RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552438.5

ASIC1-208, Transcript of acid sensing ion channel subunit 1, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene ASIC1, Length 3,327 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ASIC1-208	ENST00000552438	CPA3	P15088	417 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ASIC1-208	ENST00000552438	VCP	P55072	806 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
ASIC1-208	ENST00000552438	SLC2A7	Q6PXP3	512 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ASIC1-208	ENST00000552438	MAPKAPK5	Q8IW41	473 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ASIC1-208	ENST00000552438	PNMA1	Q8ND90	353 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ASIC1-208	ENST00000552438	MRPS26	Q9BYN8	205 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
ASIC1-208	ENST00000552438	KCTD10	Q9H3F6	313 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ASIC1-208	ENST00000552438	DCP1A	Q9NPI6	582 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
ASIC1-208	ENST00000552438	WNT10B	O00744	389 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ASIC1-208	ENST00000552438	ADCY6	O43306	1168 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ASIC1-208	ENST00000552438	TNFAIP8	O95379	198 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ASIC1-208	ENST00000552438	MAN1A1	P33908	653 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ASIC1-208	ENST00000552438	CACNB3	P54284	484 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ASIC1-208	ENST00000552438	ARL4C	P56559	192 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ASIC1-208	ENST00000552438	ARHGAP4	P98171	946 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ASIC1-208	ENST00000552438	ZNF200	P98182	395 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
ASIC1-208	ENST00000552438	EFHC1	Q5JVL4	640 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ASIC1-208	ENST00000552438	IZUMO3	Q5VZ72	239 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ASIC1-208	ENST00000552438	ADGRG6	Q86SQ4	1221 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ASIC1-208	ENST00000552438	SAPCD2	Q86UD0	394 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ASIC1-208	ENST00000552438	ALYREF	Q86V81	257 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
ASIC1-208	ENST00000552438	BBOF1	Q8ND07	529 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ASIC1-208	ENST00000552438	DDI1	Q8WTU0	396 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ASIC1-208	ENST00000552438	CHST7	Q9NS84	486 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ASIC1-208	ENST00000552438	UBAP1	Q9NZ09	502 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ASIC1-208	ENST00000552438	TIAM2	Q8IVF5	1701 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ASIC1-208	ENST00000552438	CLRN2	A0PK11	232 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ASIC1-208	ENST00000552438	CYP26A1	O43174	497 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ASIC1-208	ENST00000552438	ATMIN	O43313	823 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
ASIC1-208	ENST00000552438	LRRN2	O75325	713 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ASIC1-208	ENST00000552438	KRT38	O76015	456 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ASIC1-208	ENST00000552438	PDGFRB	P09619	1106 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ASIC1-208	ENST00000552438	RXRG	P48443	463 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ASIC1-208	ENST00000552438	EPHB1	P54762	984 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ASIC1-208	ENST00000552438	GPC5	P78333	572 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ASIC1-208	ENST00000552438	PICALM	Q13492	652 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ASIC1-208	ENST00000552438	DPY19L2P1	Q6NXN4	242 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ASIC1-208	ENST00000552438	FBXL19	Q6PCT2	694 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ASIC1-208	ENST00000552438	GSTA5	Q7RTV2	222 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ASIC1-208	ENST00000552438	SCAI	Q8N9R8	606 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ASIC1-208	ENST00000552438	CCDC124	Q96CT7	223 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
ASIC1-208	ENST00000552438	COX4I2	Q96KJ9	171 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ASIC1-208	ENST00000552438	DRC3	Q9H069	523 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ASIC1-208	ENST00000552438	SIX2	Q9NPC8	291 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ASIC1-208	ENST00000552438	TBC1D23	Q9NUY8	699 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ASIC1-208	ENST00000552438	RSPH10B2	B2RC85	870 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ASIC1-208	ENST00000552438	GOLGA8R	I6L899	631 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ASIC1-208	ENST00000552438	XPOT	O43592	962 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
