.34
HDA3YPR179C YPL067CQ02754 198 aa0.41□□□□□ -2.34
HDA3YPR179C COF1Q03048 143 aaKnown RBP0.41□□□□□ -2.34
HDA3YPR179C RBL2P48606 106 aaKnown RBP0.4□□□□□ -2.35
HDA3YPR179C BRP1P53194 125 aa0.4□□□□□ -2.35
HDA3YPR179C HHO1P53551 258 aa0.4□□□□□ -2.35
HDA3YPR179C SPC3Q12133 184 aa0.4□□□□□ -2.35
HDA3YPR179C KTI11Q3E840 82 aa0.4□□□□□ -2.35
HDA3YPR179C DNA2P38859 1522 aa0.4□□□□□ -2.35
HDA3YPR179C RPL43AP0CX25 92 aaKnown RBP0.39□□□□□ -2.35
HDA3YPR179C RPL43BP0CX26 92 aa0.39□□□□□ -2.35
HDA3YPR179C MRPL44P19956 98 aa0.39□□□□□ -2.35
HDA3YPR179C RPS1AP33442 255 aaKnown RBP0.39□□□□□ -2.35
HDA3YPR179C YAP3P38749 330 aa0.39□□□□□ -2.35
HDA3YPR179C MVB12P42939 101 aa0.39□□□□□ -2.35
HDA3YPR179C YGR039WP53225 103 aa0.39□□□□□ -2.35
HDA3YPR179C COA6Q3E846 104 aa0.39□□□□□ -2.35
HDA3YPR179C UTP11P34247 250 aaPredicted RBP0.39□□□□□ -2.35
HDA3YPR179C EMC4P53073 190 aa0.39□□□□□ -2.35
HDA3YPR179C FIT3Q08907 204 aa0.39□□□□□ -2.35
HDA3YPR179C SNF2P22082 1703 aa0.39□□□□□ -2.35
HDA3YPR179C URA2P07259 2214 aaKnown RBP0.38□□□□□ -2.35
HDA3YPR179C QCR10P37299 77 aa0.38□□□□□ -2.35
HDA3YPR179C AIM4P38305 123 aaPredicted RBP0.38□□□□□ -2.35
HDA3YPR179C YGL149WP53116 101 aa0.38□□□□□ -2.35
HDA3YPR179C YLR307C-AQ3E825 87 aa0.38□□□□□ -2.35
HDA3YPR179C HUG1Q6Q5K6 68 aa0.38□□□□□ -2.35
HDA3YPR179C SIN3P22579 1536 aa0.38□□□□□ -2.35
HDA3YPR179C PFY1P07274 126 aa0.37□□□□□ -2.35
HDA3YPR179C HPM1P40481 377 aa0.37□□□□□ -2.35
HDA3YPR179C MON2P48563 1636 aaPredicted RBP0.37□□□□□ -2.35
HDA3YPR179C YLR157W-EP0CF00 54 aa0.37□□□□□ -2.35
HDA3YPR179C YCR050CP25630 102 aa0.37□□□□□ -2.35
HDA3YPR179C RPC19P28000 142 aaKnown RBP0.37□□□□□ -2.35
HDA3YPR179C MRPL11P36521 249 aaPredicted RBP0.37□□□□□ -2.35
HDA3YPR179C YLR296WQ05898 108 aa0.37□□□□□ -2.35
HDA3YPR179C YOR034C-AQ3E735 80 aa0.37□□□□□ -2.35
HDA3YPR179C SWR1Q05471 1514 aa0.37□□□□□ -2.35
HDA3YPR179C TY4B-JP47024 1803 aa0.37□□□□□ -2.35
HDA3YPR179C RTC6O14464 93 aa0.36□□□□□ -2.35
HDA3YPR179C RPL14AP36105 138 aaKnown RBP0.36□□□□□ -2.35
HDA3YPR179C YBR013CP38215 129 aa0.36□□□□□ -2.35
HDA3YPR179C RPL14BP38754 138 aaKnown RBP0.36□□□□□ -2.35
HDA3YPR179C YAL064WP39711 94 aa0.36□□□□□ -2.35
HDA3YPR179C MIC27P50945 234 aa0.36□□□□□ -2.35
HDA3YPR179C KOG1P38873 1557 aa0.36□□□□□ -2.35
HDA3YPR179C YSF3P0C074 85 aaPredicted RBP0.36□□□□□ -2.35
HDA3YPR179C SDH7Q04401 133 aa0.36□□□□□ -2.35
