RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474088.1

PKD1-211, Transcript of polycystin 1, transient receptor potential channel interacting, humanhuman

TSL 5

Gene PKD1, Length 923 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD1-211ENST00000474088 PCSK1P29120 753 aa26.6■■□□□ 1.85
PKD1-211ENST00000474088 STK38Q15208 465 aa26.6■■□□□ 1.85
PKD1-211ENST00000474088 CFAP221Q4G0U5 840 aa26.6■■□□□ 1.85
PKD1-211ENST00000474088 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa26.6■■□□□ 1.85
PKD1-211ENST00000474088 DPH6Q7L8W6 267 aa26.6■■□□□ 1.85
PKD1-211ENST00000474088 LINC00301Q8NCQ3 95 aa26.6■■□□□ 1.85
PKD1-211ENST00000474088 GLIS3Q8NEA6 775 aa26.6■■□□□ 1.85
PKD1-211ENST00000474088 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP26.6■■□□□ 1.85
PKD1-211ENST00000474088 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa26.6■■□□□ 1.85
PKD1-211ENST00000474088 LRRC27Q9C0I9 530 aa26.6■■□□□ 1.85
PKD1-211ENST00000474088 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP26.6■■□□□ 1.85
PKD1-211ENST00000474088 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP26.6■■□□□ 1.85
PKD1-211ENST00000474088 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa26.6■■□□□ 1.85
PKD1-211ENST00000474088 ZNF233A6NK53 670 aa26.59■■□□□ 1.85
PKD1-211ENST00000474088 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP26.59■■□□□ 1.85
PKD1-211ENST00000474088 HCRTO43612 131 aa26.59■■□□□ 1.85
PKD1-211ENST00000474088 LRP3O75074 770 aa26.59■■□□□ 1.85
PKD1-211ENST00000474088 HOXC13P31276 330 aa26.59■■□□□ 1.85
PKD1-211ENST00000474088 MYO1EQ12965 1108 aa26.59■■□□□ 1.85
PKD1-211ENST00000474088 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP26.59■■□□□ 1.85
PKD1-211ENST00000474088 CCDC142Q17RM4 750 aa26.59■■□□□ 1.85
PKD1-211ENST00000474088 TMEM196Q5HYL7 178 aa26.59■■□□□ 1.85
PKD1-211ENST00000474088 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP26.59■■□□□ 1.85
PKD1-211ENST00000474088 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP26.59■■□□□ 1.85
PKD1-211ENST00000474088 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP26.59■■□□□ 1.85
PKD1-211ENST00000474088 RIN3Q8TB24 985 aa26.59■■□□□ 1.85
PKD1-211ENST00000474088 HPS3Q969F9 1004 aa26.59■■□□□ 1.85
PKD1-211ENST00000474088 CHFRQ96EP1 664 aa26.59■■□□□ 1.85
PKD1-211ENST00000474088 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP26.59■■□□□ 1.85
PKD1-211ENST00000474088 TNMDQ9H2S6 317 aa26.59■■□□□ 1.85
PKD1-211ENST00000474088 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP26.59■■□□□ 1.85
PKD1-211ENST00000474088 DENND4CQ5VZ89 1909 aa26.59■■□□□ 1.85
PKD1-211ENST00000474088 TADA3O75528 432 aa26.58■■□□□ 1.85
PKD1-211ENST00000474088 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP26.58■■□□□ 1.85
PKD1-211ENST00000474088 SURF1Q15526 300 aa26.58■■□□□ 1.85
PKD1-211ENST00000474088 FSTL4Q6MZW2 842 aa26.58■■□□□ 1.85
PKD1-211ENST00000474088 FAM171BQ6P995 826 aa26.58■■□□□ 1.85
PKD1-211ENST00000474088 LIMS2Q7Z4I7 341 aa26.58■■□□□ 1.85
PKD1-211ENST00000474088 WDR5BQ86VZ2 330 aa26.58■■□□□ 1.85
PKD1-211ENST00000474088 OR5B17Q8NGF7 314 aa26.58■■□□□ 1.85
PKD1-211ENST00000474088 RTKNQ9BST9 563 aa26.58■■□□□ 1.85
PKD1-211ENST00000474088 KBTBD4Q9NVX7 518 aa26.58■■□□□ 1.85
PKD1-211ENST00000474088 TNNC2P02585 160 aa26.57■■□□□ 1.84
PKD1-211ENST00000474088 ARSAP15289 507 aa26.57■■□□□ 1.84
PKD1-211ENST00000474088 AMPD2Q01433 879 aa26.57■■□□□ 1.84
PKD1-211ENST00000474088 PDGFRLQ15198 375 aa26.57■■□□□ 1.84
PKD1-211ENST00000474088 E2F4Q16254 413 aa26.57■■□□□ 1.84
PKD1-211ENST00000474088 DUOXA2Q1HG44 320 aa26.57■■□□□ 1.84
