RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000596309.5

FCHO1-212, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

TSL 4

Gene FCHO1, Length 598 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-212ENST00000596309 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
FCHO1-212ENST00000596309 MYLPFQ96A32 169 aa20.56■□□□□ 0.88
FCHO1-212ENST00000596309 ELMO3Q96BJ8 720 aa20.56■□□□□ 0.88
FCHO1-212ENST00000596309 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
FCHO1-212ENST00000596309 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
FCHO1-212ENST00000596309 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
FCHO1-212ENST00000596309 ARID3AQ99856 593 aa20.56■□□□□ 0.88
FCHO1-212ENST00000596309 DPEP3Q9H4B8 488 aa20.56■□□□□ 0.88
FCHO1-212ENST00000596309 PIDD1Q9HB75 910 aa20.56■□□□□ 0.88
FCHO1-212ENST00000596309 TMLHEQ9NVH6 421 aa20.56■□□□□ 0.88
FCHO1-212ENST00000596309 EHD2Q9NZN4 543 aa20.56■□□□□ 0.88
FCHO1-212ENST00000596309 ATP2C2O75185 946 aa20.55■□□□□ 0.88
FCHO1-212ENST00000596309 FGF19O95750 216 aa20.55■□□□□ 0.88
FCHO1-212ENST00000596309 PTPN2P17706 415 aa20.55■□□□□ 0.88
FCHO1-212ENST00000596309 ACO1P21399 889 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
FCHO1-212ENST00000596309 RAD23BP54727 409 aa20.55■□□□□ 0.88
FCHO1-212ENST00000596309 CYP27A1Q02318 531 aa20.55■□□□□ 0.88
FCHO1-212ENST00000596309 UBXN1Q04323 297 aa20.55■□□□□ 0.88
FCHO1-212ENST00000596309 TWF1Q12792 350 aa20.55■□□□□ 0.88
FCHO1-212ENST00000596309 STILQ15468 1287 aa20.55■□□□□ 0.88
FCHO1-212ENST00000596309 RRAGAQ7L523 313 aa20.55■□□□□ 0.88
FCHO1-212ENST00000596309 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
FCHO1-212ENST00000596309 SMARCD1Q96GM5 515 aa20.55■□□□□ 0.88
FCHO1-212ENST00000596309 SPATA17Q96L03 361 aa20.55■□□□□ 0.88
FCHO1-212ENST00000596309 C8orf48Q96LL4 319 aa20.55■□□□□ 0.88
FCHO1-212ENST00000596309 ASB2Q96Q27 587 aa20.55■□□□□ 0.88
FCHO1-212ENST00000596309 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
FCHO1-212ENST00000596309 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
FCHO1-212ENST00000596309 PRKAG3Q9UGI9 489 aa20.55■□□□□ 0.88
FCHO1-212ENST00000596309 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
FCHO1-212ENST00000596309 A0A1B0GTH6 734 aa20.54■□□□□ 0.88
FCHO1-212ENST00000596309 HCRTO43612 131 aa20.54■□□□□ 0.88
FCHO1-212ENST00000596309 MICAL2O94851 1124 aa20.54■□□□□ 0.88
FCHO1-212ENST00000596309 SERPINC1P01008 464 aa20.54■□□□□ 0.88
FCHO1-212ENST00000596309 KCNMA1Q12791 1236 aa20.54■□□□□ 0.88
FCHO1-212ENST00000596309 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
FCHO1-212ENST00000596309 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa20.54■□□□□ 0.88
FCHO1-212ENST00000596309 ARHGEF19Q8IW93 802 aa20.54■□□□□ 0.88
FCHO1-212ENST00000596309 SLC4A11Q8NBS3 891 aa20.54■□□□□ 0.88
FCHO1-212ENST00000596309 PSMG2Q969U7 264 aa20.54■□□□□ 0.88
FCHO1-212ENST00000596309 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
FCHO1-212ENST00000596309 KREMEN1Q96MU8 473 aa20.54■□□□□ 0.88
FCHO1-212ENST00000596309 B3GNT5Q9BYG0 378 aa20.54■□□□□ 0.88
FCHO1-212ENST00000596309 CRISPLD1Q9H336 500 aa20.54■□□□□ 0.88
FCHO1-212ENST00000596309 SIX2Q9NPC8 291 aa20.54■□□□□ 0.88
FCHO1-212ENST00000596309 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
FCHO1-212ENST00000596309 PRDM6Q9NQX0 595 aa20.54■□□□□ 0.88
FCHO1-212ENST00000596309 CEP72Q9P209 647 aa20.54■□□□□ 0.88
