RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636071.2

SCN2A-209, Transcript of sodium voltage-gated channel alpha subunit 2, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 5 BASIC

Gene SCN2A, Length 8,881 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2A-209ENST00000636071 GADL1Q6ZQY3 521 aa6.6□□□□□ -1.35
SCN2A-209ENST00000636071 COMMD9Q9P000 198 aa6.6□□□□□ -1.35
SCN2A-209ENST00000636071 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa6.6□□□□□ -1.35
SCN2A-209ENST00000636071 FAM153AQ9UHL3 310 aa6.6□□□□□ -1.35
SCN2A-209ENST00000636071 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
SCN2A-209ENST00000636071 EXTL3O43909 919 aa6.6□□□□□ -1.35
SCN2A-209ENST00000636071 MFN2O95140 757 aa6.6□□□□□ -1.35
SCN2A-209ENST00000636071 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
SCN2A-209ENST00000636071 OMA1Q96E52 524 aa6.6□□□□□ -1.35
SCN2A-209ENST00000636071 TBCBQ99426 244 aa6.6□□□□□ -1.35
SCN2A-209ENST00000636071 GALNT8Q9NY28 637 aa6.6□□□□□ -1.35
SCN2A-209ENST00000636071 TMEM216Q9P0N5 145 aa6.6□□□□□ -1.35
SCN2A-209ENST00000636071 DCTN4Q9UJW0 460 aa6.6□□□□□ -1.35
SCN2A-209ENST00000636071 DSEQ9UL01 958 aa6.6□□□□□ -1.35
SCN2A-209ENST00000636071 SHROOM2Q13796 1616 aa6.6□□□□□ -1.35
SCN2A-209ENST00000636071 ATP9AO75110 1047 aa6.6□□□□□ -1.35
SCN2A-209ENST00000636071 KRT34O76011 436 aa6.6□□□□□ -1.35
SCN2A-209ENST00000636071 MTMR1Q13613 665 aa6.6□□□□□ -1.35
SCN2A-209ENST00000636071 RSBN1Q5VWQ0 802 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
SCN2A-209ENST00000636071 BHLHB9Q6PI77 547 aa6.6□□□□□ -1.35
SCN2A-209ENST00000636071 PTF1AQ7RTS3 328 aa6.6□□□□□ -1.35
SCN2A-209ENST00000636071 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
SCN2A-209ENST00000636071 ZCCHC7Q8N3Z6 543 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
SCN2A-209ENST00000636071 PDPRQ8NCN5 879 aa6.6□□□□□ -1.35
SCN2A-209ENST00000636071 HIPK4Q8NE63 616 aa6.6□□□□□ -1.35
SCN2A-209ENST00000636071 AP1M1Q9BXS5 423 aa6.6□□□□□ -1.35
SCN2A-209ENST00000636071 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
SCN2A-209ENST00000636071 ACAD9Q9H845 621 aa6.6□□□□□ -1.35
SCN2A-209ENST00000636071 VTA1Q9NP79 307 aa6.6□□□□□ -1.35
SCN2A-209ENST00000636071 CRYL1Q9Y2S2 319 aa6.6□□□□□ -1.35
SCN2A-209ENST00000636071 CDHR2Q9BYE9 1310 aa6.6□□□□□ -1.35
SCN2A-209ENST00000636071 A0A1B0GTH6 734 aa6.6□□□□□ -1.35
SCN2A-209ENST00000636071 ANXA1P04083 346 aa6.6□□□□□ -1.35
SCN2A-209ENST00000636071 PTK7Q13308 1070 aa6.6□□□□□ -1.35
SCN2A-209ENST00000636071 TUBA3CQ13748 450 aa6.6□□□□□ -1.35
SCN2A-209ENST00000636071 GRM4Q14833 912 aa6.6□□□□□ -1.35
SCN2A-209ENST00000636071 YAF2Q8IY57 180 aa6.6□□□□□ -1.35
SCN2A-209ENST00000636071 DEPDC4Q8N2C3 294 aa6.6□□□□□ -1.35
SCN2A-209ENST00000636071 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
SCN2A-209ENST00000636071 ACTRT2Q8TDY3 377 aa6.6□□□□□ -1.35
SCN2A-209ENST00000636071 FNIP1Q8TF40 1166 aa6.6□□□□□ -1.35
SCN2A-209ENST00000636071 LPAR1Q92633 364 aa6.6□□□□□ -1.35
SCN2A-209ENST00000636071 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
SCN2A-209ENST00000636071 NEU2Q9Y3R4 380 aa6.6□□□□□ -1.35
SCN2A-209ENST00000636071 IRAK3Q9Y616 596 aa6.6□□□□□ -1.35
SCN2A-209ENST00000636071 PRMT3O60678 531 aa6.6□□□□□ -1.35
SCN2A-209ENST00000636071 PTPN4P29074 926 aa6.6□□□□□ -1.35
SCN2A-209ENST00000636071 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
SCN2A-209ENST00000636071 FAM189A2Q15884 450 aa6.6□□□□□ -1.35
