RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424089.5

POLR1A-204, Transcript of RNA polymerase I subunit A, human

TSL 3

Gene POLR1A, Length 576 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
POLR1A-204	ENST00000424089	IFT81	Q8WYA0	676 aa		10.63	□□□□□ -0.71
POLR1A-204	ENST00000424089	ACAP3	Q96P50	834 aa		10.63	□□□□□ -0.71
POLR1A-204	ENST00000424089	RUFY1	Q96T51	708 aa		10.63	□□□□□ -0.71
POLR1A-204	ENST00000424089	RAD9A	Q99638	391 aa		10.63	□□□□□ -0.71
POLR1A-204	ENST00000424089	FDXACB1	Q9BRP7	624 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
POLR1A-204	ENST00000424089	BCO2	Q9BYV7	579 aa		10.63	□□□□□ -0.71
POLR1A-204	ENST00000424089	GCOM2	Q9BZD3	368 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
POLR1A-204	ENST00000424089	PDZD7	Q9H5P4	517 aa		10.63	□□□□□ -0.71
POLR1A-204	ENST00000424089	MINDY3	Q9H8M7	445 aa		10.63	□□□□□ -0.71
POLR1A-204	ENST00000424089	PARP2	Q9UGN5	583 aa		10.63	□□□□□ -0.71
POLR1A-204	ENST00000424089	IP6K2	Q9UHH9	426 aa		10.63	□□□□□ -0.71
POLR1A-204	ENST00000424089	ANAPC7	Q9UJX3	599 aa		10.63	□□□□□ -0.71
POLR1A-204	ENST00000424089	ITGA11	Q9UKX5	1188 aa		10.63	□□□□□ -0.71
POLR1A-204	ENST00000424089	NFU1	Q9UMS0	254 aa		10.63	□□□□□ -0.71
POLR1A-204	ENST00000424089	FAM50B	Q9Y247	325 aa		10.63	□□□□□ -0.71
POLR1A-204	ENST00000424089	ABHD14A-ACY1	A0A1B0GW23	586 aa		10.62	□□□□□ -0.71
POLR1A-204	ENST00000424089	MBLAC1	A4D2B0	266 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
POLR1A-204	ENST00000424089	TMEM110-MUSTN1	A8MSY1	372 aa		10.62	□□□□□ -0.71
POLR1A-204	ENST00000424089	LACTBL1	A8MY62	500 aa		10.62	□□□□□ -0.71
POLR1A-204	ENST00000424089		H3BQF6	201 aa		10.62	□□□□□ -0.71
POLR1A-204	ENST00000424089	FSCN2	O14926	492 aa		10.62	□□□□□ -0.71
POLR1A-204	ENST00000424089	B4GALT5	O43286	388 aa		10.62	□□□□□ -0.71
POLR1A-204	ENST00000424089	TSPAN1	O60635	241 aa		10.62	□□□□□ -0.71
POLR1A-204	ENST00000424089	F2	P00734	622 aa		10.62	□□□□□ -0.71
POLR1A-204	ENST00000424089	ITGA4	P13612	1032 aa		10.62	□□□□□ -0.71
POLR1A-204	ENST00000424089	SELP	P16109	830 aa		10.62	□□□□□ -0.71
POLR1A-204	ENST00000424089	ARF4	P18085	180 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
POLR1A-204	ENST00000424089	RRM1	P23921	792 aa		10.62	□□□□□ -0.71
POLR1A-204	ENST00000424089	HSPA9	P38646	679 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
POLR1A-204	ENST00000424089	GRM5	P41594	1212 aa		10.62	□□□□□ -0.71
POLR1A-204	ENST00000424089	ASPA	P45381	313 aa		10.62	□□□□□ -0.71
POLR1A-204	ENST00000424089	ERVK-21	P61565	698 aa		10.62	□□□□□ -0.71
