RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000306324.3

HOXD4-201, Transcript of homeobox D4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD4, Length 1,464 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD4-201ENST00000306324 TFF2Q03403 129 aa23.76■■□□□ 1.39
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HOXD4-201ENST00000306324 SLC4A11Q8NBS3 891 aa23.76■■□□□ 1.39
HOXD4-201ENST00000306324 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP23.76■■□□□ 1.39
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HOXD4-201ENST00000306324 RTL10Q7L3V2 364 aa23.75■■□□□ 1.39
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HOXD4-201ENST00000306324 GREB1Q4ZG55 1949 aa23.74■■□□□ 1.39
HOXD4-201ENST00000306324 CD19P15391 556 aa23.74■■□□□ 1.39
HOXD4-201ENST00000306324 NR1I3Q14994 352 aa23.74■■□□□ 1.39
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HOXD4-201ENST00000306324 SLC2A14Q8TDB8 520 aa23.74■■□□□ 1.39
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HOXD4-201ENST00000306324 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP23.72■■□□□ 1.39
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HOXD4-201ENST00000306324 ATF6P18850 670 aa23.72■■□□□ 1.39
HOXD4-201ENST00000306324 GRIK1P39086 918 aa23.72■■□□□ 1.39
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HOXD4-201ENST00000306324 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP23.72■■□□□ 1.39
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HOXD4-201ENST00000306324 SDHAF4Q5VUM1 108 aa23.71■■□□□ 1.39
HOXD4-201ENST00000306324 VSTM1Q6UX27 236 aa23.71■■□□□ 1.39
HOXD4-201ENST00000306324 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP23.71■■□□□ 1.39
HOXD4-201ENST00000306324 GPR152Q8TDT2 470 aa23.71■■□□□ 1.39
HOXD4-201ENST00000306324 GIPC2Q8TF65 315 aa23.71■■□□□ 1.39
HOXD4-201ENST00000306324 SMARCD1Q96GM5 515 aa23.71■■□□□ 1.39
HOXD4-201ENST00000306324 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP23.71■■□□□ 1.39
HOXD4-201ENST00000306324 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP23.71■■□□□ 1.39
HOXD4-201ENST00000306324 KRT82Q9NSB4 513 aa23.71■■□□□ 1.39
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