RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586900.1

PKN1-208, Transcript of protein kinase N1, human

TSL 3

Gene PKN1, Length 550 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PKN1-208	ENST00000586900	SHC3	Q92529	594 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PKN1-208	ENST00000586900	HNRNPAB	Q99729	332 aa	Known RBP	13.11	□□□□□ -0.31
PKN1-208	ENST00000586900	LSM14B	Q9BX40	385 aa	Known RBP	13.11	□□□□□ -0.31
PKN1-208	ENST00000586900	NAA15	Q9BXJ9	866 aa	Known RBP	13.11	□□□□□ -0.31
PKN1-208	ENST00000586900	ABI2	Q9NYB9	513 aa	Predicted RBP	13.11	□□□□□ -0.31
PKN1-208	ENST00000586900	CEP72	Q9P209	647 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PKN1-208	ENST00000586900	THEG	Q9P2T0	379 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PKN1-208	ENST00000586900	DNAJC12	Q9UKB3	198 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PKN1-208	ENST00000586900	YIPF1	Q9Y548	306 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PKN1-208	ENST00000586900	ASB3	Q9Y575	518 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PKN1-208	ENST00000586900	PCDHB4	Q9Y5E5	795 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PKN1-208	ENST00000586900	ATP8B3	O60423	1300 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PKN1-208	ENST00000586900	TEX33	O43247	280 aa		13.1	□□□□□ -0.31
PKN1-208	ENST00000586900	NOL4	O94818	638 aa		13.1	□□□□□ -0.31
PKN1-208	ENST00000586900	VDR	P11473	427 aa		13.1	□□□□□ -0.31
PKN1-208	ENST00000586900	RPL10A	P62906	217 aa	Known RBP	13.1	□□□□□ -0.31
PKN1-208	ENST00000586900	CYP27A1	Q02318	531 aa		13.1	□□□□□ -0.31
PKN1-208	ENST00000586900	APBA1	Q02410	837 aa		13.1	□□□□□ -0.31
PKN1-208	ENST00000586900	SMAD4	Q13485	552 aa	Known RBP	13.1	□□□□□ -0.31
PKN1-208	ENST00000586900	CCDC142	Q17RM4	750 aa		13.1	□□□□□ -0.31
PKN1-208	ENST00000586900	AAK1	Q2M2I8	961 aa		13.1	□□□□□ -0.31
PKN1-208	ENST00000586900	ZNF394	Q53GI3	561 aa		13.1	□□□□□ -0.31
PKN1-208	ENST00000586900	RARS2	Q5T160	578 aa	Known RBP	13.1	□□□□□ -0.31
PKN1-208	ENST00000586900	ARHGAP17	Q68EM7	881 aa		13.1	□□□□□ -0.31
PKN1-208	ENST00000586900	IQCE	Q6IPM2	695 aa		13.1	□□□□□ -0.31
PKN1-208	ENST00000586900	GJB7	Q6PEY0	223 aa		13.1	□□□□□ -0.31
PKN1-208	ENST00000586900	PAQR9	Q6ZVX9	377 aa		13.1	□□□□□ -0.31
PKN1-208	ENST00000586900	C12orf76	Q8N812	135 aa	Predicted RBP	13.1	□□□□□ -0.31
PKN1-208	ENST00000586900	C12orf29	Q8N999	325 aa		13.1	□□□□□ -0.31
