RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471364.1

RUBCN-208, Transcript of RUN and cysteine rich domain containing beclin 1 interacting protein, human

TSL 3

Gene RUBCN, Length 434 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RUBCN-208	ENST00000471364	MBTD1	Q05BQ5	628 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RUBCN-208	ENST00000471364	GFPT1	Q06210	699 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
RUBCN-208	ENST00000471364	PUM1	Q14671	1186 aa	Known RBP eCLIP	13.57	□□□□□ -0.24
RUBCN-208	ENST00000471364	CCDC122	Q5T0U0	273 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RUBCN-208	ENST00000471364	SLFN12L	Q6IEE8	588 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RUBCN-208	ENST00000471364	SLC27A1	Q6PCB7	646 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RUBCN-208	ENST00000471364	ZBTB8OS	Q8IWT0	167 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RUBCN-208	ENST00000471364	CCDC127	Q96BQ5	260 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RUBCN-208	ENST00000471364	ZBTB45	Q96K62	511 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
RUBCN-208	ENST00000471364	FAM213A	Q9BRX8	229 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RUBCN-208	ENST00000471364	NFKBIZ	Q9BYH8	718 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RUBCN-208	ENST00000471364	LACRT	Q9GZZ8	138 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RUBCN-208	ENST00000471364	MYO1A	Q9UBC5	1043 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RUBCN-208	ENST00000471364	APEX2	Q9UBZ4	518 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RUBCN-208	ENST00000471364	PARP2	Q9UGN5	583 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RUBCN-208	ENST00000471364	GUCA1B	Q9UMX6	200 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RUBCN-208	ENST00000471364	CACNA1A	O00555	2505 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RUBCN-208	ENST00000471364	SF3B1	O75533	1304 aa	Known RBP eCLIP	13.57	□□□□□ -0.24
RUBCN-208	ENST00000471364	TRIP11	Q15643	1979 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RUBCN-208	ENST00000471364	ZNF233	A6NK53	670 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RUBCN-208	ENST00000471364	LRRN2	O75325	713 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RUBCN-208	ENST00000471364	NPTXR	O95502	500 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RUBCN-208	ENST00000471364	HNRNPA1	P09651	372 aa	Known RBP eCLIP	13.56	□□□□□ -0.24
RUBCN-208	ENST00000471364	FER	P16591	822 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RUBCN-208	ENST00000471364	MAGEA1	P43355	309 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RUBCN-208	ENST00000471364	EFNA5	P52803	228 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RUBCN-208	ENST00000471364	CETN1	Q12798	172 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RUBCN-208	ENST00000471364	HSP90AA2P	Q14568	343 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
RUBCN-208	ENST00000471364	DRAP1	Q14919	205 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
RUBCN-208	ENST00000471364	AMHR2	Q16671	573 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RUBCN-208	ENST00000471364	LIN9	Q5TKA1	542 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RUBCN-208	ENST00000471364	PRSS55	Q6UWB4	352 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
RUBCN-208	ENST00000471364	ZPBP2	Q6X784	338 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RUBCN-208	ENST00000471364	MTSS1L	Q765P7	747 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RUBCN-208	ENST00000471364	GRASP	Q7Z6J2	395 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
RUBCN-208	ENST00000471364	ARHGEF19	Q8IW93	802 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RUBCN-208	ENST00000471364	GSTCD	Q8NEC7	633 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RUBCN-208	ENST00000471364	TTPAL	Q9BTX7	342 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RUBCN-208	ENST00000471364	STK33	Q9BYT3	514 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RUBCN-208	ENST00000471364	FOXQ1	Q9C009	403 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RUBCN-208	ENST00000471364	GPR88	Q9GZN0	384 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RUBCN-208	ENST00000471364	C2orf40	Q9H1Z8	148 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RUBCN-208	ENST00000471364	KIAA1586	Q9HCI6	787 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RUBCN-208	ENST00000471364	TMEM8A	Q9HCN3	771 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RUBCN-208	ENST00000471364	TOPORS	Q9NS56	1045 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
RUBCN-208	ENST00000471364	FBXW11	Q9UKB1	542 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RUBCN-208	ENST00000471364	AGO2	Q9UKV8	859 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
