RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439418.1

C9orf135-AS1-201, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene C9orf135-AS1, Length 1,375 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SLC22A17Q8WUG5 538 aa6.23□□□□□ -1.41
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 HVCN1Q96D96 273 aa6.23□□□□□ -1.41
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MYADMQ96S97 322 aa6.23□□□□□ -1.41
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 C22orf23Q9BZE7 217 aa6.23□□□□□ -1.41
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TNKS2Q9H2K2 1166 aa6.23□□□□□ -1.41
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa6.23□□□□□ -1.41
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 IGSF9Q9P2J2 1179 aa6.23□□□□□ -1.41
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 EPS15L1Q9UBC2 864 aa6.23□□□□□ -1.41
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP6.23□□□□□ -1.41
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 COL4A2P08572 1712 aa6.23□□□□□ -1.41
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 WDR81Q562E7 1941 aa6.23□□□□□ -1.41
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TSPY2A6NKD2 308 aa6.22□□□□□ -1.41
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TM4SF5O14894 197 aa6.22□□□□□ -1.41
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 GPAA1O43292 621 aa6.22□□□□□ -1.41
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ZNF862O60290 1169 aa6.22□□□□□ -1.41
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TBC1D4O60343 1298 aa6.22□□□□□ -1.41
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PLOD3O60568 738 aa6.22□□□□□ -1.41
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 GOLGA8HP0CJ92 632 aa6.22□□□□□ -1.41
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PDHBP11177 359 aa6.22□□□□□ -1.41
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 GNAT1P11488 350 aa6.22□□□□□ -1.41
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TDGF1P13385 188 aa6.22□□□□□ -1.41
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CD72P21854 359 aa6.22□□□□□ -1.41
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 RPS6KB1P23443 525 aa6.22□□□□□ -1.41
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MARK3P27448 753 aa6.22□□□□□ -1.41
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MAPK9P45984 424 aa6.22□□□□□ -1.41
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CD151P48509 253 aa6.22□□□□□ -1.41
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 NOVP48745 357 aa6.22□□□□□ -1.41
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SP4Q02446 784 aa6.22□□□□□ -1.41
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TMED1Q13445 227 aa6.22□□□□□ -1.41
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 UBXN2BQ14CS0 331 aa6.22□□□□□ -1.41
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 WTAPQ15007 396 aa6.22□□□□□ -1.41
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PTPN14Q15678 1187 aa6.22□□□□□ -1.41
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 LETM2Q2VYF4 491 aa6.22□□□□□ -1.41
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MARCH8Q5T0T0 291 aa6.22□□□□□ -1.41
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SPATA1Q5VX52 437 aa6.22□□□□□ -1.41
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ISM2Q6H9L7 571 aa6.22□□□□□ -1.41
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TAF2Q6P1X5 1199 aa6.22□□□□□ -1.41
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 LRFN4Q6PJG9 635 aa6.22□□□□□ -1.41
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 KCNT2Q6UVM3 1135 aa6.22□□□□□ -1.41
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PRR23BQ6ZRT6 265 aa6.22□□□□□ -1.41
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 C8orf86Q6ZUL3 223 aa6.22□□□□□ -1.41
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 GALNT5Q7Z7M9 940 aa6.22□□□□□ -1.41
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 WFDC8Q8IUA0 241 aa6.22□□□□□ -1.41
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 FAM186BQ8IYM0 893 aa6.22□□□□□ -1.41
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 GATA6Q92908 595 aa6.22□□□□□ -1.41
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 KLHDC7BQ96G42 594 aa6.22□□□□□ -1.41
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PLPPR2Q96GM1 343 aa6.22□□□□□ -1.41
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 GPR20Q99678 358 aa6.22□□□□□ -1.41
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PDCD2LQ9BRP1 358 aa6.22□□□□□ -1.41
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 FTHL17Q9BXU8 183 aa6.22□□□□□ -1.41
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SFXN1Q9H9B4 322 aa6.22□□□□□ -1.41
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MLXIPQ9HAP2 919 aa6.22□□□□□ -1.41
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TBC1D22BQ9NU19 505 aa6.22□□□□□ -1.41
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 COMMD8Q9NX08 183 aa6.22□□□□□ -1.41
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ZMYM5Q9UJ78 669 aa6.22□□□□□ -1.41
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TUBE1Q9UJT0 475 aa6.22□□□□□ -1.41
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TPCN1Q9ULQ1 816 aa6.22□□□□□ -1.41
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 WASF3Q9UPY6 502 aa6.22□□□□□ -1.41
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CFAP46Q8IYW2 2715 aa6.22□□□□□ -1.41
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa6.22□□□□□ -1.41
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.41
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MEIS3P2A8K0S8 358 aa6.21□□□□□ -1.41
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa6.21□□□□□ -1.41
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 NOP56O00567 594 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.41
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 GPR39O43194 453 aa6.21□□□□□ -1.41
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CTSBP07858 339 aa6.21□□□□□ -1.41
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MYBP10242 640 aa6.21□□□□□ -1.41
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 HSD3B1P14060 373 aa6.21□□□□□ -1.41
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 AK2P54819 239 aa6.21□□□□□ -1.41
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 STARD6P59095 220 aa6.21□□□□□ -1.41
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.41
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PPARAQ07869 468 aa6.21□□□□□ -1.41
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ZNF543Q08ER8 600 aa6.21□□□□□ -1.41
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PPFIA1Q13136 1202 aa6.21□□□□□ -1.41
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.41
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.41
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 HTR4Q13639 388 aa6.21□□□□□ -1.41
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 GRM3Q14832 879 aa6.21□□□□□ -1.41
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.41
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 GRIK4Q16099 956 aa6.21□□□□□ -1.41
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 FXNQ16595 210 aa6.21□□□□□ -1.41
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 RILPL1Q5EBL4 403 aa6.21□□□□□ -1.41
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 WIPI1Q5MNZ9 446 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.41
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 GPR158Q5T848 1215 aa6.21□□□□□ -1.41
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 INTS11Q5TA45 600 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.41
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 LAIR1Q6GTX8 287 aa6.21□□□□□ -1.41
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CEP85Q6P2H3 762 aa6.21□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.7 ms