RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498517.5

ARHGEF3-215, Transcript of Rho guanine nucleotide exchange factor 3, humanhuman

TSL 5

Gene ARHGEF3, Length 787 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF3-215ENST00000498517 HAUS6Q7Z4H7 955 aa6□□□□□ -1.45
ARHGEF3-215ENST00000498517 SPRED2Q7Z698 418 aa6□□□□□ -1.45
ARHGEF3-215ENST00000498517 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
ARHGEF3-215ENST00000498517 RHPN2Q8IUC4 686 aa6□□□□□ -1.45
ARHGEF3-215ENST00000498517 TRIM59Q8IWR1 403 aa6□□□□□ -1.45
ARHGEF3-215ENST00000498517 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa6□□□□□ -1.45
ARHGEF3-215ENST00000498517 NELFCDQ8IXH7 590 aa6□□□□□ -1.45
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ARHGEF3-215ENST00000498517 DEPTORQ8TB45 409 aa6□□□□□ -1.45
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ARHGEF3-215ENST00000498517 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa5.99□□□□□ -1.45
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ARHGEF3-215ENST00000498517 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa5.99□□□□□ -1.45
ARHGEF3-215ENST00000498517 HVCN1Q96D96 273 aa5.99□□□□□ -1.45
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ARHGEF3-215ENST00000498517 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
ARHGEF3-215ENST00000498517 OSBPL9Q96SU4 736 aa5.99□□□□□ -1.45
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ARHGEF3-215ENST00000498517 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP5.99□□□□□ -1.45
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ARHGEF3-215ENST00000498517 KCTD10Q9H3F6 313 aa5.99□□□□□ -1.45
ARHGEF3-215ENST00000498517 NLRC4Q9NPP4 1024 aa5.99□□□□□ -1.45
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ARHGEF3-215ENST00000498517 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa5.98□□□□□ -1.45
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ARHGEF3-215ENST00000498517 BTNL10A8MVZ5 291 aa5.98□□□□□ -1.45
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ARHGEF3-215ENST00000498517 NCK2O43639 380 aa5.98□□□□□ -1.45
ARHGEF3-215ENST00000498517 BUB1O43683 1085 aa5.98□□□□□ -1.45
ARHGEF3-215ENST00000498517 RPS6KA5O75582 802 aa5.98□□□□□ -1.45
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ARHGEF3-215ENST00000498517 AFPP02771 609 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
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