POLR1A-204	ENST00000424089	RBP5	P82980	135 aa		10.62	□□□□□ -0.71
POLR1A-204	ENST00000424089	MAMLD1	Q13495	774 aa		10.62	□□□□□ -0.71
POLR1A-204	ENST00000424089	PTGIS	Q16647	500 aa		10.62	□□□□□ -0.71
POLR1A-204	ENST00000424089	PTPRO	Q16827	1216 aa		10.62	□□□□□ -0.71
POLR1A-204	ENST00000424089	MARCH8	Q5T0T0	291 aa		10.62	□□□□□ -0.71
POLR1A-204	ENST00000424089	CFAP58	Q5T655	872 aa		10.62	□□□□□ -0.71
POLR1A-204	ENST00000424089	LRRC38	Q5VT99	294 aa		10.62	□□□□□ -0.71
POLR1A-204	ENST00000424089	PTCRA	Q6ISU1	281 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
POLR1A-204	ENST00000424089	LRIG3	Q6UXM1	1119 aa		10.62	□□□□□ -0.71
POLR1A-204	ENST00000424089	SYDE1	Q6ZW31	735 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
POLR1A-204	ENST00000424089	SLC13A5	Q86YT5	568 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
POLR1A-204	ENST00000424089	RHOT1	Q8IXI2	618 aa		10.62	□□□□□ -0.71
POLR1A-204	ENST00000424089	NME8	Q8N427	588 aa		10.62	□□□□□ -0.71
POLR1A-204	ENST00000424089	FEZF2	Q8TBJ5	459 aa		10.62	□□□□□ -0.71
POLR1A-204	ENST00000424089	KRT35	Q92764	455 aa		10.62	□□□□□ -0.71
POLR1A-204	ENST00000424089	SLCO2A1	Q92959	643 aa		10.62	□□□□□ -0.71
POLR1A-204	ENST00000424089	SH3GL2	Q99962	352 aa		10.62	□□□□□ -0.71
POLR1A-204	ENST00000424089	ERP44	Q9BS26	406 aa		10.62	□□□□□ -0.71
POLR1A-204	ENST00000424089	MIS12	Q9H081	205 aa		10.62	□□□□□ -0.71
POLR1A-204	ENST00000424089	DDX47	Q9H0S4	455 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
POLR1A-204	ENST00000424089	WDR35	Q9P2L0	1181 aa		10.62	□□□□□ -0.71
POLR1A-204	ENST00000424089	AMACR	Q9UHK6	382 aa		10.62	□□□□□ -0.71
POLR1A-204	ENST00000424089	BRWD1	Q9NSI6	2320 aa		10.62	□□□□□ -0.71
POLR1A-204	ENST00000424089	MYH10	P35580	1976 aa		10.61	□□□□□ -0.71
POLR1A-204	ENST00000424089	PPAN-P2RY11	A0A0B4J1V8	794 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
POLR1A-204	ENST00000424089	LCHN	A4D1U4	455 aa		10.61	□□□□□ -0.71
POLR1A-204	ENST00000424089	POLR3G	O15318	223 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
POLR1A-204	ENST00000424089	ATMIN	O43313	823 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
POLR1A-204	ENST00000424089	DCX	O43602	365 aa		10.61	□□□□□ -0.71
POLR1A-204	ENST00000424089	GJB5	O95377	273 aa		10.61	□□□□□ -0.71
POLR1A-204	ENST00000424089	SYF2	O95926	243 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
POLR1A-204	ENST00000424089	ZNF286B	P0CG31	522 aa		10.61	□□□□□ -0.71
POLR1A-204	ENST00000424089	CXCL8	P10145	99 aa		10.61	□□□□□ -0.71
