RNA–Protein interactions for RNA: YPR069C

SPE3, Transcript of Spermidine synthase, yeastyeast

Gene SPE3, Length 882 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SPE3YPR069C YJL028WP47062 111 aa4.83□□□□□ -1.64
SPE3YPR069C YGL185CP53100 379 aa4.83□□□□□ -1.64
SPE3YPR069C DAD4P69851 72 aa4.83□□□□□ -1.64
SPE3YPR069C RTC6O14464 93 aa4.82□□□□□ -1.64
SPE3YPR069C HMX1P32339 317 aa4.82□□□□□ -1.64
SPE3YPR069C SPC25P40014 221 aa4.82□□□□□ -1.64
SPE3YPR069C TIM21P53220 239 aa4.82□□□□□ -1.64
SPE3YPR069C ADD37Q03233 198 aa4.82□□□□□ -1.64
SPE3YPR069C YLR042CQ07990 161 aa4.82□□□□□ -1.64
SPE3YPR069C DAD1Q12248 94 aa4.82□□□□□ -1.64
SPE3YPR069C PAU4P53427 120 aa4.81□□□□□ -1.64
SPE3YPR069C RPL12AP0CX53 165 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
SPE3YPR069C RPL12BP0CX54 165 aa4.8□□□□□ -1.64
SPE3YPR069C RPL14AP36105 138 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
SPE3YPR069C RPL14BP38754 138 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
SPE3YPR069C CDC40P40968 455 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
SPE3YPR069C DPP1Q05521 289 aa4.8□□□□□ -1.64
SPE3YPR069C TIM22Q12328 207 aa4.8□□□□□ -1.64
SPE3YPR069C COX19Q3E731 98 aa4.8□□□□□ -1.64
SPE3YPR069C RPL33AP05744 107 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
SPE3YPR069C KTI12P34253 313 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
SPE3YPR069C CYB5P40312 120 aa4.79□□□□□ -1.64
SPE3YPR069C EMC5P40540 141 aa4.79□□□□□ -1.64
SPE3YPR069C RPL33BP41056 107 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
SPE3YPR069C YDL183CP48569 320 aa4.79□□□□□ -1.64
SPE3YPR069C MGA1P53050 456 aa4.79□□□□□ -1.64
SPE3YPR069C ATP19P81451 68 aa4.79□□□□□ -1.64
SPE3YPR069C UPS3Q04006 179 aa4.79□□□□□ -1.64
SPE3YPR069C SME1Q12330 94 aaPredicted RBP4.79□□□□□ -1.64
SPE3YPR069C YPR053CQ6Q5F3 151 aa4.79□□□□□ -1.64
SPE3YPR069C RPS22AP0C0W1 130 aaKnown RBP4.78□□□□□ -1.64
SPE3YPR069C PAU1P0CE88 120 aa4.78□□□□□ -1.64
SPE3YPR069C PAU14P0CE89 120 aa4.78□□□□□ -1.64
SPE3YPR069C PAU6P0CE90 120 aa4.78□□□□□ -1.64
SPE3YPR069C PAU18P0CE91 120 aa4.78□□□□□ -1.64
SPE3YPR069C PAU8P0CE92 120 aa4.78□□□□□ -1.64
SPE3YPR069C PAU11P0CE93 120 aa4.78□□□□□ -1.64
SPE3YPR069C YCR023CP25351 611 aa4.78□□□□□ -1.64
SPE3YPR069C PAU13P38725 120 aa4.78□□□□□ -1.64
SPE3YPR069C POG1P40473 351 aa4.78□□□□□ -1.64
SPE3YPR069C PAU10Q03050 120 aa4.78□□□□□ -1.64
SPE3YPR069C ATG33Q06485 197 aa4.78□□□□□ -1.64
SPE3YPR069C PAU20Q08322 120 aa4.78□□□□□ -1.64
SPE3YPR069C PAU9Q3E770 120 aa4.78□□□□□ -1.64
SPE3YPR069C SHG1P38337 142 aa4.77□□□□□ -1.65
SPE3YPR069C YIL163CP40448 117 aa4.77□□□□□ -1.65
SPE3YPR069C YGR026WP53217 278 aa4.77□□□□□ -1.65
