RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000581080.1

RARA-AS1-201, RARA antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene RARA-AS1, Length 1,790 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARA-AS1-201ENST00000581080 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
RARA-AS1-201ENST00000581080 PTPRSQ13332 1948 aa24.75■■□□□ 1.55
RARA-AS1-201ENST00000581080 MYBPHLA2RUH7 354 aa24.75■■□□□ 1.55
RARA-AS1-201ENST00000581080 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
RARA-AS1-201ENST00000581080 RRM1P23921 792 aa24.75■■□□□ 1.55
RARA-AS1-201ENST00000581080 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
RARA-AS1-201ENST00000581080 MDH1BQ5I0G3 518 aa24.75■■□□□ 1.55
RARA-AS1-201ENST00000581080 FUKQ8N0W3 1084 aa24.75■■□□□ 1.55
RARA-AS1-201ENST00000581080 SLC35F6Q8N357 371 aa24.75■■□□□ 1.55
RARA-AS1-201ENST00000581080 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa24.75■■□□□ 1.55
RARA-AS1-201ENST00000581080 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
RARA-AS1-201ENST00000581080 FANCGO15287 622 aa24.75■■□□□ 1.55
RARA-AS1-201ENST00000581080 CALB1P05937 261 aa24.75■■□□□ 1.55
RARA-AS1-201ENST00000581080 FGFR3P22607 806 aa24.75■■□□□ 1.55
RARA-AS1-201ENST00000581080 ADORA2BP29275 332 aa24.75■■□□□ 1.55
RARA-AS1-201ENST00000581080 CCDC142Q17RM4 750 aa24.75■■□□□ 1.55
RARA-AS1-201ENST00000581080 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
RARA-AS1-201ENST00000581080 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
RARA-AS1-201ENST00000581080 FAM171BQ6P995 826 aa24.75■■□□□ 1.55
RARA-AS1-201ENST00000581080 KCNT2Q6UVM3 1135 aa24.75■■□□□ 1.55
RARA-AS1-201ENST00000581080 OR10T2Q8NGX3 314 aa24.75■■□□□ 1.55
RARA-AS1-201ENST00000581080 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
RARA-AS1-201ENST00000581080 SLC35F5Q8WV83 523 aa24.75■■□□□ 1.55
RARA-AS1-201ENST00000581080 ZNF592Q92610 1267 aa24.75■■□□□ 1.55
RARA-AS1-201ENST00000581080 PCED1BQ96HM7 432 aa24.75■■□□□ 1.55
RARA-AS1-201ENST00000581080 ALS2CR12Q96Q35 445 aa24.75■■□□□ 1.55
RARA-AS1-201ENST00000581080 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa24.75■■□□□ 1.55
RARA-AS1-201ENST00000581080 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
RARA-AS1-201ENST00000581080 COG5Q9UP83 839 aa24.75■■□□□ 1.55
RARA-AS1-201ENST00000581080 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa24.75■■□□□ 1.55
RARA-AS1-201ENST00000581080 HADHBP55084 474 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
RARA-AS1-201ENST00000581080 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
RARA-AS1-201ENST00000581080 PLCB3Q01970 1234 aa24.74■■□□□ 1.55
RARA-AS1-201ENST00000581080 PDCLQ13371 301 aa24.74■■□□□ 1.55
RARA-AS1-201ENST00000581080 PTPN20Q4JDL3 420 aa24.74■■□□□ 1.55
RARA-AS1-201ENST00000581080 LIN9Q5TKA1 542 aa24.74■■□□□ 1.55
RARA-AS1-201ENST00000581080 PAQR9Q6ZVX9 377 aa24.74■■□□□ 1.55
RARA-AS1-201ENST00000581080 CEP57Q86XR8 500 aa24.74■■□□□ 1.55
RARA-AS1-201ENST00000581080 IGSF21Q96ID5 467 aa24.74■■□□□ 1.55
RARA-AS1-201ENST00000581080 CPXM1Q96SM3 734 aa24.74■■□□□ 1.55
RARA-AS1-201ENST00000581080 UVRAGQ9P2Y5 699 aa24.74■■□□□ 1.55
RARA-AS1-201ENST00000581080 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
RARA-AS1-201ENST00000581080 EFEMP2O95967 443 aa24.73■■□□□ 1.55
RARA-AS1-201ENST00000581080 SETSIPP0DME0 302 aa24.73■■□□□ 1.55
RARA-AS1-201ENST00000581080 BCAT1P54687 386 aa24.73■■□□□ 1.55
RARA-AS1-201ENST00000581080 BST2Q10589 180 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
RARA-AS1-201ENST00000581080 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
