RNA–Protein interactions for RNA: YGR143W

SKN1, Transcript of Protein involved in sphingolipid biosynthesis, yeast

Gene SKN1, Length 2,316 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SKN1	YGR143W	YMC1	P32331	307 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SKN1	YGR143W	YIL169C	P40442	995 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SKN1	YGR143W	YLR296W	Q05898	108 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SKN1	YGR143W	HPA2	Q06592	156 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SKN1	YGR143W	MRH1	Q12117	320 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SKN1	YGR143W	MBB1	P39534	108 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SKN1	YGR143W	TIS11	P47977	285 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SKN1	YGR143W	YDR042C	Q03205	200 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SKN1	YGR143W	GAT3	Q07928	141 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SKN1	YGR143W	RFM1	Q12192	310 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SKN1	YGR143W	YBL081W	P38180	368 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
SKN1	YGR143W	YEL073C	P39974	107 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SKN1	YGR143W	ROT1	Q03691	256 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SKN1	YGR143W	YLR281C	Q05863	155 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SKN1	YGR143W	NUM1	Q00402	2748 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SKN1	YGR143W	CDC39	P25655	2108 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SKN1	YGR143W	AGA2	P32781	87 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SKN1	YGR143W	MRPL27	P36526	146 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SKN1	YGR143W	SMP1	P38128	452 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SKN1	YGR143W	ECM34	P38728	170 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SKN1	YGR143W	YHL018W	P38744	120 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SKN1	YGR143W	YHR140W	P38842	239 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SKN1	YGR143W	VHS2	P40463	436 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SKN1	YGR143W	YFR054C	P43622	192 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SKN1	YGR143W	YGR164W	P53291	111 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SKN1	YGR143W	GPI18	P38211	433 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SKN1	YGR143W	NRM1	P53718	249 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SKN1	YGR143W	IRC25	Q07951	179 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SKN1	YGR143W	COX17	Q12287	69 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SKN1	YGR143W	IGO2	Q9P305	131 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SKN1	YGR143W	YLR302C	O13544	120 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SKN1	YGR143W	YOL162W	P0CF19	215 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SKN1	YGR143W	ERG4	P25340	473 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SKN1	YGR143W	INM1	P38710	295 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SKN1	YGR143W	YAR068W	P39564	161 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SKN1	YGR143W	STP3	Q05937	343 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SKN1	YGR143W	ODC2	Q99297	307 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SKN1	YGR143W	Q0010	Q9ZZX9	128 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SKN1	YGR143W	CPD1	P53314	239 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SKN1	YGR143W	HST4	P53688	370 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SKN1	YGR143W	YMR317W	Q04893	1140 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SKN1	YGR143W	YOR292C	Q08743	309 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SKN1	YGR143W	YDL180W	Q12301	547 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SKN1	YGR143W	DFM1	Q12743	341 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SKN1	YGR143W	YKL023C-A	Q2V2P3	75 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SKN1	YGR143W	HFA1	P32874	2273 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SKN1	YGR143W	TOM6	P33448	61 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SKN1	YGR143W	SVP26	P38869	228 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SKN1	YGR143W	LPP1	Q04396	274 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SKN1	YGR143W	YPR064W	Q12492	139 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SKN1	YGR143W	YRA2	P36036	203 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.87	□□□□□ -1.63	not detected
SKN1	YGR143W	BOL2	P53082	120 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SKN1	YGR143W	MST27	P53176	234 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SKN1	YGR143W	YNR064C	P53750	290 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SKN1	YGR143W	SWT21	P53873	357 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SKN1	YGR143W	YDL242W	Q07746	117 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SKN1	YGR143W	YOR105W	Q08504	108 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SKN1	YGR143W	CUP1-1	P0CX80	61 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SKN1	YGR143W	CUP1-2	P0CX81	61 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SKN1	YGR143W	RPB10	P22139	70 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SKN1	YGR143W	NRG2	P38082	220 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SKN1	YGR143W	ANS1	P38832	159 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SKN1	YGR143W	BUD8	P41698	603 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SKN1	YGR143W	SDS23	P53172	527 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SKN1	YGR143W	DIF1	O13577	133 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SKN1	YGR143W	RPL30	P14120	105 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SKN1	YGR143W	YHL042W	P38729	150 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SKN1	YGR143W	AYT1	Q12226	474 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SKN1	YGR143W	MDH2	P22133	377 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SKN1	YGR143W	SPO13	P23624	291 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SKN1	YGR143W	AUR1	P36107	401 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SKN1	YGR143W	YNL195C	P40168	261 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SKN1	YGR143W	DFG10	P40526	253 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SKN1	YGR143W	GPI2	P46961	280 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SKN1	YGR143W	SYM1	Q06563	197 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SKN1	YGR143W	YIL046W-A	Q3E7Z4	54 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SKN1	YGR143W	BRR2	P32639	2163 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SKN1	YGR143W	OM14	P38325	134 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SKN1	YGR143W	YDR209C	Q03480	137 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SKN1	YGR143W	RPL20A	P0CX23	172 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SKN1	YGR143W	RPL20B	P0CX24	172 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SKN1	YGR143W	REC114	P32841	428 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SKN1	YGR143W	YBL059W	P34224	193 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SKN1	YGR143W	YPT10	P38146	199 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SKN1	YGR143W	BXI1	P48558	297 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SKN1	YGR143W	POP3	P53833	195 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SKN1	YGR143W	YMR175W-A	Q3E766	64 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SKN1	YGR143W	YNL200C	P40165	246 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.64
SKN1	YGR143W	TPC1	P53257	314 aa		4.84	□□□□□ -1.64
SKN1	YGR143W	ATP23	P53722	227 aa		4.84	□□□□□ -1.64
SKN1	YGR143W	MET31	Q03081	177 aa		4.84	□□□□□ -1.64
SKN1	YGR143W	MPD1	Q12404	318 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.64
SKN1	YGR143W	RPS22B	Q3E7Y3	130 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.64
SKN1	YGR143W	SOD1	P00445	154 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SKN1	YGR143W	UBC4	P15731	148 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SKN1	YGR143W	RTG1	P32607	177 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SKN1	YGR143W	VPS55	P47111	140 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SKN1	YGR143W	MIX17	Q03667	156 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SKN1	YGR143W	NPC2	Q12408	173 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SKN1	YGR143W	YLR111W	Q12528	110 aa		4.83	□□□□□ -1.64

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