RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472427.5

RALGPS1-212, Transcript of Ral GEF with PH domain and SH3 binding motif 1, humanhuman

TSL 2

Gene RALGPS1, Length 764 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGPS1-212ENST00000472427 ITIH5Q86UX2 942 aa23.14■■□□□ 1.29
RALGPS1-212ENST00000472427 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP23.14■■□□□ 1.29
RALGPS1-212ENST00000472427 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.29
RALGPS1-212ENST00000472427 S1PR5Q9H228 398 aa23.14■■□□□ 1.29
RALGPS1-212ENST00000472427 HMGXB4Q9UGU5 601 aa23.14■■□□□ 1.29
RALGPS1-212ENST00000472427 ASB3Q9Y575 518 aa23.14■■□□□ 1.29
RALGPS1-212ENST00000472427 REV3LO60673 3130 aa23.14■■□□□ 1.29
RALGPS1-212ENST00000472427 ORC1Q13415 861 aa23.13■■□□□ 1.29
RALGPS1-212ENST00000472427 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
RALGPS1-212ENST00000472427 SMYD5Q6GMV2 418 aa23.13■■□□□ 1.29
RALGPS1-212ENST00000472427 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa23.13■■□□□ 1.29
RALGPS1-212ENST00000472427 TMEM270Q6UE05 265 aa23.13■■□□□ 1.29
RALGPS1-212ENST00000472427 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
RALGPS1-212ENST00000472427 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa23.13■■□□□ 1.29
RALGPS1-212ENST00000472427 NME7Q9Y5B8 376 aa23.13■■□□□ 1.29
RALGPS1-212ENST00000472427 TRIM66O15016 1216 aa23.12■■□□□ 1.29
RALGPS1-212ENST00000472427 PAPLNO95428 1278 aa23.12■■□□□ 1.29
RALGPS1-212ENST00000472427 VNN2O95498 520 aa23.12■■□□□ 1.29
RALGPS1-212ENST00000472427 KRT5P13647 590 aa23.12■■□□□ 1.29
RALGPS1-212ENST00000472427 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP23.12■■□□□ 1.29
RALGPS1-212ENST00000472427 SCN4BQ8IWT1 228 aa23.12■■□□□ 1.29
RALGPS1-212ENST00000472427 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
RALGPS1-212ENST00000472427 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
RALGPS1-212ENST00000472427 SMARCD1Q96GM5 515 aa23.12■■□□□ 1.29
RALGPS1-212ENST00000472427 TWNKQ96RR1 684 aa23.12■■□□□ 1.29
RALGPS1-212ENST00000472427 KIAA1257Q9ULG3 409 aa23.12■■□□□ 1.29
RALGPS1-212ENST00000472427 EYSQ5T1H1 3165 aa23.11■■□□□ 1.29
RALGPS1-212ENST00000472427 TPM3P06753 285 aa23.11■■□□□ 1.29
RALGPS1-212ENST00000472427 PTPN2P17706 415 aa23.11■■□□□ 1.29
RALGPS1-212ENST00000472427 BDNFP23560 247 aa23.11■■□□□ 1.29
RALGPS1-212ENST00000472427 CYP2F1P24903 491 aa23.11■■□□□ 1.29
RALGPS1-212ENST00000472427 GRIK1P39086 918 aa23.11■■□□□ 1.29
RALGPS1-212ENST00000472427 CDR1P51861 262 aa23.11■■□□□ 1.29
RALGPS1-212ENST00000472427 FAM35AQ86V20 835 aa23.11■■□□□ 1.29
RALGPS1-212ENST00000472427 TTC9BQ8N6N2 239 aa23.11■■□□□ 1.29
RALGPS1-212ENST00000472427 LEMD2Q8NC56 503 aa23.11■■□□□ 1.29
RALGPS1-212ENST00000472427 CEP295NLQ96MC4 621 aa23.11■■□□□ 1.29
RALGPS1-212ENST00000472427 ASB2Q96Q27 587 aa23.11■■□□□ 1.29
RALGPS1-212ENST00000472427 B3GNT5Q9BYG0 378 aa23.11■■□□□ 1.29
RALGPS1-212ENST00000472427 CRISPLD1Q9H336 500 aa23.11■■□□□ 1.29
RALGPS1-212ENST00000472427 PLCB1Q9NQ66 1216 aa23.11■■□□□ 1.29
RALGPS1-212ENST00000472427 FAM49BQ9NUQ9 324 aa23.11■■□□□ 1.29
RALGPS1-212ENST00000472427 EHD2Q9NZN4 543 aa23.11■■□□□ 1.29
RALGPS1-212ENST00000472427 GRXCR2A6NFK2 248 aa23.1■■□□□ 1.29
RALGPS1-212ENST00000472427 PAEPP09466 180 aa23.1■■□□□ 1.29
RALGPS1-212ENST00000472427 CD19P15391 556 aa23.1■■□□□ 1.29
RALGPS1-212ENST00000472427 RAD23BP54727 409 aa23.1■■□□□ 1.29
RALGPS1-212ENST00000472427 SLC8A3P57103 927 aa23.1■■□□□ 1.29
RALGPS1-212ENST00000472427 SYCP1Q15431 976 aa23.1■■□□□ 1.29
