RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356100.6

PTPRT-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 12,480 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-201ENST00000356100 CAMKK2Q96RR4 588 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRT-201ENST00000356100 TASP1Q9H6P5 420 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRT-201ENST00000356100 MANSC1Q9H8J5 431 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRT-201ENST00000356100 MOSPD1Q9UJG1 213 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRT-201ENST00000356100 VGLL3A8MV65 326 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRT-201ENST00000356100 SERPINI2O75830 405 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRT-201ENST00000356100 MAPTP10636 758 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
PTPRT-201ENST00000356100 NAMPTP43490 491 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRT-201ENST00000356100 ARMC6Q6NXE6 501 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRT-201ENST00000356100 BTNL9Q6UXG8 535 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRT-201ENST00000356100 CATSPER3Q86XQ3 398 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRT-201ENST00000356100 DDI1Q8WTU0 396 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRT-201ENST00000356100 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
PTPRT-201ENST00000356100 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRT-201ENST00000356100 C17orf102A2RUQ5 167 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRT-201ENST00000356100 CRTAMO95727 393 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRT-201ENST00000356100 PDHBP11177 359 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRT-201ENST00000356100 GRK3P35626 688 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRT-201ENST00000356100 PRKAA2P54646 552 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRT-201ENST00000356100 DAB2P98082 770 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRT-201ENST00000356100 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
PTPRT-201ENST00000356100 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRT-201ENST00000356100 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
PTPRT-201ENST00000356100 TMEM245Q9H330 911 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRT-201ENST00000356100 RAB6BQ9NRW1 208 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRT-201ENST00000356100 KLHL11Q9NVR0 708 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRT-201ENST00000356100 AP3M1Q9Y2T2 418 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRT-201ENST00000356100 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRT-201ENST00000356100 RASSF9O75901 435 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRT-201ENST00000356100 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
PTPRT-201ENST00000356100 GALCP54803 685 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRT-201ENST00000356100 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
PTPRT-201ENST00000356100 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
PTPRT-201ENST00000356100 ADCK1Q86TW2 530 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRT-201ENST00000356100 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
PTPRT-201ENST00000356100 WDR24Q96S15 920 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRT-201ENST00000356100 CCT8L2Q96SF2 557 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRT-201ENST00000356100 UBXN6Q9BZV1 441 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRT-201ENST00000356100 GANQ9H2C0 597 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRT-201ENST00000356100 TRPC7Q9HCX4 862 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRT-201ENST00000356100 PDGFCQ9NRA1 345 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRT-201ENST00000356100 CD274Q9NZQ7 290 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRT-201ENST00000356100 TGM2P21980 687 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRT-201ENST00000356100 RRM2P31350 389 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRT-201ENST00000356100 SLC44A5Q8NCS7 719 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRT-201ENST00000356100 REPS1Q96D71 796 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRT-201ENST00000356100 WNK4Q96J92 1243 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRT-201ENST00000356100 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
PTPRT-201ENST00000356100 PRKD2Q9BZL6 878 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRT-201ENST00000356100 CYP3A43Q9HB55 503 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRT-201ENST00000356100 PLAGL2Q9UPG8 496 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRT-201ENST00000356100 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRT-201ENST00000356100 CUL2Q13617 745 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRT-201ENST00000356100 SPDYAQ5MJ70 313 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRT-201ENST00000356100 HERC6Q8IVU3 1022 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRT-201ENST00000356100 STARD8Q92502 1023 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRT-201ENST00000356100 THAP11Q96EK4 314 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRT-201ENST00000356100 ELMO2Q96JJ3 720 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRT-201ENST00000356100 NUDT12Q9BQG2 462 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRT-201ENST00000356100 RPS6KA5O75582 802 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRT-201ENST00000356100 TGFB3P10600 412 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRT-201ENST00000356100 CYP2C9P11712 490 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRT-201ENST00000356100 NR2C2P49116 596 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRT-201ENST00000356100 USP10Q14694 798 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
PTPRT-201ENST00000356100 CLEC4FQ8N1N0 589 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRT-201ENST00000356100 SNX31Q8N9S9 440 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRT-201ENST00000356100 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
PTPRT-201ENST00000356100 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRT-201ENST00000356100 GLRA3O75311 464 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRT-201ENST00000356100 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
PTPRT-201ENST00000356100 MLNP12872 115 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRT-201ENST00000356100 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
PTPRT-201ENST00000356100 NFIXQ14938 502 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRT-201ENST00000356100 C1orf54Q8WWF1 131 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRT-201ENST00000356100 KCNH7Q9NS40 1196 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRT-201ENST00000356100 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRT-201ENST00000356100 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRT-201ENST00000356100 PJA2O43164 708 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRT-201ENST00000356100 NDUFB10O96000 172 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRT-201ENST00000356100 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
PTPRT-201ENST00000356100 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
PTPRT-201ENST00000356100 GUCY1A3Q02108 690 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRT-201ENST00000356100 KDSRQ06136 332 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRT-201ENST00000356100 C17orf80Q9BSJ5 609 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRT-201ENST00000356100 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
PTPRT-201ENST00000356100 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
PTPRT-201ENST00000356100 RGL1Q9NZL6 768 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRT-201ENST00000356100 ZNF229Q9UJW7 825 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRT-201ENST00000356100 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
PTPRT-201ENST00000356100 AGAP1Q9UPQ3 857 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRT-201ENST00000356100 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRT-201ENST00000356100 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
PTPRT-201ENST00000356100 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
PTPRT-201ENST00000356100 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
PTPRT-201ENST00000356100 NSL1Q96IY1 281 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRT-201ENST00000356100 VCPIP1Q96JH7 1222 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRT-201ENST00000356100 MAGEB18Q96M61 343 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRT-201ENST00000356100 DIABLOQ9NR28 239 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRT-201ENST00000356100 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP6.25□□□□□ -1.41
PTPRT-201ENST00000356100 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa6.25□□□□□ -1.41
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