RNA–Protein interactions for RNA: YPR178W

PRP4, Transcript of Splicing factor, yeastyeast

Gene PRP4, Length 1,398 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PRP4YPR178W ALG14P38242 237 aa8.42□□□□□ -1.06
PRP4YPR178W LST8P41318 303 aa8.42□□□□□ -1.06
PRP4YPR178W SOR2Q07786 357 aa8.42□□□□□ -1.06
PRP4YPR178W DAD1Q12248 94 aa8.42□□□□□ -1.06
PRP4YPR178W RPL27BP0C2H7 136 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
PRP4YPR178W YDR042CQ03205 200 aa8.41□□□□□ -1.06
PRP4YPR178W HYP2P23301 157 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
PRP4YPR178W YCR023CP25351 611 aa8.4□□□□□ -1.06
PRP4YPR178W YFL015CP43578 164 aa8.4□□□□□ -1.06
PRP4YPR178W YIL014C-AQ02598 104 aa8.4□□□□□ -1.06
PRP4YPR178W VTS1Q08831 523 aaKnown RBP RIP-Chip data8.4□□□□□ -1.06not detected
PRP4YPR178W ISU2Q12056 156 aa8.4□□□□□ -1.06
PRP4YPR178W UTP23Q12339 254 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
PRP4YPR178W CPT1P17898 393 aa8.38□□□□□ -1.07
PRP4YPR178W RPB10P22139 70 aa8.38□□□□□ -1.07
PRP4YPR178W TIR2P33890 251 aa8.38□□□□□ -1.07
PRP4YPR178W YLR296WQ05898 108 aa8.38□□□□□ -1.07
PRP4YPR178W YMR105W-AQ8TGS8 64 aa8.38□□□□□ -1.07
PRP4YPR178W BEM2P39960 2167 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
PRP4YPR178W CYC7P00045 113 aa8.37□□□□□ -1.07
PRP4YPR178W ADH1P00330 348 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
PRP4YPR178W MRPL20P22354 195 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
PRP4YPR178W SCW10Q04951 389 aa8.37□□□□□ -1.07
PRP4YPR178W YKL023C-AQ2V2P3 75 aa8.37□□□□□ -1.07
PRP4YPR178W RPL27AP0C2H6 136 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
PRP4YPR178W RPS23AP0CX29 145 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
PRP4YPR178W RPS23BP0CX30 145 aa8.36□□□□□ -1.07
PRP4YPR178W YPT53P36019 220 aa8.36□□□□□ -1.07
PRP4YPR178W CMC1P36064 111 aa8.35□□□□□ -1.07
PRP4YPR178W YBR220CP38318 560 aa8.35□□□□□ -1.07
PRP4YPR178W PET8P38921 284 aa8.35□□□□□ -1.07
PRP4YPR178W YMR141CP40211 102 aa8.35□□□□□ -1.07
PRP4YPR178W NCA3P46955 337 aa8.35□□□□□ -1.07
PRP4YPR178W SUR7P54003 302 aa8.35□□□□□ -1.07
PRP4YPR178W GAT3Q07928 141 aa8.35□□□□□ -1.07
PRP4YPR178W YOR029WQ12243 111 aa8.35□□□□□ -1.07
PRP4YPR178W FOL3Q12676 427 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
PRP4YPR178W RPL39P04650 51 aa8.35□□□□□ -1.07
PRP4YPR178W YHR213WP0CI67 198 aa8.35□□□□□ -1.07
PRP4YPR178W RRT1P38192 103 aa8.35□□□□□ -1.07
PRP4YPR178W ECM14P38836 430 aa8.35□□□□□ -1.07
PRP4YPR178W MST28P39552 234 aa8.35□□□□□ -1.07
PRP4YPR178W YJR096WP47137 282 aa8.35□□□□□ -1.07
PRP4YPR178W RXT3Q07458 294 aa8.35□□□□□ -1.07
PRP4YPR178W YLR342W-AQ3E810 57 aa8.35□□□□□ -1.07
PRP4YPR178W MBB1P39534 108 aa8.34□□□□□ -1.07
PRP4YPR178W YPL073CP40323 161 aa8.34□□□□□ -1.07
PRP4YPR178W MST27P53176 234 aa8.34□□□□□ -1.07
PRP4YPR178W ELC1Q03071 99 aa8.34□□□□□ -1.07
PRP4YPR178W MIX17Q03667 156 aa8.34□□□□□ -1.07
