RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493537.5

SUPT20H-221, Transcript of SPT20 homolog, SAGA complex component, humanhuman

TSL 5

Gene SUPT20H, Length 2,149 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUPT20H-221ENST00000493537 F13A1P00488 732 aa4.75□□□□□ -1.65
SUPT20H-221ENST00000493537 ANXA6P08133 673 aa4.75□□□□□ -1.65
SUPT20H-221ENST00000493537 UBL4AP11441 157 aa4.75□□□□□ -1.65
SUPT20H-221ENST00000493537 KRT5P13647 590 aa4.75□□□□□ -1.65
SUPT20H-221ENST00000493537 PLCG1P19174 1290 aa4.75□□□□□ -1.65
SUPT20H-221ENST00000493537 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP4.75□□□□□ -1.655e-8■■■■■ 27
SUPT20H-221ENST00000493537 CCR1P32246 355 aa4.75□□□□□ -1.65
SUPT20H-221ENST00000493537 MAGEA4P43358 317 aa4.75□□□□□ -1.65
SUPT20H-221ENST00000493537 RABIFP47224 123 aa4.75□□□□□ -1.65
SUPT20H-221ENST00000493537 HSPA7P48741 367 aa4.75□□□□□ -1.65
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SUPT20H-221ENST00000493537 CHIT1Q13231 466 aa4.75□□□□□ -1.65
SUPT20H-221ENST00000493537 MPP2Q14168 576 aa4.75□□□□□ -1.65
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SUPT20H-221ENST00000493537 LRRC32Q14392 662 aa4.75□□□□□ -1.65
SUPT20H-221ENST00000493537 UBE3CQ15386 1083 aa4.75□□□□□ -1.65
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SUPT20H-221ENST00000493537 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa4.75□□□□□ -1.65
SUPT20H-221ENST00000493537 ADCK5Q3MIX3 580 aa4.75□□□□□ -1.65
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SUPT20H-221ENST00000493537 PIK3R6Q5UE93 754 aa4.75□□□□□ -1.65
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SUPT20H-221ENST00000493537 MTFR2Q6P444 385 aa4.75□□□□□ -1.65
SUPT20H-221ENST00000493537 OGFOD3Q6PK18 319 aa4.75□□□□□ -1.65
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SUPT20H-221ENST00000493537 ISLR2Q6UXK2 745 aa4.75□□□□□ -1.65
SUPT20H-221ENST00000493537 ZNF704Q6ZNC4 412 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
SUPT20H-221ENST00000493537 NUDT18Q6ZVK8 323 aa4.75□□□□□ -1.65
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SUPT20H-221ENST00000493537 TRIM59Q8IWR1 403 aa4.75□□□□□ -1.65
SUPT20H-221ENST00000493537 FBXW8Q8N3Y1 598 aa4.75□□□□□ -1.65
SUPT20H-221ENST00000493537 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
SUPT20H-221ENST00000493537 OR6S1Q8NH40 331 aa4.75□□□□□ -1.65
SUPT20H-221ENST00000493537 GANCQ8TET4 914 aa4.75□□□□□ -1.65
SUPT20H-221ENST00000493537 TTC9Q92623 222 aa4.75□□□□□ -1.65
SUPT20H-221ENST00000493537 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP4.75□□□□□ -1.65
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SUPT20H-221ENST00000493537 VPS33AQ96AX1 596 aa4.75□□□□□ -1.65
SUPT20H-221ENST00000493537 TMIGD2Q96BF3 282 aa4.75□□□□□ -1.65
SUPT20H-221ENST00000493537 SLC47A1Q96FL8 570 aa4.75□□□□□ -1.65
SUPT20H-221ENST00000493537 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
SUPT20H-221ENST00000493537 CCT7Q99832 543 aa4.75□□□□□ -1.65
SUPT20H-221ENST00000493537 CCDC77Q9BR77 488 aa4.75□□□□□ -1.65
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SUPT20H-221ENST00000493537 SUV39H2Q9H5I1 410 aa4.75□□□□□ -1.65
SUPT20H-221ENST00000493537 SCPEP1Q9HB40 452 aa4.75□□□□□ -1.65
SUPT20H-221ENST00000493537 LY9Q9HBG7 655 aa4.75□□□□□ -1.65
SUPT20H-221ENST00000493537 NAALAD2Q9Y3Q0 740 aa4.75□□□□□ -1.65
SUPT20H-221ENST00000493537 CLDN16Q9Y5I7 305 aa4.75□□□□□ -1.65
SUPT20H-221ENST00000493537 TRPV2Q9Y5S1 764 aa4.75□□□□□ -1.65
SUPT20H-221ENST00000493537 SLC12A7Q9Y666 1083 aa4.75□□□□□ -1.65
SUPT20H-221ENST00000493537 TLL2Q9Y6L7 1015 aa4.75□□□□□ -1.65
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SUPT20H-221ENST00000493537 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
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SUPT20H-221ENST00000493537 TMEM229AB2RXF0 380 aa4.75□□□□□ -1.65
SUPT20H-221ENST00000493537 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
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SUPT20H-221ENST00000493537 UBXN7O94888 489 aa4.75□□□□□ -1.65
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SUPT20H-221ENST00000493537 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
SUPT20H-221ENST00000493537 ITGA6P23229 1130 aa4.75□□□□□ -1.65
SUPT20H-221ENST00000493537 TIE1P35590 1138 aa4.75□□□□□ -1.65
SUPT20H-221ENST00000493537 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
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SUPT20H-221ENST00000493537 WNT5AP41221 380 aa4.75□□□□□ -1.65
SUPT20H-221ENST00000493537 BUD31P41223 144 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
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SUPT20H-221ENST00000493537 CRYMQ14894 314 aa4.75□□□□□ -1.65
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SUPT20H-221ENST00000493537 BMP2KLQ5H9B9 411 aa4.75□□□□□ -1.65
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SUPT20H-221ENST00000493537 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
SUPT20H-221ENST00000493537 DPY19L2Q6NUT2 758 aa4.75□□□□□ -1.65
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SUPT20H-221ENST00000493537 TTC7BQ86TV6 843 aa4.75□□□□□ -1.65
SUPT20H-221ENST00000493537 KIF18BQ86Y91 864 aa4.75□□□□□ -1.65
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SUPT20H-221ENST00000493537 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
SUPT20H-221ENST00000493537 SCFD2Q8WU76 684 aa4.75□□□□□ -1.65
SUPT20H-221ENST00000493537 GATAD2BQ8WXI9 593 aa4.75□□□□□ -1.65
SUPT20H-221ENST00000493537 IP6K1Q92551 441 aa4.75□□□□□ -1.65
SUPT20H-221ENST00000493537 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
SUPT20H-221ENST00000493537 HDAC10Q969S8 669 aa4.75□□□□□ -1.65
SUPT20H-221ENST00000493537 FAM120BQ96EK7 910 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
SUPT20H-221ENST00000493537 DTNBP1Q96EV8 351 aa4.75□□□□□ -1.65
SUPT20H-221ENST00000493537 CYFIP2Q96F07 1278 aa4.75□□□□□ -1.65
SUPT20H-221ENST00000493537 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
SUPT20H-221ENST00000493537 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
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