RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480273.5

RTEL1-TNFRSF6B-201, Transcript of RTEL1-TNFRSF6B readthrough (NMD candidate), humanhuman

TSL 2

Gene RTEL1-TNFRSF6B, Length 5,751 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP17.86■□□□□ 0.45
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RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ACAD10Q6JQN1 1059 aa17.86■□□□□ 0.45
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RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TNIP2Q8NFZ5 429 aa17.84■□□□□ 0.45
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CALML6Q8TD86 181 aa17.84■□□□□ 0.45
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RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CCDC142Q17RM4 750 aa17.84■□□□□ 0.45
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RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CLEC10AQ8IUN9 316 aa17.84■□□□□ 0.45
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RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP17.84■□□□□ 0.45
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RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 KIF20BQ96Q89 1820 aa17.84■□□□□ 0.45
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RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 NDUFA13Q9P0J0 144 aa17.83■□□□□ 0.45
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RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 AP4S1Q9Y587 144 aa17.83■□□□□ 0.45
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 UBOX5O94941 541 aa17.83■□□□□ 0.44
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PSMC3P17980 439 aa17.83■□□□□ 0.44
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PTPAQ15257 358 aa17.83■□□□□ 0.44
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MTFR1LQ9H019 292 aa17.83■□□□□ 0.44
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 FAM49BQ9NUQ9 324 aa17.83■□□□□ 0.44
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 GTF3C4Q9UKN8 822 aa17.83■□□□□ 0.44
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP17.83■□□□□ 0.44
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RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SYTL3Q4VX76 610 aa17.83■□□□□ 0.44
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CEP78Q5JTW2 689 aa17.83■□□□□ 0.44
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TNS2Q63HR2 1409 aa17.83■□□□□ 0.44
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SNX31Q8N9S9 440 aa17.83■□□□□ 0.44
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 BBS2Q9BXC9 721 aa17.83■□□□□ 0.44
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SGPL1O95470 568 aa17.83■□□□□ 0.44
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 RARGP13631 454 aa17.83■□□□□ 0.44
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CALB2P22676 271 aa17.83■□□□□ 0.44
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 STX5Q13190 355 aa17.83■□□□□ 0.44
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 LAMB3Q13751 1172 aa17.83■□□□□ 0.44
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa17.83■□□□□ 0.44
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SCFD2Q8WU76 684 aa17.83■□□□□ 0.44
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PHF21AQ96BD5 680 aa17.83■□□□□ 0.44
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP17.83■□□□□ 0.44
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP17.82■□□□□ 0.44
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP17.82■□□□□ 0.44
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 RPA1P27694 616 aa17.82■□□□□ 0.44
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