PKD1-211ENST00000474088 PKN3Q6P5Z2 889 aa26.57■■□□□ 1.84
PKD1-211ENST00000474088 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP26.57■■□□□ 1.84
PKD1-211ENST00000474088 CBWD2Q8IUF1 395 aa26.57■■□□□ 1.84
PKD1-211ENST00000474088 SCN4BQ8IWT1 228 aa26.57■■□□□ 1.84
PKD1-211ENST00000474088 HPDLQ96IR7 371 aa26.57■■□□□ 1.84
PKD1-211ENST00000474088 CYP2S1Q96SQ9 504 aa26.57■■□□□ 1.84
PKD1-211ENST00000474088 TRIM9Q9C026 710 aa26.57■■□□□ 1.84
PKD1-211ENST00000474088 PTPRJQ12913 1337 aa26.57■■□□□ 1.84
PKD1-211ENST00000474088 CACNA1AO00555 2505 aa26.57■■□□□ 1.84
PKD1-211ENST00000474088 SPTLC2O15270 562 aa26.56■■□□□ 1.84
PKD1-211ENST00000474088 PPP6R2O75170 966 aa26.56■■□□□ 1.84
PKD1-211ENST00000474088 ATP2C2O75185 946 aa26.56■■□□□ 1.84
PKD1-211ENST00000474088 HOXD13P35453 343 aa26.56■■□□□ 1.84
PKD1-211ENST00000474088 FAM160A1Q05DH4 1040 aa26.56■■□□□ 1.84
PKD1-211ENST00000474088 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa26.56■■□□□ 1.84
PKD1-211ENST00000474088 CUEDC2Q9H467 287 aa26.56■■□□□ 1.84
PKD1-211ENST00000474088 TRPC7Q9HCX4 862 aa26.56■■□□□ 1.84
PKD1-211ENST00000474088 SEMA4GQ9NTN9 838 aa26.56■■□□□ 1.84
PKD1-211ENST00000474088 HSPBP1Q9NZL4 362 aa26.56■■□□□ 1.84
PKD1-211ENST00000474088 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP26.56■■□□□ 1.84
PKD1-211ENST00000474088 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP26.56■■□□□ 1.84
PKD1-211ENST00000474088 OBSL1O75147 1896 aa26.55■■□□□ 1.84
PKD1-211ENST00000474088 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP26.55■■□□□ 1.84
PKD1-211ENST00000474088 ATG13O75143 517 aa26.55■■□□□ 1.84
PKD1-211ENST00000474088 USP17L7P0C7H9 530 aa26.55■■□□□ 1.84
PKD1-211ENST00000474088 LMO2P25791 158 aa26.55■■□□□ 1.84
PKD1-211ENST00000474088 MAGEA11P43364 429 aa26.55■■□□□ 1.84
PKD1-211ENST00000474088 GALK1P51570 392 aa26.55■■□□□ 1.84
PKD1-211ENST00000474088 AMPD3Q01432 767 aa26.55■■□□□ 1.84
PKD1-211ENST00000474088 MTF1Q14872 753 aa26.55■■□□□ 1.84
PKD1-211ENST00000474088 C4orf50Q6ZRC1 276 aa26.55■■□□□ 1.84
PKD1-211ENST00000474088 CEP68Q76N32 757 aa26.55■■□□□ 1.84
PKD1-211ENST00000474088 SLC22A12Q96S37 553 aa26.55■■□□□ 1.84
PKD1-211ENST00000474088 SYT15Q9BQS2 421 aa26.55■■□□□ 1.84
PKD1-211ENST00000474088 KIAA1586Q9HCI6 787 aa26.55■■□□□ 1.84
PKD1-211ENST00000474088 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP26.55■■□□□ 1.84
PKD1-211ENST00000474088 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP26.55■■□□□ 1.84
PKD1-211ENST00000474088 CDH9Q9ULB4 789 aa26.55■■□□□ 1.84
PKD1-211ENST00000474088 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa26.54■■□□□ 1.84
PKD1-211ENST00000474088 CSRP2Q16527 193 aa26.54■■□□□ 1.84
PKD1-211ENST00000474088 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP26.54■■□□□ 1.84
PKD1-211ENST00000474088 WDR49Q8IV35 697 aa26.54■■□□□ 1.84
PKD1-211ENST00000474088 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP26.54■■□□□ 1.84
PKD1-211ENST00000474088 FSIP1Q8NA03 581 aa26.54■■□□□ 1.84
PKD1-211ENST00000474088 ZNF507Q8TCN5 953 aa26.54■■□□□ 1.84
PKD1-211ENST00000474088 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP26.54■■□□□ 1.84
PKD1-211ENST00000474088 DCDC2BA2VCK2 349 aa26.53■■□□□ 1.84
PKD1-211ENST00000474088 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP26.53■■□□□ 1.847e-12■■□□□ 12.4
PKD1-211ENST00000474088 EGFP01133 1207 aa26.53■■□□□ 1.84
PKD1-211ENST00000474088 GJA4P35212 333 aa26.53■■□□□ 1.84
PKD1-211ENST00000474088 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
PKD1-211ENST00000474088 ASIC1P78348 528 aa26.53■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.4 ms