RALGPS1-212ENST00000472427 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
RALGPS1-212ENST00000472427 ARHGAP44Q17R89 818 aa23.1■■□□□ 1.29
RALGPS1-212ENST00000472427 CCDC142Q17RM4 750 aa23.1■■□□□ 1.29
RALGPS1-212ENST00000472427 CYP4A22Q5TCH4 519 aa23.1■■□□□ 1.29
RALGPS1-212ENST00000472427 UBR7Q8N806 425 aa23.1■■□□□ 1.29
RALGPS1-212ENST00000472427 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
RALGPS1-212ENST00000472427 NEK11Q8NG66 645 aa23.1■■□□□ 1.29
RALGPS1-212ENST00000472427 SLC2A14Q8TDB8 520 aa23.1■■□□□ 1.29
RALGPS1-212ENST00000472427 WHAMMQ8TF30 809 aa23.1■■□□□ 1.29
RALGPS1-212ENST00000472427 SUSD6Q92537 303 aa23.1■■□□□ 1.29
RALGPS1-212ENST00000472427 KAT5Q92993 513 aa23.1■■□□□ 1.29
RALGPS1-212ENST00000472427 CYFIP2Q96F07 1278 aa23.1■■□□□ 1.29
RALGPS1-212ENST00000472427 KREMEN1Q96MU8 473 aa23.1■■□□□ 1.29
RALGPS1-212ENST00000472427 ASAH2Q9NR71 780 aa23.1■■□□□ 1.29
RALGPS1-212ENST00000472427 DNAJC12Q9UKB3 198 aa23.1■■□□□ 1.29
RALGPS1-212ENST00000472427 CLUHO75153 1309 aa23.09■■□□□ 1.29
RALGPS1-212ENST00000472427 SOAT2O75908 522 aa23.09■■□□□ 1.29
RALGPS1-212ENST00000472427 FGF19O95750 216 aa23.09■■□□□ 1.29
RALGPS1-212ENST00000472427 FAM200BP0CF97 657 aa23.09■■□□□ 1.29
RALGPS1-212ENST00000472427 CCDC130P13994 396 aa23.09■■□□□ 1.29
RALGPS1-212ENST00000472427 ACO1P21399 889 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
RALGPS1-212ENST00000472427 USP8P40818 1118 aa23.09■■□□□ 1.29
RALGPS1-212ENST00000472427 FANCCQ00597 558 aa23.09■■□□□ 1.29
RALGPS1-212ENST00000472427 KCNMA1Q12791 1236 aa23.09■■□□□ 1.29
RALGPS1-212ENST00000472427 RAPGEF1Q13905 1077 aa23.09■■□□□ 1.29
RALGPS1-212ENST00000472427 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
RALGPS1-212ENST00000472427 SGO2Q562F6 1265 aa23.09■■□□□ 1.29
RALGPS1-212ENST00000472427 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa23.09■■□□□ 1.29
RALGPS1-212ENST00000472427 GJB7Q6PEY0 223 aa23.09■■□□□ 1.29
RALGPS1-212ENST00000472427 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
RALGPS1-212ENST00000472427 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
RALGPS1-212ENST00000472427 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
RALGPS1-212ENST00000472427 C12orf29Q8N999 325 aa23.09■■□□□ 1.29
RALGPS1-212ENST00000472427 SLC4A11Q8NBS3 891 aa23.09■■□□□ 1.29
RALGPS1-212ENST00000472427 RNF214Q8ND24 703 aa23.09■■□□□ 1.29
RALGPS1-212ENST00000472427 GCNAQ96QF7 691 aa23.09■■□□□ 1.29
RALGPS1-212ENST00000472427 ERGIC2Q96RQ1 377 aa23.09■■□□□ 1.29
RALGPS1-212ENST00000472427 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
RALGPS1-212ENST00000472427 CORO1BQ9BR76 489 aa23.09■■□□□ 1.29
RALGPS1-212ENST00000472427 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa23.09■■□□□ 1.29
RALGPS1-212ENST00000472427 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
RALGPS1-212ENST00000472427 SIX2Q9NPC8 291 aa23.09■■□□□ 1.29
RALGPS1-212ENST00000472427 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
RALGPS1-212ENST00000472427 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
RALGPS1-212ENST00000472427 KRT82Q9NSB4 513 aa23.09■■□□□ 1.29
RALGPS1-212ENST00000472427 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
RALGPS1-212ENST00000472427 CLDN5O00501 218 aa23.08■■□□□ 1.29
RALGPS1-212ENST00000472427 ZNF197O14709 1029 aa23.08■■□□□ 1.29
RALGPS1-212ENST00000472427 AP1G2O75843 785 aa23.08■■□□□ 1.29
RALGPS1-212ENST00000472427 CSH1P0DML2 217 aa23.08■■□□□ 1.29
RALGPS1-212ENST00000472427 CSH2P0DML3 217 aa23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.4 ms