RNA–Protein interactions for RNA: YJL033W

HCA4, Transcript of DEAD box RNA helicase, yeastyeast

Gene HCA4, Length 2,313 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HCA4YJL033W YBR090CP38253 122 aa3.14□□□□□ -1.91
HCA4YJL033W DER1P38307 211 aa3.14□□□□□ -1.91
HCA4YJL033W YAR068WP39564 161 aa3.14□□□□□ -1.91
HCA4YJL033W YER076CP40049 302 aa3.14□□□□□ -1.91
HCA4YJL033W DFG10P40526 253 aa3.14□□□□□ -1.91
HCA4YJL033W YGR039WP53225 103 aa3.14□□□□□ -1.91
HCA4YJL033W POP3P53833 195 aaPredicted RBP3.14□□□□□ -1.91
HCA4YJL033W SWT21P53873 357 aaPredicted RBP3.14□□□□□ -1.91
HCA4YJL033W SWS2P53937 143 aa3.14□□□□□ -1.91
HCA4YJL033W NCE101Q02820 53 aa3.14□□□□□ -1.91
HCA4YJL033W YMR007WQ03675 126 aa3.14□□□□□ -1.91
HCA4YJL033W RPL12AP0CX53 165 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
HCA4YJL033W RPL12BP0CX54 165 aa3.14□□□□□ -1.91
HCA4YJL033W RFA3P26755 122 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
HCA4YJL033W NHP2P32495 156 aaPredicted RBP3.14□□□□□ -1.91
HCA4YJL033W SNF11P38956 169 aa3.14□□□□□ -1.91
HCA4YJL033W CPD1P53314 239 aa3.14□□□□□ -1.91
HCA4YJL033W BET5Q03630 159 aa3.14□□□□□ -1.91
HCA4YJL033W HNT3Q08702 217 aa3.14□□□□□ -1.91
HCA4YJL033W YRA1Q12159 226 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
HCA4YJL033W HFA1P32874 2273 aa3.13□□□□□ -1.91
HCA4YJL033W CYC3P06182 269 aa3.13□□□□□ -1.91
HCA4YJL033W CPT1P17898 393 aa3.13□□□□□ -1.91
HCA4YJL033W ERV1P27882 189 aa3.13□□□□□ -1.91
HCA4YJL033W YJL118WP47022 219 aa3.13□□□□□ -1.91
HCA4YJL033W YNR048WP53740 393 aa3.13□□□□□ -1.91
HCA4YJL033W YNR064CP53750 290 aa3.13□□□□□ -1.91
HCA4YJL033W WSC2P53832 503 aa3.13□□□□□ -1.91
HCA4YJL033W GIS2P53849 153 aaKnown RBP RIP-Chip data3.13□□□□□ -1.91 RIP-Chip
HCA4YJL033W PAM18Q07914 168 aa3.13□□□□□ -1.91
HCA4YJL033W YOR343CQ12484 108 aa3.13□□□□□ -1.91
HCA4YJL033W CYR1P08678 2026 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
HCA4YJL033W YER039C-AP0CD97 72 aa3.13□□□□□ -1.91
HCA4YJL033W SRP21P32342 167 aa3.13□□□□□ -1.91
HCA4YJL033W YBL059WP34224 193 aa3.13□□□□□ -1.91
HCA4YJL033W YGR269WP40326 108 aa3.13□□□□□ -1.91
HCA4YJL033W EGT2P42835 1041 aa3.13□□□□□ -1.91
HCA4YJL033W YLR296WQ05898 108 aa3.13□□□□□ -1.91
HCA4YJL033W YCL021W-AQ96VH3 125 aa3.13□□□□□ -1.91
HCA4YJL033W FAS1P07149 2051 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
HCA4YJL033W HEM4P06174 275 aa3.12□□□□□ -1.91
HCA4YJL033W CYB5P40312 120 aa3.12□□□□□ -1.91
HCA4YJL033W SDS23P53172 527 aa3.12□□□□□ -1.91
HCA4YJL033W BRP1P53194 125 aa3.12□□□□□ -1.91
HCA4YJL033W YPL264CQ08980 353 aa3.12□□□□□ -1.91
HCA4YJL033W YKL023C-AQ2V2P3 75 aa3.12□□□□□ -1.91
HCA4YJL033W PHO85P17157 305 aa3.11□□□□□ -1.91
HCA4YJL033W FRM2P37261 193 aa3.11□□□□□ -1.91
