RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428064.5

LIMS1-208, Transcript of LIM zinc finger domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene LIMS1, Length 637 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS1-208ENST00000428064 HPS3Q969F9 1004 aa22.51■■□□□ 1.19
LIMS1-208ENST00000428064 RMDN1Q96DB5 314 aa22.51■■□□□ 1.19
LIMS1-208ENST00000428064 FAM84AQ96KN4 292 aa22.51■■□□□ 1.19
LIMS1-208ENST00000428064 FAM83CQ9BQN1 747 aa22.51■■□□□ 1.19
LIMS1-208ENST00000428064 TDP1Q9NUW8 608 aa22.51■■□□□ 1.19
LIMS1-208ENST00000428064 GTF3C4Q9UKN8 822 aa22.51■■□□□ 1.19
LIMS1-208ENST00000428064 CACNA1AO00555 2505 aa22.5■■□□□ 1.19
LIMS1-208ENST00000428064 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
LIMS1-208ENST00000428064 CYP2F1P24903 491 aa22.5■■□□□ 1.19
LIMS1-208ENST00000428064 MAGEA11P43364 429 aa22.5■■□□□ 1.19
LIMS1-208ENST00000428064 SATB1Q01826 763 aa22.5■■□□□ 1.19
LIMS1-208ENST00000428064 UNC13DQ70J99 1090 aa22.5■■□□□ 1.19
LIMS1-208ENST00000428064 MAB21L3Q8N8X9 362 aa22.5■■□□□ 1.19
LIMS1-208ENST00000428064 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
LIMS1-208ENST00000428064 HPDLQ96IR7 371 aa22.5■■□□□ 1.19
LIMS1-208ENST00000428064 CEP295NLQ96MC4 621 aa22.5■■□□□ 1.19
LIMS1-208ENST00000428064 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
LIMS1-208ENST00000428064 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa22.5■■□□□ 1.19
LIMS1-208ENST00000428064 TGFB1I1O43294 461 aa22.49■■□□□ 1.19
LIMS1-208ENST00000428064 TADA3O75528 432 aa22.49■■□□□ 1.19
LIMS1-208ENST00000428064 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
LIMS1-208ENST00000428064 TNK2Q07912 1038 aa22.49■■□□□ 1.19
LIMS1-208ENST00000428064 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
LIMS1-208ENST00000428064 DDR2Q16832 855 aa22.49■■□□□ 1.19
LIMS1-208ENST00000428064 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
LIMS1-208ENST00000428064 ATL3Q6DD88 541 aa22.49■■□□□ 1.19
LIMS1-208ENST00000428064 C4orf50Q6ZRC1 276 aa22.49■■□□□ 1.19
LIMS1-208ENST00000428064 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
LIMS1-208ENST00000428064 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa22.49■■□□□ 1.19
LIMS1-208ENST00000428064 CDH9Q9ULB4 789 aa22.49■■□□□ 1.19
LIMS1-208ENST00000428064 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
LIMS1-208ENST00000428064 CCL26Q9Y258 94 aa22.49■■□□□ 1.19
LIMS1-208ENST00000428064 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
LIMS1-208ENST00000428064 WARSP23381 471 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
LIMS1-208ENST00000428064 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP22.48■■□□□ 1.19
LIMS1-208ENST00000428064 PON2Q15165 354 aa22.48■■□□□ 1.19
LIMS1-208ENST00000428064 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
LIMS1-208ENST00000428064 BMT2Q1RMZ1 405 aa22.48■■□□□ 1.19
LIMS1-208ENST00000428064 TXNDC8Q6A555 127 aa22.48■■□□□ 1.19
LIMS1-208ENST00000428064 SCFD1Q8WVM8 642 aa22.48■■□□□ 1.19
LIMS1-208ENST00000428064 GKN1Q9NS71 199 aa22.48■■□□□ 1.19
LIMS1-208ENST00000428064 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
LIMS1-208ENST00000428064 DLL3Q9NYJ7 618 aa22.48■■□□□ 1.19
LIMS1-208ENST00000428064 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
LIMS1-208ENST00000428064 PTPRDP23468 1912 aa22.47■■□□□ 1.19
LIMS1-208ENST00000428064 GREB1Q4ZG55 1949 aa22.47■■□□□ 1.19
LIMS1-208ENST00000428064 K7ESF4 209 aa22.47■■□□□ 1.19