POLR1A-204	ENST00000424089	PYGM	P11217	842 aa		10.61	□□□□□ -0.71
POLR1A-204	ENST00000424089	GSC	P56915	257 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
POLR1A-204	ENST00000424089	DMTN	Q08495	405 aa		10.61	□□□□□ -0.71
POLR1A-204	ENST00000424089	IKBKE	Q14164	716 aa		10.61	□□□□□ -0.71
POLR1A-204	ENST00000424089	PIGH	Q14442	188 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
POLR1A-204	ENST00000424089	HLTF	Q14527	1009 aa	Known RBP eCLIP	10.61	□□□□□ -0.71	5e-6	■■□□□ 12.8
POLR1A-204	ENST00000424089	TMEM132D	Q14C87	1099 aa		10.61	□□□□□ -0.71
POLR1A-204	ENST00000424089	STIL	Q15468	1287 aa		10.61	□□□□□ -0.71
POLR1A-204	ENST00000424089	LRRC8D	Q7L1W4	858 aa		10.61	□□□□□ -0.71
POLR1A-204	ENST00000424089	KATNAL2	Q8IYT4	538 aa		10.61	□□□□□ -0.71
POLR1A-204	ENST00000424089	IQCK	Q8N0W5	287 aa		10.61	□□□□□ -0.71
POLR1A-204	ENST00000424089	FBXO22	Q8NEZ5	403 aa		10.61	□□□□□ -0.71
POLR1A-204	ENST00000424089	MAGOHB	Q96A72	148 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
POLR1A-204	ENST00000424089	SCLT1	Q96NL6	688 aa		10.61	□□□□□ -0.71
POLR1A-204	ENST00000424089	KATNAL1	Q9BW62	490 aa		10.61	□□□□□ -0.71
POLR1A-204	ENST00000424089	DNAI2	Q9GZS0	605 aa		10.61	□□□□□ -0.71
POLR1A-204	ENST00000424089	LRRC19	Q9H756	370 aa		10.61	□□□□□ -0.71
POLR1A-204	ENST00000424089	ADAM21	Q9UKJ8	722 aa		10.61	□□□□□ -0.71
POLR1A-204	ENST00000424089	LINC01553	A4QN01	128 aa		10.6	□□□□□ -0.71
POLR1A-204	ENST00000424089	TMEM191C	A6NGB0	347 aa		10.6	□□□□□ -0.71
POLR1A-204	ENST00000424089	AGPS	O00116	658 aa		10.6	□□□□□ -0.71
POLR1A-204	ENST00000424089	VTN	P04004	478 aa		10.6	□□□□□ -0.71
POLR1A-204	ENST00000424089	RPLP2	P05387	115 aa	Known RBP	10.6	□□□□□ -0.71
POLR1A-204	ENST00000424089	KRT19	P08727	400 aa		10.6	□□□□□ -0.71
POLR1A-204	ENST00000424089	GNAT1	P11488	350 aa		10.6	□□□□□ -0.71
POLR1A-204	ENST00000424089	IL9	P15248	144 aa		10.6	□□□□□ -0.71
POLR1A-204	ENST00000424089	GGCX	P38435	758 aa		10.6	□□□□□ -0.71
POLR1A-204	ENST00000424089	YARS	P54577	528 aa	Known RBP	10.6	□□□□□ -0.71
POLR1A-204	ENST00000424089	COPS2	P61201	443 aa		10.6	□□□□□ -0.71
POLR1A-204	ENST00000424089	OSTN	P61366	133 aa		10.6	□□□□□ -0.71
POLR1A-204	ENST00000424089	DEFB103A	P81534	67 aa		10.6	□□□□□ -0.71
POLR1A-204	ENST00000424089	FOXK2	Q01167	660 aa		10.6	□□□□□ -0.71
POLR1A-204	ENST00000424089	MYO1E	Q12965	1108 aa		10.6	□□□□□ -0.71
POLR1A-204	ENST00000424089	ZNF211	Q13398	564 aa	Predicted RBP	10.6	□□□□□ -0.71
POLR1A-204	ENST00000424089	ACAP1	Q15027	740 aa		10.6	□□□□□ -0.71

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