RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464611.1

ACTB-208, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 715 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-208ENST00000464611 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa8.96□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 TMEM120BA0PK00 339 aa8.96□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 FAM47DPA6NHR8 397 aa8.96□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 DCDC2CA8MYV0 355 aa8.96□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 ZNF487B1APH4 448 aa8.96□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 TP73O15350 636 aa8.96□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 FAM189A1O60320 539 aa8.96□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 HMGCRP04035 888 aa8.96□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 KRT1P04264 644 aa8.96□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 CYP2C8P10632 490 aa8.96□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 VDRP11473 427 aa8.96□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 KRT3P12035 628 aa8.96□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 BRAFP15056 766 aa8.96□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 ALDH3A1P30838 453 aa8.96□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 STX2P32856 288 aa8.96□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 PCK1P35558 622 aa8.96□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 PHKA2P46019 1235 aa8.96□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 GABRB2P47870 512 aa8.96□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 SCTRP47872 440 aa8.96□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 SOX10P56693 466 aa8.96□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 TAS2R40P59535 323 aa8.96□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 CCNA1P78396 465 aa8.96□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 TFDP2Q14188 446 aa8.96□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP8.96□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 TAZQ16635 292 aa8.96□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 CCDC142Q17RM4 750 aa8.96□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 FAM110CQ1W6H9 321 aa8.96□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 KLHL38Q2WGJ6 581 aa8.96□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 ZNF699Q32M78 642 aa8.96□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 FAM47CQ5HY64 1035 aa8.96□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 ZNF667Q5HYK9 610 aa8.96□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa8.96□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 ATF7IP2Q5U623 682 aa8.96□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 RNF43Q68DV7 783 aa8.96□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 BBS12Q6ZW61 710 aa8.96□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 MAP7D3Q8IWC1 876 aa8.96□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 PPIL6Q8IXY8 311 aa8.96□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 LRRC34Q8IZ02 419 aa8.96□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 SHCBP1Q8NEM2 672 aa8.96□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 MDM1Q8TC05 714 aa8.96□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 ZNF398Q8TD17 642 aa8.96□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 PTPN18Q99952 460 aa8.96□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 TUBB6Q9BUF5 446 aa8.96□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 BCO2Q9BYV7 579 aa8.96□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 OSBPL7Q9BZF2 842 aa8.96□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 RSAD1Q9HA92 442 aa8.96□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 PTPRHQ9HD43 1115 aa8.96□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 KCNK9Q9NPC2 374 aa8.96□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 ASNSD1Q9NWL6 643 aa8.96□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 KLHL14Q9P2G3 628 aa8.96□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa8.96□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 COL1A2P08123 1366 aa8.96□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 CFAP69A5D8W1 941 aa8.95□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 GJB6O95452 261 aa8.95□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 ACSL3O95573 720 aa8.95□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 GSTA2P09210 222 aa8.95□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 HOXC6P09630 235 aa8.95□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 SETSIPP0DME0 302 aa8.95□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 CDKN2BP42772 138 aa8.95□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 RASSF2P50749 326 aa8.95□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 MNAT1P51948 309 aa8.95□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 ARL4CP56559 192 aa8.95□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 SP4Q02446 784 aa8.95□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 CRHR2Q13324 411 aa8.95□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 SPARCL1Q14515 664 aa8.95□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 KCTD2Q14681 263 aa8.95□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 OASLQ15646 514 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 SNCBQ16143 134 aa8.95□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 QPCTQ16769 361 aa8.95□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 LONRF1Q17RB8 773 aa8.95□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 P3H1Q32P28 736 aa8.95□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 CCDC91Q7Z6B0 441 aa8.95□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 OR5B17Q8NGF7 314 aa8.95□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 SLC35B2Q8TB61 432 aa8.95□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 MAML1Q92585 1016 aa8.95□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 USP6NLQ92738 828 aa8.95□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 SMC6Q96SB8 1091 aa8.95□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 ZIC5Q96T25 663 aa8.95□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 PCYT2Q99447 389 aa8.95□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 GPR20Q99678 358 aa8.95□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 HEMGNQ9BXL5 484 aa8.95□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 HAPLN2Q9GZV7 340 aa8.95□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 RABEP2Q9H5N1 569 aa8.95□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 RXFP1Q9HBX9 757 aa8.95□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 MORF4L1Q9UBU8 362 aa8.95□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 SLC12A4Q9UP95 1085 aa8.95□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 USTQ9Y2C2 406 aa8.95□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 DERAQ9Y315 318 aa8.95□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 STARD13Q9Y3M8 1113 aa8.95□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 ZNF236Q9UL36 1845 aa8.95□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.9 ms