LIMS1-208ENST00000428064 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
LIMS1-208ENST00000428064 F13A1P00488 732 aa22.47■■□□□ 1.19
LIMS1-208ENST00000428064 HOXA6P31267 233 aa22.47■■□□□ 1.19
LIMS1-208ENST00000428064 CNR2P34972 360 aa22.47■■□□□ 1.19
LIMS1-208ENST00000428064 RUNX3Q13761 415 aa22.47■■□□□ 1.19
LIMS1-208ENST00000428064 PSMD6Q15008 389 aa22.47■■□□□ 1.19
LIMS1-208ENST00000428064 SDHAF4Q5VUM1 108 aa22.47■■□□□ 1.19
LIMS1-208ENST00000428064 VSTM1Q6UX27 236 aa22.47■■□□□ 1.19
LIMS1-208ENST00000428064 Q6ZS52 159 aa22.47■■□□□ 1.19
LIMS1-208ENST00000428064 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa22.47■■□□□ 1.19
LIMS1-208ENST00000428064 C12orf56Q8IXR9 622 aa22.47■■□□□ 1.19
LIMS1-208ENST00000428064 STKLD1Q8NE28 680 aa22.47■■□□□ 1.19
LIMS1-208ENST00000428064 TTC8Q8TAM2 541 aa22.47■■□□□ 1.19
LIMS1-208ENST00000428064 SPATA17Q96L03 361 aa22.47■■□□□ 1.19
LIMS1-208ENST00000428064 CGRRF1Q99675 332 aa22.47■■□□□ 1.19
LIMS1-208ENST00000428064 SYT15Q9BQS2 421 aa22.47■■□□□ 1.19
LIMS1-208ENST00000428064 HPS4Q9NQG7 708 aa22.47■■□□□ 1.19
LIMS1-208ENST00000428064 GPR179Q6PRD1 2367 aa22.47■■□□□ 1.19
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
LIMS1-208ENST00000428064 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa22.46■■□□□ 1.19
LIMS1-208ENST00000428064 HCRTO43612 131 aa22.46■■□□□ 1.19
LIMS1-208ENST00000428064 FAM163BP0C2L3 166 aa22.46■■□□□ 1.19
LIMS1-208ENST00000428064 FAM160A1Q05DH4 1040 aa22.46■■□□□ 1.19
LIMS1-208ENST00000428064 CCDC142Q17RM4 750 aa22.46■■□□□ 1.19
LIMS1-208ENST00000428064 RESP18Q5W5W9 173 aa22.46■■□□□ 1.19
LIMS1-208ENST00000428064 HS2ST1Q7LGA3 356 aa22.46■■□□□ 1.19
LIMS1-208ENST00000428064 HSCBQ8IWL3 235 aa22.46■■□□□ 1.19
LIMS1-208ENST00000428064 FSIP1Q8NA03 581 aa22.46■■□□□ 1.19
LIMS1-208ENST00000428064 XXYLT1Q8NBI6 393 aa22.46■■□□□ 1.19
LIMS1-208ENST00000428064 FAM13BQ9NYF5 915 aa22.46■■□□□ 1.19
LIMS1-208ENST00000428064 GMEB2Q9UKD1 530 aa22.46■■□□□ 1.19
LIMS1-208ENST00000428064 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa22.45■■□□□ 1.18
LIMS1-208ENST00000428064 TACC1O75410 805 aa22.45■■□□□ 1.18
LIMS1-208ENST00000428064 STAU1O95793 577 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
LIMS1-208ENST00000428064 TCF3P15923 654 aa22.45■■□□□ 1.18
LIMS1-208ENST00000428064 AMPD2Q01433 879 aa22.45■■□□□ 1.18
LIMS1-208ENST00000428064 CYP24A1Q07973 514 aa22.45■■□□□ 1.18
LIMS1-208ENST00000428064 PDGFRLQ15198 375 aa22.45■■□□□ 1.18
LIMS1-208ENST00000428064 TMEM196Q5HYL7 178 aa22.45■■□□□ 1.18
LIMS1-208ENST00000428064 LAIR1Q6GTX8 287 aa22.45■■□□□ 1.18
LIMS1-208ENST00000428064 LONP2Q86WA8 852 aa22.45■■□□□ 1.18
LIMS1-208ENST00000428064 RIN3Q8TB24 985 aa22.45■■□□□ 1.18
LIMS1-208ENST00000428064 MYLPFQ96A32 169 aa22.45■■□□□ 1.18
LIMS1-208ENST00000428064 CHFRQ96EP1 664 aa22.45■■□□□ 1.18
LIMS1-208ENST00000428064 FNBP1Q96RU3 617 aa22.45■■□□□ 1.18
LIMS1-208ENST00000428064 CRTAC1Q9NQ79 661 aa22.45■■□□□ 1.18
LIMS1-208ENST00000428064 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.18
LIMS1-208ENST00000428064 RAB23Q9ULC3 237 aa22.45■■□□□ 1.18
LIMS1-208ENST00000428064 PCDHA7Q9UN72 937 aa22.45■■□□□ 1.18
LIMS1-208ENST00000428064 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
LIMS1-208ENST00000428064 ATP2C2O75185 946 aa22.44■■□□□ 1.18
LIMS1-208ENST00000428064 USP17L7P0C7H9 530 aa22.44■■□□□ 1.18
LIMS1-208ENST00000428064 PFKLP17858 780 aa22.44■■□□□ 1.18
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