PKN1-208	ENST00000586900	NEK11	Q8NG66	645 aa		13.1	□□□□□ -0.31
PKN1-208	ENST00000586900	ZNF707	Q96C28	371 aa	Predicted RBP	13.1	□□□□□ -0.31
PKN1-208	ENST00000586900	CYFIP2	Q96F07	1278 aa		13.1	□□□□□ -0.31
PKN1-208	ENST00000586900	HEXIM2	Q96MH2	286 aa	Known RBP	13.1	□□□□□ -0.31
PKN1-208	ENST00000586900	RIPOR3	Q96MK2	946 aa		13.1	□□□□□ -0.31
PKN1-208	ENST00000586900	B3GNT5	Q9BYG0	378 aa		13.1	□□□□□ -0.31
PKN1-208	ENST00000586900	STK33	Q9BYT3	514 aa		13.1	□□□□□ -0.31
PKN1-208	ENST00000586900	GAN	Q9H2C0	597 aa		13.1	□□□□□ -0.31
PKN1-208	ENST00000586900	SLC27A5	Q9Y2P5	690 aa		13.1	□□□□□ -0.31
PKN1-208	ENST00000586900		H3BQ06	376 aa	Predicted RBP	13.09	□□□□□ -0.31
PKN1-208	ENST00000586900	RNF225	M0QZC1	329 aa	Predicted RBP	13.09	□□□□□ -0.31
PKN1-208	ENST00000586900	CBFA2T2	O43439	604 aa		13.09	□□□□□ -0.31
PKN1-208	ENST00000586900	MBTPS2	O43462	519 aa		13.09	□□□□□ -0.31
PKN1-208	ENST00000586900	TPM3	P06753	285 aa		13.09	□□□□□ -0.31
PKN1-208	ENST00000586900	BDNF	P23560	247 aa		13.09	□□□□□ -0.31
PKN1-208	ENST00000586900	CYP2F1	P24903	491 aa		13.09	□□□□□ -0.31
PKN1-208	ENST00000586900	MTHFR	P42898	656 aa		13.09	□□□□□ -0.31
PKN1-208	ENST00000586900	EPHB3	P54753	998 aa		13.09	□□□□□ -0.31
PKN1-208	ENST00000586900	TWF1	Q12792	350 aa		13.09	□□□□□ -0.31
PKN1-208	ENST00000586900	ORC1	Q13415	861 aa		13.09	□□□□□ -0.31
PKN1-208	ENST00000586900	STIL	Q15468	1287 aa		13.09	□□□□□ -0.31
PKN1-208	ENST00000586900	ARHGAP44	Q17R89	818 aa		13.09	□□□□□ -0.31
PKN1-208	ENST00000586900	MGAT5B	Q3V5L5	792 aa		13.09	□□□□□ -0.31
PKN1-208	ENST00000586900	SGO2	Q562F6	1265 aa		13.09	□□□□□ -0.31
PKN1-208	ENST00000586900	ATAT1	Q5SQI0	421 aa		13.09	□□□□□ -0.31
PKN1-208	ENST00000586900	TMC5	Q6UXY8	1006 aa		13.09	□□□□□ -0.31
PKN1-208	ENST00000586900	ITIH5	Q86UX2	942 aa		13.09	□□□□□ -0.31
PKN1-208	ENST00000586900	FAM35A	Q86V20	835 aa		13.09	□□□□□ -0.31
PKN1-208	ENST00000586900	FUK	Q8N0W3	1084 aa		13.09	□□□□□ -0.31
PKN1-208	ENST00000586900	ELMOD1	Q8N336	334 aa		13.09	□□□□□ -0.31
PKN1-208	ENST00000586900	TTC9B	Q8N6N2	239 aa		13.09	□□□□□ -0.31
PKN1-208	ENST00000586900	RBBP8NL	Q8NC74	664 aa	Predicted RBP	13.09	□□□□□ -0.31
PKN1-208	ENST00000586900	GADD45GIP1	Q8TAE8	222 aa	Predicted RBP	13.09	□□□□□ -0.31
PKN1-208	ENST00000586900	ATXN2L	Q8WWM7	1075 aa	Known RBP	13.09	□□□□□ -0.31
PKN1-208	ENST00000586900	SUSD6	Q92537	303 aa		13.09	□□□□□ -0.31
PKN1-208	ENST00000586900	SMG7	Q92540	1137 aa	Known RBP	13.09	□□□□□ -0.31