HCA4YJL033W MST28P39552 234 aa3.11□□□□□ -1.91
HCA4YJL033W ERG28P40030 148 aa3.11□□□□□ -1.91
HCA4YJL033W YIL059CP40520 121 aa3.11□□□□□ -1.91
HCA4YJL033W CWP2P43497 92 aa3.11□□□□□ -1.91
HCA4YJL033W UBC7Q02159 165 aa3.11□□□□□ -1.91
HCA4YJL033W YOR376WQ08900 122 aa3.11□□□□□ -1.91
HCA4YJL033W USB1Q12208 290 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
HCA4YJL033W DSK2P48510 373 aa3.11□□□□□ -1.91
HCA4YJL033W YIP1P53039 248 aa3.11□□□□□ -1.91
HCA4YJL033W MPP6P53725 186 aaPredicted RBP3.11□□□□□ -1.91
HCA4YJL033W MIM1Q08176 113 aa3.11□□□□□ -1.91
HCA4YJL033W YOL118CQ08259 102 aa3.11□□□□□ -1.91
HCA4YJL033W HUG1Q6Q5K6 68 aa3.11□□□□□ -1.91
HCA4YJL033W YAL064W-BO13512 126 aa3.1□□□□□ -1.91
HCA4YJL033W RPL23AP0CX41 137 aaKnown RBP3.1□□□□□ -1.91
HCA4YJL033W RPL23BP0CX42 137 aaKnown RBP3.1□□□□□ -1.91
HCA4YJL033W QRI5P32344 111 aa3.1□□□□□ -1.91
HCA4YJL033W YPI1P43587 155 aa3.1□□□□□ -1.91
HCA4YJL033W MIX14Q04341 121 aa3.1□□□□□ -1.91
HCA4YJL033W RPL27AP0C2H6 136 aaKnown RBP3.1□□□□□ -1.91
HCA4YJL033W RPL27BP0C2H7 136 aaKnown RBP3.1□□□□□ -1.91
HCA4YJL033W MSI1P13712 422 aa3.1□□□□□ -1.91
HCA4YJL033W VMA11P32842 164 aa3.1□□□□□ -1.91
HCA4YJL033W CUP9P41817 306 aa3.1□□□□□ -1.91
HCA4YJL033W YIL014C-AQ02598 104 aa3.1□□□□□ -1.91
HCA4YJL033W MIX17Q03667 156 aa3.1□□□□□ -1.91
HCA4YJL033W HPA2Q06592 156 aa3.1□□□□□ -1.91
HCA4YJL033W YOR292CQ08743 309 aa3.1□□□□□ -1.91
HCA4YJL033W FCY1Q12178 158 aa3.1□□□□□ -1.91
HCA4YJL033W YOR192C-CQ3E736 78 aa3.1□□□□□ -1.91
HCA4YJL033W YHR214C-EQ8TGK0 99 aa3.1□□□□□ -1.91
HCA4YJL033W YMR316C-AI2HB70 103 aa3.09□□□□□ -1.91
HCA4YJL033W YBR121C-AP0C5L4 52 aa3.09□□□□□ -1.91
HCA4YJL033W RPB7P34087 171 aa3.09□□□□□ -1.91
HCA4YJL033W CCS1P40202 249 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
HCA4YJL033W YIL086CP40503 102 aa3.09□□□□□ -1.91
HCA4YJL033W KNH1P50112 268 aa3.09□□□□□ -1.91
HCA4YJL033W GEP7P53171 287 aa3.09□□□□□ -1.91
HCA4YJL033W YDR114CQ04597 100 aa3.09□□□□□ -1.91
HCA4YJL033W RDL2Q08742 149 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
HCA4YJL033W YDL180WQ12301 547 aa3.09□□□□□ -1.91
HCA4YJL033W YAL063C-AQ3E791 96 aa3.09□□□□□ -1.91
HCA4YJL033W YLR365WQ7LIF2 110 aa3.09□□□□□ -1.91
HCA4YJL033W MDM35O60200 86 aa3.09□□□□□ -1.92
HCA4YJL033W RAD6P06104 172 aa3.09□□□□□ -1.92
HCA4YJL033W KRE1P17260 313 aa3.09□□□□□ -1.92
HCA4YJL033W RPA12P32529 125 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.92
HCA4YJL033W SFT2P38166 215 aa3.09□□□□□ -1.92
HCA4YJL033W YFL067WP43537 175 aa3.09□□□□□ -1.92
HCA4YJL033W YGR050CP53231 118 aa3.09□□□□□ -1.92
HCA4YJL033W IRC19Q07843 230 aa3.09□□□□□ -1.92
HCA4YJL033W MSA1Q08471 629 aa3.09□□□□□ -1.92
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