RNA–Protein interactions for RNA: YFR027W

ECO1, Transcript of Acetyltransferase, yeast

Gene ECO1, Length 846 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ECO1	YFR027W	MST28	P39552	234 aa		2.8	□□□□□ -1.96
ECO1	YFR027W	DSK2	P48510	373 aa		2.8	□□□□□ -1.96
ECO1	YFR027W	COF1	Q03048	143 aa	Known RBP	2.8	□□□□□ -1.96
ECO1	YFR027W	YPL039W	Q03080	316 aa		2.8	□□□□□ -1.96
ECO1	YFR027W	MIX17	Q03667	156 aa		2.8	□□□□□ -1.96
ECO1	YFR027W	FCF1	Q05498	189 aa	Predicted RBP	2.8	□□□□□ -1.96
ECO1	YFR027W	SNT309	Q06091	175 aa	Predicted RBP	2.8	□□□□□ -1.96
ECO1	YFR027W	YOR097C	Q12274	175 aa	Predicted RBP	2.8	□□□□□ -1.96
ECO1	YFR027W	YBL112C	Q3E7Y4	105 aa		2.8	□□□□□ -1.96
ECO1	YFR027W	COA2	Q3E823	68 aa		2.8	□□□□□ -1.96
ECO1	YFR027W	SCS22	Q6Q595	175 aa		2.8	□□□□□ -1.96
ECO1	YFR027W	HTL1	Q9URQ5	78 aa		2.8	□□□□□ -1.96
ECO1	YFR027W	YBL059W	P34224	193 aa		2.79	□□□□□ -1.96
ECO1	YFR027W	YER181C	P40097	107 aa		2.79	□□□□□ -1.96
ECO1	YFR027W	YPL073C	P40323	161 aa		2.79	□□□□□ -1.96
ECO1	YFR027W	BRR6	P53062	197 aa		2.79	□□□□□ -1.96
ECO1	YFR027W	MMS2	P53152	137 aa		2.79	□□□□□ -1.96
ECO1	YFR027W	BRP1	P53194	125 aa		2.79	□□□□□ -1.96
ECO1	YFR027W	CRH1	P53301	507 aa		2.79	□□□□□ -1.96
ECO1	YFR027W	POP3	P53833	195 aa	Predicted RBP	2.79	□□□□□ -1.96
ECO1	YFR027W	SWT21	P53873	357 aa	Predicted RBP	2.79	□□□□□ -1.96
ECO1	YFR027W	YMR103C	Q04436	120 aa		2.79	□□□□□ -1.96
ECO1	YFR027W	RAF1	Q06891	181 aa		2.79	□□□□□ -1.96
ECO1	YFR027W	YOR292C	Q08743	309 aa		2.79	□□□□□ -1.96
ECO1	YFR027W	YNL277W-A	Q3E7Z0	62 aa		2.79	□□□□□ -1.96
ECO1	YFR027W	TRP1	P00912	224 aa		2.78	□□□□□ -1.96
ECO1	YFR027W	QRI5	P32344	111 aa		2.78	□□□□□ -1.96
ECO1	YFR027W	FMP46	P36141	133 aa	Known RBP	2.78	□□□□□ -1.96
ECO1	YFR027W	ECM34	P38728	170 aa		2.78	□□□□□ -1.96
ECO1	YFR027W	YHL042W	P38729	150 aa		2.78	□□□□□ -1.96
ECO1	YFR027W	YHL018W	P38744	120 aa	Predicted RBP	2.78	□□□□□ -1.96
ECO1	YFR027W	SVP26	P38869	228 aa		2.78	□□□□□ -1.96
ECO1	YFR027W	ELO1	P39540	310 aa		2.78	□□□□□ -1.96
ECO1	YFR027W	DFG10	P40526	253 aa		2.78	□□□□□ -1.96
ECO1	YFR027W	KNH1	P50112	268 aa		2.78	□□□□□ -1.96
ECO1	YFR027W	YGL260W	P53056	76 aa		2.78	□□□□□ -1.96
ECO1	YFR027W	CPD1	P53314	239 aa		2.78	□□□□□ -1.96
ECO1	YFR027W	MSO1	P53604	210 aa	Known RBP	2.78	□□□□□ -1.96
ECO1	YFR027W	YLR152C	P54072	576 aa		2.78	□□□□□ -1.96
ECO1	YFR027W	MRX11	Q03079	207 aa		2.78	□□□□□ -1.96
ECO1	YFR027W	PIR3	Q03180	325 aa		2.78	□□□□□ -1.96
ECO1	YFR027W	YOL029C	Q08187	201 aa		2.78	□□□□□ -1.96
ECO1	YFR027W	HNT3	Q08702	217 aa		2.78	□□□□□ -1.96
ECO1	YFR027W	AYT1	Q12226	474 aa		2.78	□□□□□ -1.96
ECO1	YFR027W	YPR011C	Q12251	326 aa		2.78	□□□□□ -1.96
ECO1	YFR027W	YPL229W	Q99395	206 aa		2.78	□□□□□ -1.96
ECO1	YFR027W	PMD1	P32634	1753 aa		2.78	□□□□□ -1.96
ECO1	YFR027W	RPL28	P02406	149 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
ECO1	YFR027W	ERV1	P27882	189 aa		2.77	□□□□□ -1.97
ECO1	YFR027W	PAM17	P36147	197 aa		2.77	□□□□□ -1.97
