RNA–Protein interactions for RNA: YGL093W

SPC105, Transcript of Subunit of a kinetochore-microtubule binding complex, yeastyeast

Gene SPC105, Length 2,754 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SPC105YGL093W YDR366CP87287 132 aa3.12□□□□□ -1.91
SPC105YGL093W YOR011W-AQ3E807 68 aa3.12□□□□□ -1.91
SPC105YGL093W YCR075W-AQ3E830 75 aa3.12□□□□□ -1.91
SPC105YGL093W SIM1P40472 476 aa3.12□□□□□ -1.91
SPC105YGL093W DAD4P69851 72 aa3.12□□□□□ -1.91
SPC105YGL093W SRP14P38985 146 aa3.12□□□□□ -1.91
SPC105YGL093W YER135CP40082 130 aa3.12□□□□□ -1.91
SPC105YGL093W YFR035CP43608 114 aa3.12□□□□□ -1.91
SPC105YGL093W YFR045WP43617 309 aa3.12□□□□□ -1.91
SPC105YGL093W TIM22Q12328 207 aa3.12□□□□□ -1.91
SPC105YGL093W MST28P39552 234 aa3.11□□□□□ -1.91
SPC105YGL093W MST27P53176 234 aa3.11□□□□□ -1.91
SPC105YGL093W BRP1P53194 125 aa3.11□□□□□ -1.91
SPC105YGL093W TOM7P53507 60 aa3.11□□□□□ -1.91
SPC105YGL093W POM33Q12164 279 aa3.11□□□□□ -1.91
SPC105YGL093W PRM7Q12459 698 aa3.11□□□□□ -1.91
SPC105YGL093W UTP20P35194 2493 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
SPC105YGL093W PAU7P39545 55 aa3.11□□□□□ -1.91
SPC105YGL093W MIG3P39943 394 aa3.11□□□□□ -1.91
SPC105YGL093W PAU5P43575 122 aa3.11□□□□□ -1.91
SPC105YGL093W KEG1P43614 200 aa3.11□□□□□ -1.91
SPC105YGL093W YGR026WP53217 278 aa3.11□□□□□ -1.91
SPC105YGL093W VAM10Q08474 114 aa3.11□□□□□ -1.91
SPC105YGL093W PAU19P0CE85 124 aa3.1□□□□□ -1.91
SPC105YGL093W PAU21P0CE86 164 aa3.1□□□□□ -1.91
SPC105YGL093W PAU22P0CE87 164 aa3.1□□□□□ -1.91
SPC105YGL093W PAU3P25610 124 aa3.1□□□□□ -1.91
SPC105YGL093W ATG8P38182 117 aaRIP-Chip data3.1□□□□□ -1.91not detected
SPC105YGL093W SIT1P39980 628 aa3.1□□□□□ -1.91
SPC105YGL093W YIL163CP40448 117 aa3.1□□□□□ -1.91
SPC105YGL093W RPS22BQ3E7Y3 130 aaKnown RBP3.1□□□□□ -1.91
SPC105YGL093W GTT1P40582 234 aa3.1□□□□□ -1.91
SPC105YGL093W NAT3Q06504 195 aa3.1□□□□□ -1.91
SPC105YGL093W MRPL31P14063 131 aaPredicted RBP3.09□□□□□ -1.91
SPC105YGL093W NTF2P33331 125 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
SPC105YGL093W VMA21P41806 77 aa3.09□□□□□ -1.91
SPC105YGL093W YML108WQ03759 105 aa3.09□□□□□ -1.91
SPC105YGL093W SCW10Q04951 389 aa3.09□□□□□ -1.91
SPC105YGL093W YGR240C-AQ3E786 66 aa3.09□□□□□ -1.91
SPC105YGL093W YCL001W-BQ96VH2 84 aa3.09□□□□□ -1.91
SPC105YGL093W RPL27AP0C2H6 136 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.92
SPC105YGL093W MIX23P38162 196 aa3.09□□□□□ -1.92
SPC105YGL093W DAN1P47178 298 aa3.09□□□□□ -1.92
SPC105YGL093W TY1A-DR3Q12441 440 aa3.09□□□□□ -1.92
SPC105YGL093W YLR302CO13544 120 aa3.08□□□□□ -1.92
SPC105YGL093W VHS2P40463 436 aa3.08□□□□□ -1.92
SPC105YGL093W DIA1P54005 336 aa3.08□□□□□ -1.92
SPC105YGL093W GPI19Q04082 140 aa3.08□□□□□ -1.92
SPC105YGL093W ARC18Q05933 178 aaKnown RBP3.08□□□□□ -1.92
SPC105YGL093W DYN1P36022 4092 aa3.08□□□□□ -1.92
