RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564105.5

CTU2-204, Transcript of cytosolic thiouridylase subunit 2, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CTU2, Length 1,586 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU2-204ENST00000564105 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
CTU2-204ENST00000564105 PKMYT1Q99640 499 aa20.34■□□□□ 0.85
CTU2-204ENST00000564105 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP20.34■□□□□ 0.85
CTU2-204ENST00000564105 ZNF576Q9H609 170 aa20.34■□□□□ 0.85
CTU2-204ENST00000564105 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
CTU2-204ENST00000564105 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa20.34■□□□□ 0.85
CTU2-204ENST00000564105 CDY1Q9Y6F8 540 aa20.34■□□□□ 0.85
CTU2-204ENST00000564105 REV3LO60673 3130 aa20.33■□□□□ 0.85
CTU2-204ENST00000564105 SOWAHDA6NJG2 315 aa20.33■□□□□ 0.84
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CTU2-204ENST00000564105 O00370 1275 aa20.33■□□□□ 0.84
CTU2-204ENST00000564105 DLL1O00548 723 aa20.33■□□□□ 0.84
CTU2-204ENST00000564105 CFHP08603 1231 aa20.33■□□□□ 0.84
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CTU2-204ENST00000564105 CA8P35219 290 aa20.33■□□□□ 0.84
CTU2-204ENST00000564105 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.84
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CTU2-204ENST00000564105 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.84
CTU2-204ENST00000564105 PCED1BQ96HM7 432 aa20.33■□□□□ 0.84
CTU2-204ENST00000564105 KCNF1Q9H3M0 494 aa20.33■□□□□ 0.84
CTU2-204ENST00000564105 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa20.33■□□□□ 0.84
CTU2-204ENST00000564105 TLR9Q9NR96 1032 aa20.33■□□□□ 0.84
CTU2-204ENST00000564105 TMLHEQ9NVH6 421 aa20.33■□□□□ 0.84
CTU2-204ENST00000564105 TSPAN16Q9UKR8 245 aa20.33■□□□□ 0.84
CTU2-204ENST00000564105 PCDHGC3Q9UN70 934 aa20.33■□□□□ 0.84
CTU2-204ENST00000564105 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP20.33■□□□□ 0.84
CTU2-204ENST00000564105 GRM6O15303 877 aa20.32■□□□□ 0.84
CTU2-204ENST00000564105 AKR1B10O60218 316 aa20.32■□□□□ 0.84
CTU2-204ENST00000564105 CPB1P15086 417 aa20.32■□□□□ 0.84
CTU2-204ENST00000564105 DNAJB1P25685 340 aa20.32■□□□□ 0.84
CTU2-204ENST00000564105 ADORA2BP29275 332 aa20.32■□□□□ 0.84
CTU2-204ENST00000564105 CDR1P51861 262 aa20.32■□□□□ 0.84
CTU2-204ENST00000564105 ARPP19P56211 112 aa20.32■□□□□ 0.84
CTU2-204ENST00000564105 ERVFC1P60507 584 aa20.32■□□□□ 0.84
CTU2-204ENST00000564105 CYP27A1Q02318 531 aa20.32■□□□□ 0.84
CTU2-204ENST00000564105 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
CTU2-204ENST00000564105 PTPN14Q15678 1187 aa20.32■□□□□ 0.84
CTU2-204ENST00000564105 SLC39A12Q504Y0 691 aa20.32■□□□□ 0.84
CTU2-204ENST00000564105 LCLAT1Q6UWP7 414 aa20.32■□□□□ 0.84
CTU2-204ENST00000564105 GLYCTKQ8IVS8 523 aa20.32■□□□□ 0.84
CTU2-204ENST00000564105 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
CTU2-204ENST00000564105 OLIG1Q8TAK6 271 aa20.32■□□□□ 0.84
CTU2-204ENST00000564105 SLC2A14Q8TDB8 520 aa20.32■□□□□ 0.84
CTU2-204ENST00000564105 ARNTL2Q8WYA1 636 aa20.32■□□□□ 0.84
CTU2-204ENST00000564105 MYLPFQ96A32 169 aa20.32■□□□□ 0.84
CTU2-204ENST00000564105 TCF25Q9BQ70 676 aa20.32■□□□□ 0.84
CTU2-204ENST00000564105 CLSTN3Q9BQT9 956 aa20.32■□□□□ 0.84
CTU2-204ENST00000564105 MED10Q9BTT4 135 aa20.32■□□□□ 0.84
CTU2-204ENST00000564105 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP20.32■□□□□ 0.84