ECO1	YFR027W	TDA4	P47153	279 aa		2.77	□□□□□ -1.97
ECO1	YFR027W	RHO5	P53879	331 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
ECO1	YFR027W	SPG3	Q04398	127 aa	Predicted RBP	2.77	□□□□□ -1.97
ECO1	YFR027W	YMR320W	Q04897	101 aa		2.77	□□□□□ -1.97
ECO1	YFR027W	SHH4	Q06236	168 aa		2.77	□□□□□ -1.97
ECO1	YFR027W	IRC25	Q07951	179 aa		2.77	□□□□□ -1.97
ECO1	YFR027W	YLR042C	Q07990	161 aa		2.77	□□□□□ -1.97
ECO1	YFR027W	HRT1	Q08273	121 aa		2.77	□□□□□ -1.97
ECO1	YFR027W	YPL038W-A	Q3E7B4	63 aa		2.77	□□□□□ -1.97
ECO1	YFR027W	YMR230W-A	Q3E7B5	62 aa		2.77	□□□□□ -1.97
ECO1	YFR027W	GSC2	P40989	1895 aa		2.77	□□□□□ -1.97
ECO1	YFR027W	YCR050C	P25630	102 aa		2.76	□□□□□ -1.97
ECO1	YFR027W	ERG2	P32352	222 aa		2.76	□□□□□ -1.97
ECO1	YFR027W	APS1	P35181	156 aa		2.76	□□□□□ -1.97
ECO1	YFR027W	SRX1	P36077	127 aa		2.76	□□□□□ -1.97
ECO1	YFR027W	SMP1	P38128	452 aa		2.76	□□□□□ -1.97
ECO1	YFR027W	YNL200C	P40165	246 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
ECO1	YFR027W	MRPL49	P40858	161 aa	Predicted RBP	2.76	□□□□□ -1.97
ECO1	YFR027W	SFT1	P43682	97 aa		2.76	□□□□□ -1.97
ECO1	YFR027W	SKI6	P46948	246 aa	Predicted RBP	2.76	□□□□□ -1.97
ECO1	YFR027W	SDS23	P53172	527 aa		2.76	□□□□□ -1.97
ECO1	YFR027W	HST4	P53688	370 aa		2.76	□□□□□ -1.97
ECO1	YFR027W	ATP19	P81451	68 aa		2.76	□□□□□ -1.97
ECO1	YFR027W	YDL211C	Q12121	372 aa		2.76	□□□□□ -1.97
ECO1	YFR027W	DAD1	Q12248	94 aa		2.76	□□□□□ -1.97
ECO1	YFR027W	CSR2	Q12734	1121 aa		2.76	□□□□□ -1.97
ECO1	YFR027W	YCL021W-A	Q96VH3	125 aa		2.76	□□□□□ -1.97
ECO1	YFR027W	RPL2A	P0CX45	254 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
ECO1	YFR027W	RPL2B	P0CX46	254 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
ECO1	YFR027W	YHR140W	P38842	239 aa		2.75	□□□□□ -1.97
ECO1	YFR027W	LYS1	P38998	373 aa	RIP-Chip data	2.75	□□□□□ -1.97	RIP-Chip
ECO1	YFR027W	YEL073C	P39974	107 aa		2.75	□□□□□ -1.97
ECO1	YFR027W	YGR269W	P40326	108 aa		2.75	□□□□□ -1.97
ECO1	YFR027W	FIP1	P45976	327 aa		2.75	□□□□□ -1.97
ECO1	YFR027W	YNL046W	P53956	172 aa		2.75	□□□□□ -1.97
ECO1	YFR027W	LSM6	Q06406	86 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
ECO1	YFR027W	KSH1	Q8TGJ3	72 aa		2.75	□□□□□ -1.97
ECO1	YFR027W	STT4	P37297	1900 aa		2.74	□□□□□ -1.97
ECO1	YFR027W	Q0255	P03881	472 aa		2.74	□□□□□ -1.97
ECO1	YFR027W	RPS2	P25443	254 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
ECO1	YFR027W	YPS1	P32329	569 aa		2.74	□□□□□ -1.97
ECO1	YFR027W	FZF1	P32805	299 aa		2.74	□□□□□ -1.97
ECO1	YFR027W	GPI18	P38211	433 aa		2.74	□□□□□ -1.97
ECO1	YFR027W	CSH1	P38287	376 aa		2.74	□□□□□ -1.97
ECO1	YFR027W	OM14	P38325	134 aa		2.74	□□□□□ -1.97
ECO1	YFR027W	YPI1	P43587	155 aa		2.74	□□□□□ -1.97
ECO1	YFR027W	YGR219W	P53307	113 aa		2.74	□□□□□ -1.97
ECO1	YFR027W	RSM19	P53733	91 aa	Predicted RBP	2.74	□□□□□ -1.97
ECO1	YFR027W	YIL014C-A	Q02598	104 aa		2.74	□□□□□ -1.97
ECO1	YFR027W	YDR042C	Q03205	200 aa		2.74	□□□□□ -1.97

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