RARA-AS1-201ENST00000581080 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
RARA-AS1-201ENST00000581080 TPCN2Q8NHX9 752 aa24.73■■□□□ 1.55
RARA-AS1-201ENST00000581080 KIF18AQ8NI77 898 aa24.73■■□□□ 1.55
RARA-AS1-201ENST00000581080 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
RARA-AS1-201ENST00000581080 PKMYT1Q99640 499 aa24.73■■□□□ 1.55
RARA-AS1-201ENST00000581080 B3GNT5Q9BYG0 378 aa24.73■■□□□ 1.55
RARA-AS1-201ENST00000581080 MYH10P35580 1976 aa24.73■■□□□ 1.55
RARA-AS1-201ENST00000581080 CARNS1A5YM72 827 aa24.72■■□□□ 1.55
RARA-AS1-201ENST00000581080 MTA2O94776 668 aa24.72■■□□□ 1.55
RARA-AS1-201ENST00000581080 LAG3P18627 525 aa24.72■■□□□ 1.55
RARA-AS1-201ENST00000581080 PDE4CQ08493 712 aa24.72■■□□□ 1.55
RARA-AS1-201ENST00000581080 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
RARA-AS1-201ENST00000581080 MSANTD4Q8NCY6 345 aa24.72■■□□□ 1.55
RARA-AS1-201ENST00000581080 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa24.72■■□□□ 1.55
RARA-AS1-201ENST00000581080 STK32AQ8WU08 396 aa24.72■■□□□ 1.55
RARA-AS1-201ENST00000581080 C18orf8Q96DM3 657 aa24.72■■□□□ 1.55
RARA-AS1-201ENST00000581080 ZNF558Q96NG5 402 aa24.72■■□□□ 1.55
RARA-AS1-201ENST00000581080 NUP85Q9BW27 656 aa24.72■■□□□ 1.55
RARA-AS1-201ENST00000581080 STRIP2Q9ULQ0 834 aa24.72■■□□□ 1.55
RARA-AS1-201ENST00000581080 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa24.72■■□□□ 1.55
RARA-AS1-201ENST00000581080 VWA8A3KMH1 1905 aa24.72■■□□□ 1.55
RARA-AS1-201ENST00000581080 CLDN5O00501 218 aa24.72■■□□□ 1.55
RARA-AS1-201ENST00000581080 CASQ1P31415 396 aa24.72■■□□□ 1.55
RARA-AS1-201ENST00000581080 GABRB2P47870 512 aa24.72■■□□□ 1.55
RARA-AS1-201ENST00000581080 TSPY1Q01534 308 aa24.72■■□□□ 1.55
RARA-AS1-201ENST00000581080 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
RARA-AS1-201ENST00000581080 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa24.72■■□□□ 1.55
RARA-AS1-201ENST00000581080 PMF1Q6P1K2 205 aa24.72■■□□□ 1.55
RARA-AS1-201ENST00000581080 LRRTM3Q86VH5 581 aa24.72■■□□□ 1.55
RARA-AS1-201ENST00000581080 TMEM209Q96SK2 561 aa24.72■■□□□ 1.55
RARA-AS1-201ENST00000581080 SLC9A7Q96T83 725 aa24.72■■□□□ 1.55
RARA-AS1-201ENST00000581080 DUSP16Q9BY84 665 aa24.72■■□□□ 1.55
RARA-AS1-201ENST00000581080 INSL6Q9Y581 213 aa24.72■■□□□ 1.55
RARA-AS1-201ENST00000581080 GRID2IPA4D2P6 1211 aa24.71■■□□□ 1.55
RARA-AS1-201ENST00000581080 TULP2O00295 520 aa24.71■■□□□ 1.55
RARA-AS1-201ENST00000581080 PALMO75781 387 aa24.71■■□□□ 1.55
RARA-AS1-201ENST00000581080 CAPN15O75808 1086 aa24.71■■□□□ 1.55
RARA-AS1-201ENST00000581080 MAMLD1Q13495 774 aa24.71■■□□□ 1.55
RARA-AS1-201ENST00000581080 LLGL2Q6P1M3 1020 aa24.71■■□□□ 1.55
RARA-AS1-201ENST00000581080 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa24.71■■□□□ 1.55
RARA-AS1-201ENST00000581080 B3GALT6Q96L58 329 aa24.71■■□□□ 1.55
RARA-AS1-201ENST00000581080 ZBED2Q9BTP6 218 aa24.71■■□□□ 1.55
RARA-AS1-201ENST00000581080 MED10Q9BTT4 135 aa24.71■■□□□ 1.55
RARA-AS1-201ENST00000581080 SYNCQ9H7C4 482 aa24.71■■□□□ 1.55
RARA-AS1-201ENST00000581080 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
RARA-AS1-201ENST00000581080 ST7Q9NRC1 585 aa24.71■■□□□ 1.55
RARA-AS1-201ENST00000581080 SLC8A3P57103 927 aa24.7■■□□□ 1.55
RARA-AS1-201ENST00000581080 TAS1R1Q7RTX1 841 aa24.7■■□□□ 1.55
RARA-AS1-201ENST00000581080 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.55
RARA-AS1-201ENST00000581080 SLC39A11Q8N1S5 342 aa24.7■■□□□ 1.55
RARA-AS1-201ENST00000581080 LRRC57Q8N9N7 239 aa24.7■■□□□ 1.55
RARA-AS1-201ENST00000581080 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa24.7■■□□□ 1.55
RARA-AS1-201ENST00000581080 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.8 ms