CTU2-204ENST00000564105 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa20.32■□□□□ 0.84
CTU2-204ENST00000564105 DENND4CQ5VZ89 1909 aa20.32■□□□□ 0.84
CTU2-204ENST00000564105 DOCK6Q96HP0 2047 aa20.31■□□□□ 0.84
CTU2-204ENST00000564105 LILRB3O75022 631 aa20.31■□□□□ 0.84
CTU2-204ENST00000564105 MICAL2O94851 1124 aa20.31■□□□□ 0.84
CTU2-204ENST00000564105 CSPG5O95196 566 aa20.31■□□□□ 0.84
CTU2-204ENST00000564105 CXCL14O95715 111 aa20.31■□□□□ 0.84
CTU2-204ENST00000564105 ANXA13P27216 316 aa20.31■□□□□ 0.84
CTU2-204ENST00000564105 OR1D2P34982 312 aa20.31■□□□□ 0.84
CTU2-204ENST00000564105 KIF11P52732 1056 aa20.31■□□□□ 0.84
CTU2-204ENST00000564105 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa20.31■□□□□ 0.84
CTU2-204ENST00000564105 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
CTU2-204ENST00000564105 SLC8B1Q6J4K2 584 aa20.31■□□□□ 0.84
CTU2-204ENST00000564105 CCDC170Q8IYT3 715 aa20.31■□□□□ 0.84
CTU2-204ENST00000564105 FUKQ8N0W3 1084 aa20.31■□□□□ 0.84
CTU2-204ENST00000564105 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
CTU2-204ENST00000564105 B3GNT5Q9BYG0 378 aa20.31■□□□□ 0.84
CTU2-204ENST00000564105 HESX1Q9UBX0 185 aa20.31■□□□□ 0.84
CTU2-204ENST00000564105 M0QYV0 167 aa20.3■□□□□ 0.84
CTU2-204ENST00000564105 CLDN5O00501 218 aa20.3■□□□□ 0.84
CTU2-204ENST00000564105 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP20.3■□□□□ 0.841e-8■■■■□ 21.8
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CTU2-204ENST00000564105 ADAM12O43184 909 aa20.3■□□□□ 0.84
CTU2-204ENST00000564105 FOSL2P15408 326 aa20.3■□□□□ 0.84
CTU2-204ENST00000564105 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
CTU2-204ENST00000564105 CREMQ03060 361 aa20.3■□□□□ 0.84
CTU2-204ENST00000564105 MTF1Q14872 753 aa20.3■□□□□ 0.84
CTU2-204ENST00000564105 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
CTU2-204ENST00000564105 PLPP4Q5VZY2 271 aa20.3■□□□□ 0.84
CTU2-204ENST00000564105 RAD9BQ6WBX8 426 aa20.3■□□□□ 0.84
CTU2-204ENST00000564105 C4orf50Q6ZRC1 276 aa20.3■□□□□ 0.84
CTU2-204ENST00000564105 PASD1Q8IV76 773 aa20.3■□□□□ 0.84
CTU2-204ENST00000564105 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP20.3■□□□□ 0.84
CTU2-204ENST00000564105 SLC30A5Q8TAD4 765 aa20.3■□□□□ 0.84
CTU2-204ENST00000564105 PCDHB18PQ96TA0 734 aa20.3■□□□□ 0.84
CTU2-204ENST00000564105 FNIP2Q9P278 1114 aa20.3■□□□□ 0.84
CTU2-204ENST00000564105 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
CTU2-204ENST00000564105 A0A087X0T9 212 aa20.29■□□□□ 0.84
CTU2-204ENST00000564105 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
CTU2-204ENST00000564105 FAM228BP0C875 321 aa20.29■□□□□ 0.84
CTU2-204ENST00000564105 DEKP35659 375 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
CTU2-204ENST00000564105 ROR1Q01973 937 aa20.29■□□□□ 0.84
CTU2-204ENST00000564105 GPR17Q13304 367 aa20.29■□□□□ 0.84
CTU2-204ENST00000564105 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
CTU2-204ENST00000564105 SLC18A3Q16572 532 aa20.29■□□□□ 0.84
CTU2-204ENST00000564105 TRIM72Q6ZMU5 477 aa20.29■□□□□ 0.84
CTU2-204ENST00000564105 PAQR9Q6ZVX9 377 aa20.29■□□□□ 0.84
CTU2-204ENST00000564105 FAM35AQ86V20 835 aa20.29■□□□□ 0.84
CTU2-204ENST00000564105 PALB2Q86YC2 1186 aa20.29■□□□□ 0.84
CTU2-204ENST00000564105 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
CTU2-204ENST00000564105 UBA3Q8TBC4 463 aa20.29■□□□□ 0.84
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