SPC105YGL093W YHR140WP38842 239 aa3.08□□□□□ -1.92
SPC105YGL093W HIT1P46973 164 aa3.08□□□□□ -1.92
SPC105YGL093W SGF11Q03067 99 aa3.08□□□□□ -1.92
SPC105YGL093W MSC3Q05812 728 aa3.08□□□□□ -1.92
SPC105YGL093W CSM4Q08955 156 aa3.07□□□□□ -1.92
SPC105YGL093W YBR200W-AQ3E755 54 aa3.07□□□□□ -1.92
SPC105YGL093W FRS1P15624 595 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
SPC105YGL093W AGA1P32323 725 aa3.07□□□□□ -1.92
SPC105YGL093W AUA1P32450 94 aa3.07□□□□□ -1.92
SPC105YGL093W RPB11P38902 120 aa3.07□□□□□ -1.92
SPC105YGL093W AIM34Q03673 198 aa3.07□□□□□ -1.92
SPC105YGL093W GTO3Q04806 366 aa3.07□□□□□ -1.92
SPC105YGL093W Q0255P03881 472 aa3.06□□□□□ -1.92
SPC105YGL093W RPL42AP0CX27 106 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
SPC105YGL093W RPL42BP0CX28 106 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
SPC105YGL093W YGL010WP25338 174 aa3.06□□□□□ -1.92
SPC105YGL093W FZF1P32805 299 aa3.06□□□□□ -1.92
SPC105YGL093W YMR141CP40211 102 aa3.06□□□□□ -1.92
SPC105YGL093W YNR034W-AQ3E841 98 aa3.06□□□□□ -1.92
SPC105YGL093W TY1A-HP0C2I4 478 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
SPC105YGL093W TY1A-ORP0CX59 440 aa3.06□□□□□ -1.92
SPC105YGL093W TY1A-PR2P0CX60 440 aa3.06□□□□□ -1.92
SPC105YGL093W TEM1P38987 245 aa3.06□□□□□ -1.92
SPC105YGL093W YPS5P53057 165 aa3.06□□□□□ -1.92
SPC105YGL093W YGR025WP53216 100 aa3.06□□□□□ -1.92
SPC105YGL093W ERI1P62651 68 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
SPC105YGL093W YLR042CQ07990 161 aa3.06□□□□□ -1.92
SPC105YGL093W DUO1P53168 247 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
SPC105YGL093W CMC2Q3E7A4 109 aa3.05□□□□□ -1.92
SPC105YGL093W THG1P53215 237 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
SPC105YGL093W ZRT1P32804 376 aa3.04□□□□□ -1.92
SPC105YGL093W MRPL28P36527 147 aa3.04□□□□□ -1.92
SPC105YGL093W RRT13P40042 185 aa3.04□□□□□ -1.92
SPC105YGL093W SPC1P46965 94 aa3.04□□□□□ -1.92
SPC105YGL093W YGR149WP48236 432 aa3.04□□□□□ -1.92
SPC105YGL093W RPL16BP26785 198 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
SPC105YGL093W MRP49P32388 137 aa3.04□□□□□ -1.92
SPC105YGL093W TVP18Q04767 167 aa3.04□□□□□ -1.92
SPC105YGL093W YPR010C-AA5Z2X5 72 aa3.03□□□□□ -1.92
SPC105YGL093W TY1A-DR4O74302 440 aa3.03□□□□□ -1.92
SPC105YGL093W TY1A-AP0CX57 440 aa3.03□□□□□ -1.92
SPC105YGL093W TY1A-PR1P0CX58 440 aa3.03□□□□□ -1.92
SPC105YGL093W TY1A-DR5P0CX65 440 aa3.03□□□□□ -1.92
SPC105YGL093W TY1A-ER2P0CX66 440 aa3.03□□□□□ -1.92
SPC105YGL093W TY1A-GR3P0CX67 440 aa3.03□□□□□ -1.92
SPC105YGL093W TY1A-LR1P0CX68 440 aa3.03□□□□□ -1.92
SPC105YGL093W TY1A-MR2P0CX69 440 aa3.03□□□□□ -1.92
SPC105YGL093W CUP2P15315 225 aa3.03□□□□□ -1.92
SPC105YGL093W DAD2P36162 133 aa3.03□□□□□ -1.92
SPC105YGL093W YBR090CP38253 122 aa3.03□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 7.9 ms