SPE3YPR069C ERI1P62651 68 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
SPE3YPR069C DGA1Q08650 418 aa4.77□□□□□ -1.65
SPE3YPR069C YFR045WP43617 309 aa4.76□□□□□ -1.65
SPE3YPR069C JAC1P53193 184 aa4.76□□□□□ -1.65
SPE3YPR069C DIA1P54005 336 aa4.76□□□□□ -1.65
SPE3YPR069C TIR1P10863 254 aa4.75□□□□□ -1.65
SPE3YPR069C YPT53P36019 220 aa4.75□□□□□ -1.65
SPE3YPR069C SOH1P38633 127 aa4.75□□□□□ -1.65
SPE3YPR069C SUR2P38992 349 aa4.75□□□□□ -1.65
SPE3YPR069C PHO23P50947 330 aa4.75□□□□□ -1.65
SPE3YPR069C YDR115WQ04598 105 aa4.75□□□□□ -1.65
SPE3YPR069C YOR105WQ08504 108 aa4.75□□□□□ -1.65
SPE3YPR069C YPR010C-AA5Z2X5 72 aa4.74□□□□□ -1.65
SPE3YPR069C POF1P25576 258 aa4.74□□□□□ -1.65
SPE3YPR069C FZF1P32805 299 aa4.74□□□□□ -1.65
SPE3YPR069C PGD1P40356 397 aa4.74□□□□□ -1.65
SPE3YPR069C DFM1Q12743 341 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
SPE3YPR069C YMR122W-AQ3E842 84 aa4.74□□□□□ -1.65
SPE3YPR069C MRP10O75012 95 aa4.73□□□□□ -1.65
SPE3YPR069C YDR034C-AP0C289 58 aa4.73□□□□□ -1.65
SPE3YPR069C UBC5P15732 148 aa4.73□□□□□ -1.65
SPE3YPR069C MOG1P47123 218 aa4.73□□□□□ -1.65
SPE3YPR069C DIF1O13577 133 aa4.72□□□□□ -1.65
SPE3YPR069C SEC59P20048 519 aa4.72□□□□□ -1.65
SPE3YPR069C SRP21P32342 167 aa4.72□□□□□ -1.65
SPE3YPR069C YBR013CP38215 129 aa4.72□□□□□ -1.65
SPE3YPR069C YBR090CP38253 122 aa4.72□□□□□ -1.65
SPE3YPR069C TEM1P38987 245 aa4.72□□□□□ -1.65
SPE3YPR069C RRT15Q3E811 62 aa4.72□□□□□ -1.65
SPE3YPR069C PCC1Q3E833 88 aa4.72□□□□□ -1.65
SPE3YPR069C SVP26P38869 228 aa4.71□□□□□ -1.66
SPE3YPR069C PMP3P87284 55 aa4.71□□□□□ -1.66
SPE3YPR069C BET5Q03630 159 aa4.7□□□□□ -1.66
SPE3YPR069C MSK1P32048 576 aa4.69□□□□□ -1.66
SPE3YPR069C MRP49P32388 137 aa4.69□□□□□ -1.66
SPE3YPR069C MIX23P38162 196 aa4.69□□□□□ -1.66
SPE3YPR069C YHR140WP38842 239 aa4.69□□□□□ -1.66
SPE3YPR069C YMR320WQ04897 101 aa4.69□□□□□ -1.66
SPE3YPR069C FCF1Q05498 189 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
SPE3YPR069C MRPL31P14063 131 aaPredicted RBP4.68□□□□□ -1.66
SPE3YPR069C RIB5P38145 238 aa4.68□□□□□ -1.66
SPE3YPR069C SRP14P38985 146 aa4.68□□□□□ -1.66
SPE3YPR069C RPP1AP05318 106 aaPredicted RBP4.67□□□□□ -1.66
SPE3YPR069C FRS1P15624 595 aaKnown RBP4.67□□□□□ -1.66
SPE3YPR069C ARC15P40518 154 aaRIP-Chip data4.67□□□□□ -1.66not detected
SPE3YPR069C GPI19Q04082 140 aa4.67□□□□□ -1.66
SPE3YPR069C GIM5Q04493 163 aa4.67□□□□□ -1.66
SPE3YPR069C DXO1Q06349 442 aa4.67□□□□□ -1.66
SPE3YPR069C YAR023CD6VPM8 179 aa4.66□□□□□ -1.66
SPE3YPR069C RPL27AP0C2H6 136 aaKnown RBP4.66□□□□□ -1.66
SPE3YPR069C ERG28P40030 148 aa4.66□□□□□ -1.66
SPE3YPR069C YIL059CP40520 121 aa4.66□□□□□ -1.66
SPE3YPR069C ARC18Q05933 178 aaKnown RBP4.66□□□□□ -1.66
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