RNA–Protein interactions for RNA: YDR369C

XRS2, Transcript of Protein required for DNA repair, yeast

Gene XRS2, Length 2,565 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
XRS2	YDR369C	CPD1	P53314	239 aa		3.03	□□□□□ -1.93
XRS2	YDR369C	CSL4	P53859	292 aa	Predicted RBP	3.03	□□□□□ -1.93
XRS2	YDR369C	HPF1	Q05164	967 aa		3.03	□□□□□ -1.93
XRS2	YDR369C	RPL28	P02406	149 aa	Known RBP	3.02	□□□□□ -1.93
XRS2	YDR369C	RPL2A	P0CX45	254 aa	Known RBP	3.02	□□□□□ -1.93
XRS2	YDR369C	RPL2B	P0CX46	254 aa	Known RBP	3.02	□□□□□ -1.93
XRS2	YDR369C	YPL073C	P40323	161 aa		3.02	□□□□□ -1.93
XRS2	YDR369C	YJR115W	P47152	169 aa		3.02	□□□□□ -1.93
XRS2	YDR369C	YLR152C	P54072	576 aa		3.02	□□□□□ -1.93
XRS2	YDR369C	SPG3	Q04398	127 aa	Predicted RBP	3.02	□□□□□ -1.93
XRS2	YDR369C	IRC25	Q07951	179 aa		3.02	□□□□□ -1.93
XRS2	YDR369C	DAD1	Q12248	94 aa		3.02	□□□□□ -1.93
XRS2	YDR369C	YPL038W-A	Q3E7B4	63 aa		3.02	□□□□□ -1.93
XRS2	YDR369C	KSH1	Q8TGJ3	72 aa		3.02	□□□□□ -1.93
XRS2	YDR369C	TOM40	P23644	387 aa	Known RBP	3.02	□□□□□ -1.93
XRS2	YDR369C	YCR006C	P25350	157 aa		3.02	□□□□□ -1.93
XRS2	YDR369C	HTL1	Q9URQ5	78 aa		3.02	□□□□□ -1.93
XRS2	YDR369C	REC104	P33323	182 aa		3.01	□□□□□ -1.93
XRS2	YDR369C	GPI18	P38211	433 aa		3.01	□□□□□ -1.93
XRS2	YDR369C	YHR140W	P38842	239 aa		3.01	□□□□□ -1.93
XRS2	YDR369C	SDS23	P53172	527 aa		3.01	□□□□□ -1.93
XRS2	YDR369C	YNR071C	P53757	342 aa		3.01	□□□□□ -1.93
XRS2	YDR369C	ROT1	Q03691	256 aa		3.01	□□□□□ -1.93
XRS2	YDR369C	GPI19	Q04082	140 aa		3.01	□□□□□ -1.93
XRS2	YDR369C	YPR011C	Q12251	326 aa		3.01	□□□□□ -1.93
XRS2	YDR369C	ERG2	P32352	222 aa		3.01	□□□□□ -1.93
XRS2	YDR369C	TVP23	P38962	199 aa		3.01	□□□□□ -1.93
XRS2	YDR369C	YEL073C	P39974	107 aa		3.01	□□□□□ -1.93
XRS2	YDR369C	YGR269W	P40326	108 aa		3.01	□□□□□ -1.93
XRS2	YDR369C	YIR016W	P40572	265 aa		3.01	□□□□□ -1.93
XRS2	YDR369C	SKI6	P46948	246 aa	Predicted RBP	3.01	□□□□□ -1.93
XRS2	YDR369C	MOT3	P54785	490 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
XRS2	YDR369C	HSK3	P69852	69 aa		3.01	□□□□□ -1.93
XRS2	YDR369C	MSA1	Q08471	629 aa		3.01	□□□□□ -1.93
XRS2	YDR369C	Q0255	P03881	472 aa		3	□□□□□ -1.93
XRS2	YDR369C	YPS1	P32329	569 aa		3	□□□□□ -1.93
XRS2	YDR369C	SMP1	P38128	452 aa		3	□□□□□ -1.93
XRS2	YDR369C	OM14	P38325	134 aa		3	□□□□□ -1.93
XRS2	YDR369C	UBC9	P50623	157 aa	Predicted RBP	3	□□□□□ -1.93
XRS2	YDR369C	YIL014C-A	Q02598	104 aa		3	□□□□□ -1.93
XRS2	YDR369C	YHR139C-A	O13536	103 aa		3	□□□□□ -1.93
XRS2	YDR369C	MRS3	P10566	314 aa		3	□□□□□ -1.93
XRS2	YDR369C	FZF1	P32805	299 aa		3	□□□□□ -1.93
XRS2	YDR369C	REC114	P32841	428 aa		3	□□□□□ -1.93
XRS2	YDR369C	CSE2	P33308	149 aa		3	□□□□□ -1.93
XRS2	YDR369C	SRX1	P36077	127 aa		3	□□□□□ -1.93
XRS2	YDR369C	RPS26A	P39938	119 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
XRS2	YDR369C	RPS26B	P39939	119 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
XRS2	YDR369C	YER079W	P40052	210 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