PRP4YPR178W GPI19Q04082 140 aa8.34□□□□□ -1.07
PRP4YPR178W YKR032WP36127 104 aa8.33□□□□□ -1.08
PRP4YPR178W YJL163CP46996 555 aa8.33□□□□□ -1.08
PRP4YPR178W BNA2P47125 453 aa8.33□□□□□ -1.08
PRP4YPR178W YIP1P53039 248 aa8.33□□□□□ -1.08
PRP4YPR178W YMR103CQ04436 120 aa8.33□□□□□ -1.08
PRP4YPR178W DGA1Q08650 418 aa8.33□□□□□ -1.08
PRP4YPR178W YKR045CP36138 183 aa8.32□□□□□ -1.08
PRP4YPR178W RPS26AP39938 119 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
PRP4YPR178W IMP2P46972 177 aa8.32□□□□□ -1.08
PRP4YPR178W DAL80P26343 269 aa8.3□□□□□ -1.08
PRP4YPR178W DUT1P33317 147 aa8.3□□□□□ -1.08
PRP4YPR178W GPI18P38211 433 aa8.3□□□□□ -1.08
PRP4YPR178W YHR140WP38842 239 aa8.3□□□□□ -1.08
PRP4YPR178W YJL213WP40896 331 aa8.3□□□□□ -1.08
PRP4YPR178W MGR2Q02889 113 aa8.3□□□□□ -1.08
PRP4YPR178W HEM13P11353 328 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
PRP4YPR178W SPC29P33419 253 aa8.29□□□□□ -1.08
PRP4YPR178W ADH5P38113 351 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
PRP4YPR178W YKR041WP36134 250 aa8.28□□□□□ -1.08
PRP4YPR178W SNF11P38956 169 aa8.28□□□□□ -1.08
PRP4YPR178W RPL15BP54780 204 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
PRP4YPR178W YTH1Q06102 208 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
PRP4YPR178W GEP3Q08622 556 aa8.28□□□□□ -1.08
PRP4YPR178W YLR112WQ12130 139 aa8.28□□□□□ -1.08
PRP4YPR178W DFM1Q12743 341 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
PRP4YPR178W RPP2AP05319 106 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
PRP4YPR178W PFY1P07274 126 aa8.27□□□□□ -1.09
PRP4YPR178W YER076CP40049 302 aa8.27□□□□□ -1.09
PRP4YPR178W YER181CP40097 107 aa8.27□□□□□ -1.09
PRP4YPR178W NUP42P49686 430 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
PRP4YPR178W FCF1Q05498 189 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
PRP4YPR178W AQY1P0CD91 305 aa8.26□□□□□ -1.09
PRP4YPR178W CDC43P18898 376 aa8.26□□□□□ -1.09
PRP4YPR178W ABM1P47146 123 aa8.26□□□□□ -1.09
PRP4YPR178W PCL2P25693 308 aa8.25□□□□□ -1.09
PRP4YPR178W GLE2P40066 365 aa8.25□□□□□ -1.09
PRP4YPR178W YNL046WP53956 172 aa8.25□□□□□ -1.09
PRP4YPR178W MOT3P54785 490 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
PRP4YPR178W PRM3Q08931 133 aa8.25□□□□□ -1.09
PRP4YPR178W TIM22Q12328 207 aa8.25□□□□□ -1.09
PRP4YPR178W LDB16P25587 256 aa8.24□□□□□ -1.09
PRP4YPR178W YJL027CP47063 138 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
PRP4YPR178W UBC7Q02159 165 aa8.24□□□□□ -1.09
PRP4YPR178W CTR2P38865 189 aa8.23□□□□□ -1.09
PRP4YPR178W SNU13P39990 126 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
PRP4YPR178W SGN1P40561 250 aaKnown RBP RIP-Chip data8.23□□□□□ -1.09not detected
PRP4YPR178W YFL051CP43552 160 aa8.23□□□□□ -1.09
PRP4YPR178W ATP23P53722 227 aa8.23□□□□□ -1.09
PRP4YPR178W YDL009CQ12210 107 aa8.23□□□□□ -1.09
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