FCHO1-212ENST00000596309 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa20.54■□□□□ 0.88
FCHO1-212ENST00000596309 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa20.54■□□□□ 0.88
FCHO1-212ENST00000596309 XIRP2A4UGR9 3374 aa20.53■□□□□ 0.88
FCHO1-212ENST00000596309 ZNF197O14709 1029 aa20.53■□□□□ 0.88
FCHO1-212ENST00000596309 CCL16O15467 120 aa20.53■□□□□ 0.88
FCHO1-212ENST00000596309 TPM3P06753 285 aa20.53■□□□□ 0.88
FCHO1-212ENST00000596309 CSH1P0DML2 217 aa20.53■□□□□ 0.88
FCHO1-212ENST00000596309 CSH2P0DML3 217 aa20.53■□□□□ 0.88
FCHO1-212ENST00000596309 VDRP11473 427 aa20.53■□□□□ 0.88
FCHO1-212ENST00000596309 CYP2F1P24903 491 aa20.53■□□□□ 0.88
FCHO1-212ENST00000596309 ANXA13P27216 316 aa20.53■□□□□ 0.88
FCHO1-212ENST00000596309 TFF2Q03403 129 aa20.53■□□□□ 0.88
FCHO1-212ENST00000596309 ARHGAP17Q68EM7 881 aa20.53■□□□□ 0.88
FCHO1-212ENST00000596309 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa20.53■□□□□ 0.88
FCHO1-212ENST00000596309 TMEM270Q6UE05 265 aa20.53■□□□□ 0.88
FCHO1-212ENST00000596309 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP20.53■□□□□ 0.88
FCHO1-212ENST00000596309 CYFIP2Q96F07 1278 aa20.53■□□□□ 0.88
FCHO1-212ENST00000596309 TWNKQ96RR1 684 aa20.53■□□□□ 0.88
FCHO1-212ENST00000596309 HMGXB4Q9UGU5 601 aa20.53■□□□□ 0.88
FCHO1-212ENST00000596309 USTQ9Y2C2 406 aa20.53■□□□□ 0.88
FCHO1-212ENST00000596309 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
FCHO1-212ENST00000596309 PTPRDP23468 1912 aa20.53■□□□□ 0.88
FCHO1-212ENST00000596309 A0A1W2PQC6 194 aa20.52■□□□□ 0.88
FCHO1-212ENST00000596309 UCHL3P15374 230 aa20.52■□□□□ 0.88
FCHO1-212ENST00000596309 BDNFP23560 247 aa20.52■□□□□ 0.88
FCHO1-212ENST00000596309 GRIK1P39086 918 aa20.52■□□□□ 0.88
FCHO1-212ENST00000596309 ZNF132P52740 706 aa20.52■□□□□ 0.88
FCHO1-212ENST00000596309 EPHA5P54756 1037 aa20.52■□□□□ 0.88
FCHO1-212ENST00000596309 SLC8A3P57103 927 aa20.52■□□□□ 0.88
FCHO1-212ENST00000596309 BPIFB4P59827 614 aa20.52■□□□□ 0.88
FCHO1-212ENST00000596309 CLUL1Q15846 466 aa20.52■□□□□ 0.88
FCHO1-212ENST00000596309 SGO2Q562F6 1265 aa20.52■□□□□ 0.88
FCHO1-212ENST00000596309 FUKQ8N0W3 1084 aa20.52■□□□□ 0.88
FCHO1-212ENST00000596309 SHC3Q92529 594 aa20.52■□□□□ 0.88
FCHO1-212ENST00000596309 MED10Q9BTT4 135 aa20.52■□□□□ 0.88
FCHO1-212ENST00000596309 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
FCHO1-212ENST00000596309 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
FCHO1-212ENST00000596309 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa20.52■□□□□ 0.88
FCHO1-212ENST00000596309 PNPLA8Q9NP80 782 aa20.52■□□□□ 0.88
FCHO1-212ENST00000596309 COMMD8Q9NX08 183 aa20.52■□□□□ 0.88
FCHO1-212ENST00000596309 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
FCHO1-212ENST00000596309 ZMYM5Q9UJ78 669 aa20.52■□□□□ 0.88
FCHO1-212ENST00000596309 DNAJC12Q9UKB3 198 aa20.52■□□□□ 0.88
FCHO1-212ENST00000596309 SIK3Q9Y2K2 1263 aa20.52■□□□□ 0.88
FCHO1-212ENST00000596309 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
FCHO1-212ENST00000596309 FAM200BP0CF97 657 aa20.51■□□□□ 0.87
FCHO1-212ENST00000596309 FANCCQ00597 558 aa20.51■□□□□ 0.87
FCHO1-212ENST00000596309 NR1I3Q14994 352 aa20.51■□□□□ 0.87
FCHO1-212ENST00000596309 TAF12Q16514 161 aa20.51■□□□□ 0.87
FCHO1-212ENST00000596309 MEA1Q16626 185 aa20.51■□□□□ 0.87
FCHO1-212ENST00000596309 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
FCHO1-212ENST00000596309 ZNF394Q53GI3 561 aa20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.8 ms