XRS2	YDR369C	FIP1	P45976	327 aa		3	□□□□□ -1.93
XRS2	YDR369C	CIS3	P47001	227 aa		3	□□□□□ -1.93
XRS2	YDR369C	YDR042C	Q03205	200 aa		3	□□□□□ -1.93
XRS2	YDR369C	SHH4	Q06236	168 aa		3	□□□□□ -1.93
XRS2	YDR369C	MCH4	Q08268	501 aa		3	□□□□□ -1.93
XRS2	YDR369C	YPS3	Q12303	508 aa		3	□□□□□ -1.93
XRS2	YDR369C	YMR175W-A	Q3E766	64 aa		3	□□□□□ -1.93
XRS2	YDR369C	YBR126W-A	Q8TGU7	68 aa		3	□□□□□ -1.93
XRS2	YDR369C	VMA3	P25515	160 aa		2.99	□□□□□ -1.93
XRS2	YDR369C	APS1	P35181	156 aa		2.99	□□□□□ -1.93
XRS2	YDR369C	YIL163C	P40448	117 aa		2.99	□□□□□ -1.93
XRS2	YDR369C	LSM6	Q06406	86 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
XRS2	YDR369C	YOR186W	Q08560	144 aa		2.99	□□□□□ -1.93
XRS2	YDR369C	YDL211C	Q12121	372 aa		2.99	□□□□□ -1.93
XRS2	YDR369C	RFA2	P26754	273 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
XRS2	YDR369C	IES6	P32617	166 aa		2.99	□□□□□ -1.93
XRS2	YDR369C	PEX22	P39718	180 aa		2.99	□□□□□ -1.93
XRS2	YDR369C	VPS55	P47111	140 aa		2.99	□□□□□ -1.93
XRS2	YDR369C	YMR007W	Q03675	126 aa		2.99	□□□□□ -1.93
XRS2	YDR369C	MIM1	Q08176	113 aa		2.99	□□□□□ -1.93
XRS2	YDR369C	YMR316C-A	I2HB70	103 aa		2.98	□□□□□ -1.93
XRS2	YDR369C	IMP1	P28627	190 aa		2.98	□□□□□ -1.93
XRS2	YDR369C	CDC1	P40986	491 aa		2.98	□□□□□ -1.93
XRS2	YDR369C	RPL23A	P0CX41	137 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
XRS2	YDR369C	RPL23B	P0CX42	137 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
XRS2	YDR369C	CSH1	P38287	376 aa		2.98	□□□□□ -1.93
XRS2	YDR369C	MBB1	P39534	108 aa		2.98	□□□□□ -1.93
XRS2	YDR369C	YAR029W	P39549	74 aa		2.98	□□□□□ -1.93
XRS2	YDR369C	AQY1	P0CD91	305 aa		2.97	□□□□□ -1.93
XRS2	YDR369C	RPP1	P38786	293 aa		2.97	□□□□□ -1.93
XRS2	YDR369C	YPI1	P43587	155 aa		2.97	□□□□□ -1.93
XRS2	YDR369C	MST27	P53176	234 aa		2.97	□□□□□ -1.93
XRS2	YDR369C	YLR281C	Q05863	155 aa		2.97	□□□□□ -1.93
XRS2	YDR369C	YOL029C	Q08187	201 aa		2.97	□□□□□ -1.93
XRS2	YDR369C	RLM1	Q12224	676 aa		2.97	□□□□□ -1.93
XRS2	YDR369C	UBC4	P15731	148 aa		2.97	□□□□□ -1.93
XRS2	YDR369C	RRT13	P40042	185 aa		2.97	□□□□□ -1.93
XRS2	YDR369C	SGN1	P40561	250 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.97	□□□□□ -1.93	not detected
XRS2	YDR369C	VEL1	P53058	206 aa		2.97	□□□□□ -1.93
XRS2	YDR369C	RSM19	P53733	91 aa	Predicted RBP	2.97	□□□□□ -1.93
XRS2	YDR369C	YNL046W	P53956	172 aa		2.97	□□□□□ -1.93
XRS2	YDR369C	ATP19	P81451	68 aa		2.97	□□□□□ -1.93
XRS2	YDR369C	GAT3	Q07928	141 aa		2.97	□□□□□ -1.93
XRS2	YDR369C	TIM18	Q08749	192 aa		2.97	□□□□□ -1.93
XRS2	YDR369C	RPS21B	Q3E754	87 aa	Known RBP	2.97	□□□□□ -1.93
XRS2	YDR369C	YLR365W	Q7LIF2	110 aa		2.97	□□□□□ -1.93
XRS2	YDR369C	PIS1	P06197	220 aa	Known RBP	2.96	□□□□□ -1.94
XRS2	YDR369C	DAT1	P13483	248 aa	Known RBP	2.96	□□□□□ -1.94
XRS2	YDR369C	RPS2	P25443	254 aa	Known RBP	2.96	□□□□□ -1.94
XRS2	YDR369C	GGC1	P38988	300 aa		2.96	□□□□□ -1.94
XRS2	YDR369C	HAL1	Q01766	294 aa		2.96	□□□□□ -1.94

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