RNA–Protein interactions for RNA: YPL212C

PUS1, Transcript of tRNA:pseudouridine synthase, yeast

Gene PUS1, Length 1,635 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PUS1	YPL212C	UPS3	Q04006	179 aa		4.15	□□□□□ -1.74
PUS1	YPL212C	API2	Q04413	109 aa		4.15	□□□□□ -1.74
PUS1	YPL212C	DPP1	Q05521	289 aa		4.15	□□□□□ -1.74
PUS1	YPL212C	YTH1	Q06102	208 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.74
PUS1	YPL212C	AYT1	Q12226	474 aa		4.15	□□□□□ -1.74
PUS1	YPL212C	SEC11	P15367	167 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PUS1	YPL212C	RPI1	P23250	407 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
PUS1	YPL212C	ADH5	P38113	351 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
PUS1	YPL212C	FYV4	P38783	130 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
PUS1	YPL212C	YML079W	Q03629	201 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PUS1	YPL212C	GTO3	Q04806	366 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PUS1	YPL212C	MSC3	Q05812	728 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PUS1	YPL212C	YDL218W	Q07629	317 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PUS1	YPL212C	MSL5	Q12186	476 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.14	□□□□□ -1.75	not detected
PUS1	YPL212C	DAL80	P26343	269 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PUS1	YPL212C	MIG1	P27705	504 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PUS1	YPL212C	IES6	P32617	166 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PUS1	YPL212C	RPF1	P38805	295 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
PUS1	YPL212C	ECM14	P38836	430 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PUS1	YPL212C	URM1	P40554	99 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
PUS1	YPL212C	BNA1	P47096	177 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PUS1	YPL212C	YGR151C	P53287	111 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PUS1	YPL212C	POP3	P53833	195 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
PUS1	YPL212C	MIX17	Q03667	156 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PUS1	YPL212C	GRH1	Q04410	372 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
PUS1	YPL212C	RXT3	Q07458	294 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PUS1	YPL212C	JID1	Q12350	301 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PUS1	YPL212C	SCS22	Q6Q595	175 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PUS1	YPL212C	YPS1	P32329	569 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PUS1	YPL212C	MRP49	P32388	137 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PUS1	YPL212C	MTR2	P34232	184 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
PUS1	YPL212C	MBB1	P39534	108 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PUS1	YPL212C	YNL200C	P40165	246 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
PUS1	YPL212C	YPI1	P43587	155 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PUS1	YPL212C	YJL163C	P46996	555 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PUS1	YPL212C	BRP1	P53194	125 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PUS1	YPL212C	UBC7	Q02159	165 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PUS1	YPL212C	TIM18	Q08749	192 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PUS1	YPL212C	UTP23	Q12339	254 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
PUS1	YPL212C	HFA1	P32874	2273 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PUS1	YPL212C	RPL27A	P0C2H6	136 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
PUS1	YPL212C	YHR213W	P0CI67	198 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PUS1	YPL212C	RPL12A	P0CX53	165 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
PUS1	YPL212C	RPL12B	P0CX54	165 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PUS1	YPL212C	APS1	P35181	156 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PUS1	YPL212C	YKR070W	P36151	352 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
PUS1	YPL212C	GPI18	P38211	433 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PUS1	YPL212C	MST27	P53176	234 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PUS1	YPL212C	YLR363W-A	Q3E747	85 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PUS1	YPL212C	YIL002W-A	Q3E7Z5	69 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PUS1	YPL212C	PHO85	P17157	305 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PUS1	YPL212C	YKR045C	P36138	183 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PUS1	YPL212C	BET5	Q03630	159 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PUS1	YPL212C	ATO3	Q12359	275 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PUS1	YPL212C	MRPL38	P35996	138 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
PUS1	YPL212C	YMR141C	P40211	102 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PUS1	YPL212C	SWT21	P53873	357 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
PUS1	YPL212C	SUR7	P54003	302 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PUS1	YPL212C	VPS71	Q03433	280 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PUS1	YPL212C	YCL048W-A	Q2V2Q2	79 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PUS1	YPL212C	YLR342W-A	Q3E810	57 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PUS1	YPL212C	RPL27B	P0C2H7	136 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
PUS1	YPL212C	ANB1	P19211	157 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PUS1	YPL212C	PRE1	P22141	198 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
PUS1	YPL212C	ELF1	P36053	145 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PUS1	YPL212C	AIM29	P36154	155 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PUS1	YPL212C	YJL213W	P40896	331 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PUS1	YPL212C	YGL260W	P53056	76 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PUS1	YPL212C	YGR017W	P53210	297 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PUS1	YPL212C	SAL1	D6W196	494 aa		4.09	□□□□□ -1.76
PUS1	YPL212C	RPP2A	P05319	106 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.76
PUS1	YPL212C	YPR170W-B	P0C5R9	85 aa		4.09	□□□□□ -1.76
PUS1	YPL212C	YCR023C	P25351	611 aa		4.09	□□□□□ -1.76
PUS1	YPL212C	YHR140W	P38842	239 aa		4.09	□□□□□ -1.76
PUS1	YPL212C	YER188W	P40103	239 aa		4.09	□□□□□ -1.76
PUS1	YPL212C	NCA3	P46955	337 aa		4.09	□□□□□ -1.76
PUS1	YPL212C	IMP2	P46972	177 aa		4.09	□□□□□ -1.76
PUS1	YPL212C	CAB4	P53332	305 aa		4.09	□□□□□ -1.76
PUS1	YPL212C	YNL234W	P53857	426 aa		4.09	□□□□□ -1.76
PUS1	YPL212C	GPI19	Q04082	140 aa		4.09	□□□□□ -1.76
PUS1	YPL212C	ADH6	Q04894	360 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.76
PUS1	YPL212C	YPL278C	Q08990	100 aa		4.09	□□□□□ -1.76
PUS1	YPL212C	CPT1	P17898	393 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PUS1	YPL212C	YKL044W	P36092	106 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PUS1	YPL212C	YHL044W	P38727	235 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PUS1	YPL212C	SBH2	P52871	88 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PUS1	YPL212C	RPL15B	P54780	204 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
PUS1	YPL212C	YIL014C-A	Q02598	104 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PUS1	YPL212C	ATG39	Q06159	398 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PUS1	YPL212C	FCY1	Q12178	158 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PUS1	YPL212C	CMC1	P36064	111 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PUS1	YPL212C	SNU13	P39990	126 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
PUS1	YPL212C	DIA1	P54005	336 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PUS1	YPL212C	YDR042C	Q03205	200 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PUS1	YPL212C	GEP3	Q08622	556 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PUS1	YPL212C	TIM22	Q12328	207 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PUS1	YPL212C	MBF1	O14467	151 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
PUS1	YPL212C	ADH2	P00331	348 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
PUS1	YPL212C	PAI3	P01094	68 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PUS1	YPL212C	PRY2	P36110	329 aa		4.06	□□□□□ -1.76

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