RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504440.1

NPHP3-AS1-202, NPHP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NPHP3-AS1, Length 2,507 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 IVDP26440 423 aa6.98□□□□□ -1.29
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 YWHABP31946 246 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 RDXP35241 583 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 GJC1P36383 396 aa6.98□□□□□ -1.29
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ITGA8P53708 1063 aa6.98□□□□□ -1.29
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 NRLP54845 237 aa6.98□□□□□ -1.29
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 RWDD2BP57060 319 aa6.98□□□□□ -1.29
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 CETN1Q12798 172 aa6.98□□□□□ -1.29
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SGO2Q562F6 1265 aa6.98□□□□□ -1.29
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SPDYCQ5MJ68 293 aa6.98□□□□□ -1.29
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SLC39A4Q6P5W5 647 aa6.98□□□□□ -1.29
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa6.98□□□□□ -1.29
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SHC3Q92529 594 aa6.98□□□□□ -1.29
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 MRIQ9BWK5 157 aa6.98□□□□□ -1.29
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 VPS33BQ9H267 617 aa6.98□□□□□ -1.29
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ZNF576Q9H609 170 aa6.98□□□□□ -1.29
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 VEZTQ9HBM0 779 aa6.98□□□□□ -1.29
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 MCM8Q9UJA3 840 aa6.98□□□□□ -1.29
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ANAPC7Q9UJX3 599 aa6.98□□□□□ -1.29
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 COL4A5P29400 1685 aa6.98□□□□□ -1.29
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SNX3O60493 162 aa6.97□□□□□ -1.29
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ATP6V1G2O95670 118 aa6.97□□□□□ -1.29
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 GHRP10912 638 aa6.97□□□□□ -1.29
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 GZMAP12544 262 aa6.97□□□□□ -1.29
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 RRM1P23921 792 aa6.97□□□□□ -1.29
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 CNGA1P29973 690 aa6.97□□□□□ -1.29
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 GTF2BQ00403 316 aa6.97□□□□□ -1.29
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 CTBSQ01459 385 aa6.97□□□□□ -1.29
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 TKFCQ3LXA3 575 aa6.97□□□□□ -1.29
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 XKR9Q5GH70 373 aa6.97□□□□□ -1.29
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 FAM182AQ5T1J6 154 aa6.97□□□□□ -1.29
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SPOPLQ6IQ16 392 aa6.97□□□□□ -1.29
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ANKS4BQ8N8V4 417 aa6.97□□□□□ -1.29
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 CCDC63Q8NA47 563 aa6.97□□□□□ -1.29
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 PARD3BQ8TEW8 1205 aa6.97□□□□□ -1.29
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 DYDC1Q8WWB3 177 aa6.97□□□□□ -1.29
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 TAAR1Q96RJ0 339 aa6.97□□□□□ -1.29
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 NT5C1AQ9BXI3 368 aa6.97□□□□□ -1.29
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 PBX4Q9BYU1 374 aa6.97□□□□□ -1.29
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 MUC3BQ9H195 1237 aa6.97□□□□□ -1.29
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 TMEM206Q9H813 350 aa6.97□□□□□ -1.29
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 NOD2Q9HC29 1040 aa6.97□□□□□ -1.29
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 KLHL11Q9NVR0 708 aa6.97□□□□□ -1.29
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 KCND2Q9NZV8 630 aa6.97□□□□□ -1.29
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SAMD15Q9P1V8 674 aa6.97□□□□□ -1.29
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 MTUS1Q9ULD2 1270 aa6.97□□□□□ -1.29
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 CCPG1Q9ULG6 757 aa6.97□□□□□ -1.29
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SLC12A4Q9UP95 1085 aa6.97□□□□□ -1.29
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ZNF536O15090 1300 aa6.97□□□□□ -1.29
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 PASKQ96RG2 1323 aa6.97□□□□□ -1.29
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 FSCN2O14926 492 aa6.97□□□□□ -1.29
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 GREM1O60565 184 aa6.97□□□□□ -1.29
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ENTPD3O75355 529 aa6.97□□□□□ -1.29
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 MTA2O94776 668 aa6.97□□□□□ -1.29
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 CCNE2O96020 404 aa6.97□□□□□ -1.29
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SCP2P22307 547 aa6.97□□□□□ -1.29
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 FGFR3P22607 806 aa6.97□□□□□ -1.29
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 MAPK4P31152 587 aa6.97□□□□□ -1.29
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 CAP2P40123 477 aa6.97□□□□□ -1.29
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 QARSP47897 775 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 NPTX2P47972 431 aa6.97□□□□□ -1.29
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 MFAP3P55082 362 aa6.97□□□□□ -1.29
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 CDR2Q01850 454 aa6.97□□□□□ -1.29
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 CALCOCO2Q13137 446 aa6.97□□□□□ -1.29
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SLMAPQ14BN4 828 aa6.97□□□□□ -1.29
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 TCEAL1Q15170 157 aa6.97□□□□□ -1.29
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa6.97□□□□□ -1.29
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 WLSQ5T9L3 541 aa6.97□□□□□ -1.29
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 NUGGCQ68CJ6 796 aa6.97□□□□□ -1.29
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ACAD10Q6JQN1 1059 aa6.97□□□□□ -1.29
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 CGB2Q6NT52 195 aa6.97□□□□□ -1.29
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 RHBDF2Q6PJF5 856 aa6.97□□□□□ -1.29
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SV2AQ7L0J3 742 aa6.97□□□□□ -1.29
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ARMC9Q7Z3E5 817 aa6.97□□□□□ -1.29
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 PASD1Q8IV76 773 aa6.97□□□□□ -1.29
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 GLIS1Q8NBF1 620 aa6.97□□□□□ -1.29
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 TRPM4Q8TD43 1214 aa6.97□□□□□ -1.29
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 CHURC1Q8WUH1 139 aa6.97□□□□□ -1.29
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 CLEC4DQ8WXI8 215 aa6.97□□□□□ -1.29
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa6.97□□□□□ -1.29
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 C9orf72Q96LT7 481 aa6.97□□□□□ -1.29
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 RIT2Q99578 217 aa6.97□□□□□ -1.29
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 TMEM109Q9BVC6 243 aa6.97□□□□□ -1.29
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 LRRC19Q9H756 370 aa6.97□□□□□ -1.29
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 TBX20Q9UMR3 447 aa6.97□□□□□ -1.29
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.4 ms