HDA3YPR179C GTT2Q12390 233 aa0.36□□□□□ -2.35
HDA3YPR179C DNF1P32660 1571 aa0.35□□□□□ -2.35
HDA3YPR179C HAP3P13434 144 aa0.35□□□□□ -2.35
HDA3YPR179C YMR321CQ04898 105 aa0.35□□□□□ -2.35
HDA3YPR179C PAU21P0CE86 164 aa0.34□□□□□ -2.35
HDA3YPR179C PAU22P0CE87 164 aa0.34□□□□□ -2.35
HDA3YPR179C TRS20P38334 175 aa0.34□□□□□ -2.35
HDA3YPR179C AIM18P38884 321 aa0.34□□□□□ -2.35
HDA3YPR179C HSP10P38910 106 aa0.34□□□□□ -2.35
HDA3YPR179C ELC1Q03071 99 aa0.34□□□□□ -2.35
HDA3YPR179C SNT2P53127 1403 aa0.34□□□□□ -2.35
HDA3YPR179C IRC20Q06554 1556 aa0.34□□□□□ -2.36
HDA3YPR179C PRS3P38689 320 aaKnown RBP0.34□□□□□ -2.36
HDA3YPR179C YRF1-3P0CX14 1859 aa0.33□□□□□ -2.36
HDA3YPR179C YRF1-7P0CX15 1859 aa0.33□□□□□ -2.36
HDA3YPR179C CUP1-1P0CX80 61 aa0.33□□□□□ -2.36
HDA3YPR179C CUP1-2P0CX81 61 aa0.33□□□□□ -2.36
HDA3YPR179C GSP1P32835 219 aaKnown RBP0.33□□□□□ -2.36
HDA3YPR179C CSN9Q03981 162 aa0.33□□□□□ -2.36
HDA3YPR179C TVP18Q04767 167 aa0.33□□□□□ -2.36
HDA3YPR179C LDB18Q07887 179 aa0.33□□□□□ -2.36
HDA3YPR179C ATP14Q12349 124 aa0.33□□□□□ -2.36
HDA3YPR179C YOR093CQ12275 1648 aa0.32□□□□□ -2.36
HDA3YPR179C PHS1P40857 217 aa0.32□□□□□ -2.36
HDA3YPR179C YNL277W-AQ3E7Z0 62 aa0.32□□□□□ -2.36
HDA3YPR179C MED11Q99278 115 aa0.32□□□□□ -2.36
HDA3YPR179C MRPL31P14063 131 aaPredicted RBP0.32□□□□□ -2.36
HDA3YPR179C YLR194CQ05777 254 aa0.32□□□□□ -2.36
HDA3YPR179C BLM10P43583 2143 aa0.31□□□□□ -2.36
HDA3YPR179C CYC2P38909 366 aa0.31□□□□□ -2.36
HDA3YPR179C YGR017WP53210 297 aa0.31□□□□□ -2.36
HDA3YPR179C FCF2Q12035 217 aaPredicted RBP0.31□□□□□ -2.36
HDA3YPR179C NTE1Q04958 1679 aa0.31□□□□□ -2.36
HDA3YPR179C MYO2P19524 1574 aaKnown RBP0.31□□□□□ -2.36
HDA3YPR179C RPL36BO14455 100 aaKnown RBP0.3□□□□□ -2.36
HDA3YPR179C RPL36AP05745 100 aaPredicted RBP0.3□□□□□ -2.36
HDA3YPR179C GIM4P40005 111 aaKnown RBP0.3□□□□□ -2.36
HDA3YPR179C YIL163CP40448 117 aa0.3□□□□□ -2.36
HDA3YPR179C MPC1P53157 130 aaKnown RBP0.3□□□□□ -2.36
HDA3YPR179C REV3P14284 1504 aa0.3□□□□□ -2.36
HDA3YPR179C TY1B-HO13535 1793 aa0.3□□□□□ -2.36
HDA3YPR179C YRF1-1P0CX20 1796 aa0.3□□□□□ -2.36
HDA3YPR179C YRF1-5P0CX21 1796 aa0.3□□□□□ -2.36
HDA3YPR179C YRF1-8P0CX22 1796 aa0.3□□□□□ -2.36
HDA3YPR179C MDS3P53094 1487 aa0.3□□□□□ -2.36
HDA3YPR179C BNI1P41832 1953 aa0.3□□□□□ -2.36
HDA3YPR179C ESC1Q03661 1658 aaKnown RBP0.3□□□□□ -2.36
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