SCN2A-209ENST00000636071 FIGNQ5HY92 759 aa6.6□□□□□ -1.35
SCN2A-209ENST00000636071 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
SCN2A-209ENST00000636071 HAUS6Q7Z4H7 955 aa6.6□□□□□ -1.35
SCN2A-209ENST00000636071 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
SCN2A-209ENST00000636071 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
SCN2A-209ENST00000636071 RASSF5Q8WWW0 418 aa6.6□□□□□ -1.35
SCN2A-209ENST00000636071 ITGA2P17301 1181 aa6.6□□□□□ -1.35
SCN2A-209ENST00000636071 FASP25445 335 aa6.6□□□□□ -1.35
SCN2A-209ENST00000636071 SARSP49591 514 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
SCN2A-209ENST00000636071 SV2CQ496J9 727 aa6.6□□□□□ -1.35
SCN2A-209ENST00000636071 SAMD4BQ5PRF9 694 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
SCN2A-209ENST00000636071 C12orf60Q5U649 245 aa6.6□□□□□ -1.35
SCN2A-209ENST00000636071 ZNF248Q8NDW4 579 aa6.6□□□□□ -1.35
SCN2A-209ENST00000636071 PAGR1Q9BTK6 254 aa6.6□□□□□ -1.35
SCN2A-209ENST00000636071 MYL10Q9BUA6 226 aa6.6□□□□□ -1.35
SCN2A-209ENST00000636071 FICDQ9BVA6 458 aa6.6□□□□□ -1.35
SCN2A-209ENST00000636071 ZNF302Q9NR11 478 aa6.6□□□□□ -1.35
SCN2A-209ENST00000636071 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa6.6□□□□□ -1.35
SCN2A-209ENST00000636071 APEX2Q9UBZ4 518 aa6.6□□□□□ -1.35
SCN2A-209ENST00000636071 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
SCN2A-209ENST00000636071 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
SCN2A-209ENST00000636071 ACLYP53396 1101 aa6.6□□□□□ -1.35
SCN2A-209ENST00000636071 SLC20A2Q08357 652 aa6.6□□□□□ -1.35
SCN2A-209ENST00000636071 GALNT3Q14435 633 aa6.6□□□□□ -1.35
SCN2A-209ENST00000636071 TCEA2Q15560 299 aa6.6□□□□□ -1.35
SCN2A-209ENST00000636071 INSCQ1MX18 579 aa6.6□□□□□ -1.35
SCN2A-209ENST00000636071 ALG11Q2TAA5 492 aa6.6□□□□□ -1.35
SCN2A-209ENST00000636071 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa6.6□□□□□ -1.35
SCN2A-209ENST00000636071 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
SCN2A-209ENST00000636071 CASP12Q6UXS9 341 aa6.6□□□□□ -1.35
SCN2A-209ENST00000636071 C15orf40Q8WUR7 153 aa6.6□□□□□ -1.35
SCN2A-209ENST00000636071 RORBQ92753 470 aa6.6□□□□□ -1.35
SCN2A-209ENST00000636071 EXT2Q93063 718 aa6.6□□□□□ -1.35
SCN2A-209ENST00000636071 ELMO2Q96JJ3 720 aa6.6□□□□□ -1.35
SCN2A-209ENST00000636071 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
SCN2A-209ENST00000636071 ERP44Q9BS26 406 aa6.6□□□□□ -1.35
SCN2A-209ENST00000636071 KLHL25Q9H0H3 589 aa6.6□□□□□ -1.35
SCN2A-209ENST00000636071 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
SCN2A-209ENST00000636071 GTF3C4Q9UKN8 822 aa6.6□□□□□ -1.35
SCN2A-209ENST00000636071 CLCA2Q9UQC9 943 aa6.6□□□□□ -1.35
SCN2A-209ENST00000636071 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa6.6□□□□□ -1.35
SCN2A-209ENST00000636071 MYO1GB0I1T2 1018 aa6.59□□□□□ -1.35
SCN2A-209ENST00000636071 ZNF862O60290 1169 aa6.59□□□□□ -1.35
SCN2A-209ENST00000636071 LAMC1P11047 1609 aa6.59□□□□□ -1.35
SCN2A-209ENST00000636071 GZMAP12544 262 aa6.59□□□□□ -1.35
SCN2A-209ENST00000636071 COASYQ13057 564 aa6.59□□□□□ -1.35
SCN2A-209ENST00000636071 PLA2G4FQ68DD2 849 aa6.59□□□□□ -1.35
SCN2A-209ENST00000636071 EID3Q8N140 333 aa6.59□□□□□ -1.35
SCN2A-209ENST00000636071 PIGOQ8TEQ8 1089 aa6.59□□□□□ -1.35
SCN2A-209ENST00000636071 ERP27Q96DN0 273 aa6.59□□□□□ -1.35
SCN2A-209ENST00000636071 C7orf25Q9BPX7 421 aa6.59□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.5 ms