RUBCN-208	ENST00000471364	CDH7	Q9ULB5	785 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RUBCN-208	ENST00000471364	FRYL	O94915	3013 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RUBCN-208	ENST00000471364		A0A1B0GUA9	196 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RUBCN-208	ENST00000471364	KANSL1L	A0AUZ9	987 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RUBCN-208	ENST00000471364	TTLL13P	A6NNM8	815 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RUBCN-208	ENST00000471364		F8VZ95	297 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RUBCN-208	ENST00000471364	PJA2	O43164	708 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RUBCN-208	ENST00000471364	KRT86	O43790	486 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RUBCN-208	ENST00000471364	XYLB	O75191	536 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RUBCN-208	ENST00000471364	URI1	O94763	535 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
RUBCN-208	ENST00000471364	PRKCB	P05771	671 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RUBCN-208	ENST00000471364	PNMA6A	P0CW24	399 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
RUBCN-208	ENST00000471364	GTF2H1	P32780	548 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RUBCN-208	ENST00000471364	SOX5	P35711	763 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RUBCN-208	ENST00000471364	GPC5	P78333	572 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RUBCN-208	ENST00000471364	TUSC3	Q13454	348 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RUBCN-208	ENST00000471364	PSMD6	Q15008	389 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RUBCN-208	ENST00000471364	ENOX2	Q16206	610 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
RUBCN-208	ENST00000471364	ZNF528	Q3MIS6	628 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RUBCN-208	ENST00000471364	RTP2	Q5QGT7	225 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RUBCN-208	ENST00000471364	PPM1L	Q5SGD2	360 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RUBCN-208	ENST00000471364	KRT39	Q6A163	491 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RUBCN-208	ENST00000471364	PARM1	Q6UWI2	310 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RUBCN-208	ENST00000471364	CRELD2	Q6UXH1	353 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
RUBCN-208	ENST00000471364	ZNF571	Q7Z3V5	609 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
RUBCN-208	ENST00000471364	USP37	Q86T82	979 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RUBCN-208	ENST00000471364	ST13P5	Q8NFI4	369 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
RUBCN-208	ENST00000471364	RABGGTA	Q92696	567 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RUBCN-208	ENST00000471364	SEMA4D	Q92854	862 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RUBCN-208	ENST00000471364	FGF14	Q92915	247 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RUBCN-208	ENST00000471364	MSTO1	Q9BUK6	570 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RUBCN-208	ENST00000471364	MRPL4	Q9BYD3	311 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
RUBCN-208	ENST00000471364	BCO2	Q9BYV7	579 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RUBCN-208	ENST00000471364	TSGA10	Q9BZW7	698 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RUBCN-208	ENST00000471364	KLK14	Q9P0G3	267 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RUBCN-208	ENST00000471364	COQ4	Q9Y3A0	265 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RUBCN-208	ENST00000471364	BZW2	Q9Y6E2	419 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
RUBCN-208	ENST00000471364	CIT	O14578	2027 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RUBCN-208	ENST00000471364	NOTCH4	Q99466	2003 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RUBCN-208	ENST00000471364		A0A0B4J269	797 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RUBCN-208	ENST00000471364	MED19	A0JLT2	244 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
RUBCN-208	ENST00000471364	DYNC1I1	O14576	645 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RUBCN-208	ENST00000471364	B4GALT5	O43286	388 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RUBCN-208	ENST00000471364	CTIF	O43310	598 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
RUBCN-208	ENST00000471364	LAMTOR5	O43504	91 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RUBCN-208	ENST00000471364	GFPT2	O94808	682 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RUBCN-208	ENST00000471364	SLU7	O95391	586 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
RUBCN-208	ENST00000471364	LDHA	P00338	332 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
RUBCN-208	ENST00000471364	GLUL	P15104	373 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RUBCN-208	ENST00000471364	HOXA9	P31269	272 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RUBCN-208	ENST00000471364	MATR3	P43243	847 aa	Known RBP eCLIP	13.54	□□□□□ -0.24
RUBCN-208	ENST00000471364	WNT7B	P56706	349 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RUBCN-208	ENST00000471364	PFKP	Q01813	784 aa		13.54	□□□□□ -0.24

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.2 ms