ASIC1-208	ENST00000552438	AP1G1	O43747	822 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ASIC1-208	ENST00000552438	SORBS3	O60504	671 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ASIC1-208	ENST00000552438	STAMBP	O95630	424 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ASIC1-208	ENST00000552438	RSPH10B	P0C881	870 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ASIC1-208	ENST00000552438	RRM1	P23921	792 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ASIC1-208	ENST00000552438	PHB	P35232	272 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ASIC1-208	ENST00000552438	PTK6	Q13882	451 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ASIC1-208	ENST00000552438	SPIDR	Q14159	915 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ASIC1-208	ENST00000552438	CNGA3	Q16281	694 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ASIC1-208	ENST00000552438	C6orf183	Q5T699	404 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ASIC1-208	ENST00000552438	SYDE1	Q6ZW31	735 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
ASIC1-208	ENST00000552438	TMC7	Q7Z402	723 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ASIC1-208	ENST00000552438	GPBP1	Q86WP2	473 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ASIC1-208	ENST00000552438	ALDH16A1	Q8IZ83	802 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ASIC1-208	ENST00000552438	CCDC89	Q8N998	374 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ASIC1-208	ENST00000552438	C12orf50	Q8NA57	414 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
ASIC1-208	ENST00000552438	GSDMB	Q8TAX9	411 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ASIC1-208	ENST00000552438	RIN3	Q8TB24	985 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ASIC1-208	ENST00000552438	ZBED3	Q96IU2	234 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
ASIC1-208	ENST00000552438	CNBD2	Q96M20	576 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ASIC1-208	ENST00000552438	BTBD9	Q96Q07	612 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ASIC1-208	ENST00000552438	TRPC7	Q9HCX4	862 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ASIC1-208	ENST00000552438	GPCPD1	Q9NPB8	672 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ASIC1-208	ENST00000552438	MCM9	Q9NXL9	1143 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ASIC1-208	ENST00000552438	ADAMTS6	Q9UKP5	1117 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ASIC1-208	ENST00000552438	FAM32A	Q9Y421	112 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
ASIC1-208	ENST00000552438	FRMPD4	Q14CM0	1322 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ASIC1-208	ENST00000552438	CAPN8	A6NHC0	703 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ASIC1-208	ENST00000552438	TYROBP	O43914	113 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ASIC1-208	ENST00000552438	AKAP3	O75969	853 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ASIC1-208	ENST00000552438	OCM2	P0CE71	109 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ASIC1-208	ENST00000552438	OCM	P0CE72	109 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
ASIC1-208	ENST00000552438	STT3A	P46977	705 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ASIC1-208	ENST00000552438	NFIA	Q12857	509 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ASIC1-208	ENST00000552438	MTMR2	Q13614	643 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ASIC1-208	ENST00000552438	SIX1	Q15475	284 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
ASIC1-208	ENST00000552438	ZNF362	Q5T0B9	420 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
ASIC1-208	ENST00000552438	NLRX1	Q86UT6	975 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ASIC1-208	ENST00000552438	DDX51	Q8N8A6	666 aa	Known RBP eCLIP	11.62	□□□□□ -0.55
ASIC1-208	ENST00000552438	TCP10L	Q8TDR4	215 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ASIC1-208	ENST00000552438	ATP6V0A1	Q93050	837 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ASIC1-208	ENST00000552438	MAK16	Q9BXY0	300 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
ASIC1-208	ENST00000552438	SENP6	Q9GZR1	1112 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
ASIC1-208	ENST00000552438	UVRAG	Q9P2Y5	699 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ASIC1-208	ENST00000552438	ZNF70	Q9UC06	446 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
ASIC1-208	ENST00000552438	COQ6	Q9Y2Z9	468 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ASIC1-208	ENST00000552438	DTNA	Q9Y4J8	743 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ASIC1-208	ENST00000552438	CALU	O43852	315 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
ASIC1-208	ENST00000552438	CAPN15	O75808	1086 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ASIC1-208	ENST00000552438	TFPT	P0C1Z6	253 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ASIC1-208	ENST00000552438	IVD	P26440	423 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ASIC1-208	ENST00000552438	FDFT1	P37268	417 aa		11.62	□□□□□ -0.55

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