PKN1-208	ENST00000586900	SPATA17	Q96L03	361 aa		13.09	□□□□□ -0.31
PKN1-208	ENST00000586900	C8orf48	Q96LL4	319 aa		13.09	□□□□□ -0.31
PKN1-208	ENST00000586900	PCMTD1	Q96MG8	357 aa	Predicted RBP	13.09	□□□□□ -0.31
PKN1-208	ENST00000586900	NECTIN4	Q96NY8	510 aa		13.09	□□□□□ -0.31
PKN1-208	ENST00000586900	SEPT5	Q99719	369 aa	Predicted RBP	13.09	□□□□□ -0.31
PKN1-208	ENST00000586900	LPIN3	Q9BQK8	851 aa		13.09	□□□□□ -0.31
PKN1-208	ENST00000586900	AVEN	Q9NQS1	362 aa	Predicted RBP	13.09	□□□□□ -0.31
PKN1-208	ENST00000586900	PRDM6	Q9NQX0	595 aa		13.09	□□□□□ -0.31
PKN1-208	ENST00000586900	FAM50B	Q9Y247	325 aa		13.09	□□□□□ -0.31
PKN1-208	ENST00000586900	FHOD1	Q9Y613	1164 aa		13.09	□□□□□ -0.31
PKN1-208	ENST00000586900	REV3L	O60673	3130 aa		13.08	□□□□□ -0.32
PKN1-208	ENST00000586900	FOXN3	O00409	490 aa	Predicted RBP	13.08	□□□□□ -0.32
PKN1-208	ENST00000586900	TRIM66	O15016	1216 aa		13.08	□□□□□ -0.32
PKN1-208	ENST00000586900	CCDC130	P13994	396 aa		13.08	□□□□□ -0.32
PKN1-208	ENST00000586900	PTPN2	P17706	415 aa		13.08	□□□□□ -0.32
PKN1-208	ENST00000586900	ATF6	P18850	670 aa		13.08	□□□□□ -0.32
PKN1-208	ENST00000586900	PBX1	P40424	430 aa		13.08	□□□□□ -0.32
PKN1-208	ENST00000586900	KLK7	P49862	253 aa		13.08	□□□□□ -0.32
PKN1-208	ENST00000586900	DRAP1	Q14919	205 aa	Predicted RBP	13.08	□□□□□ -0.32
PKN1-208	ENST00000586900	CNGA2	Q16280	664 aa		13.08	□□□□□ -0.32
PKN1-208	ENST00000586900	MEA1	Q16626	185 aa		13.08	□□□□□ -0.32
PKN1-208	ENST00000586900	PPP1R26	Q5T8A7	1209 aa	Predicted RBP	13.08	□□□□□ -0.32
PKN1-208	ENST00000586900	SARM1	Q6SZW1	724 aa		13.08	□□□□□ -0.32
PKN1-208	ENST00000586900	GAS2L3	Q86XJ1	694 aa		13.08	□□□□□ -0.32
PKN1-208	ENST00000586900	FAM71A	Q8IYT1	594 aa		13.08	□□□□□ -0.32
PKN1-208	ENST00000586900	LEMD2	Q8NC56	503 aa		13.08	□□□□□ -0.32
PKN1-208	ENST00000586900	SLC2A14	Q8TDB8	520 aa		13.08	□□□□□ -0.32
PKN1-208	ENST00000586900	PSMG2	Q969U7	264 aa		13.08	□□□□□ -0.32
PKN1-208	ENST00000586900	SMARCD1	Q96GM5	515 aa		13.08	□□□□□ -0.32
PKN1-208	ENST00000586900	ZNF512	Q96ME7	567 aa	Predicted RBP	13.08	□□□□□ -0.32
PKN1-208	ENST00000586900	MED10	Q9BTT4	135 aa		13.08	□□□□□ -0.32
PKN1-208	ENST00000586900	EDEM3	Q9BZQ6	932 aa		13.08	□□□□□ -0.32
PKN1-208	ENST00000586900	ZNF518B	Q9C0D4	1074 aa		13.08	□□□□□ -0.32
PKN1-208	ENST00000586900	GPR88	Q9GZN0	384 aa		13.08	□□□□□ -0.32
PKN1-208	ENST00000586900	RBSN	Q9H1K0	784 aa		13.08	□□□□□ -0.32

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