RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000227163.8

SPI1-201, Transcript of Spi-1 proto-oncogene, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 2 BASIC

Gene SPI1, Length 1,168 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPI1-201ENST00000227163 DDR2Q16832 855 aa22.96■■□□□ 1.27
SPI1-201ENST00000227163 MON1AQ86VX9 555 aa22.96■■□□□ 1.27
SPI1-201ENST00000227163 TTC16Q8NEE8 873 aa22.96■■□□□ 1.27
SPI1-201ENST00000227163 EXOC4Q96A65 974 aa22.96■■□□□ 1.27
SPI1-201ENST00000227163 PARD6AQ9NPB6 346 aa22.96■■□□□ 1.27
SPI1-201ENST00000227163 LRP3O75074 770 aa22.95■■□□□ 1.26
SPI1-201ENST00000227163 NOL4O94818 638 aa22.95■■□□□ 1.26
SPI1-201ENST00000227163 CKMP06732 381 aa22.95■■□□□ 1.26
SPI1-201ENST00000227163 NASPP49321 788 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
SPI1-201ENST00000227163 RUNX3Q13761 415 aa22.95■■□□□ 1.26
SPI1-201ENST00000227163 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
SPI1-201ENST00000227163 PDGFRLQ15198 375 aa22.95■■□□□ 1.26
SPI1-201ENST00000227163 SURF1Q15526 300 aa22.95■■□□□ 1.26
SPI1-201ENST00000227163 WDR44Q5JSH3 913 aa22.95■■□□□ 1.26
SPI1-201ENST00000227163 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
SPI1-201ENST00000227163 TRIM68Q6AZZ1 485 aa22.95■■□□□ 1.26
SPI1-201ENST00000227163 C4orf50Q6ZRC1 276 aa22.95■■□□□ 1.26
SPI1-201ENST00000227163 SCN4BQ8IWT1 228 aa22.95■■□□□ 1.26
SPI1-201ENST00000227163 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
SPI1-201ENST00000227163 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP22.95■■□□□ 1.26
SPI1-201ENST00000227163 FAM83CQ9BQN1 747 aa22.95■■□□□ 1.26
SPI1-201ENST00000227163 HPS4Q9NQG7 708 aa22.95■■□□□ 1.26
SPI1-201ENST00000227163 SIX4Q9UIU6 781 aa22.95■■□□□ 1.26
SPI1-201ENST00000227163 GTF3C4Q9UKN8 822 aa22.95■■□□□ 1.26
SPI1-201ENST00000227163 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa22.94■■□□□ 1.26
SPI1-201ENST00000227163 ZNF233A6NK53 670 aa22.94■■□□□ 1.26
SPI1-201ENST00000227163 ASIC1P78348 528 aa22.94■■□□□ 1.26
SPI1-201ENST00000227163 CFAP221Q4G0U5 840 aa22.94■■□□□ 1.26
SPI1-201ENST00000227163 OSTM1Q86WC4 334 aa22.94■■□□□ 1.26
SPI1-201ENST00000227163 CPA6Q8N4T0 437 aa22.94■■□□□ 1.26
SPI1-201ENST00000227163 FSIP1Q8NA03 581 aa22.94■■□□□ 1.26
SPI1-201ENST00000227163 HPDLQ96IR7 371 aa22.94■■□□□ 1.26
SPI1-201ENST00000227163 SYT15Q9BQS2 421 aa22.94■■□□□ 1.26
SPI1-201ENST00000227163 CUEDC2Q9H467 287 aa22.94■■□□□ 1.26
SPI1-201ENST00000227163 INTS13Q9NVM9 706 aa22.94■■□□□ 1.26
SPI1-201ENST00000227163 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
SPI1-201ENST00000227163 ATG13O75143 517 aa22.93■■□□□ 1.26
SPI1-201ENST00000227163 AMPD3Q01432 767 aa22.93■■□□□ 1.26
SPI1-201ENST00000227163 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
SPI1-201ENST00000227163 KCNB1Q14721 858 aa22.93■■□□□ 1.26
SPI1-201ENST00000227163 MTF1Q14872 753 aa22.93■■□□□ 1.26
SPI1-201ENST00000227163 TMEM196Q5HYL7 178 aa22.93■■□□□ 1.26
SPI1-201ENST00000227163 CBWD2Q8IUF1 395 aa22.93■■□□□ 1.26
SPI1-201ENST00000227163 CXorf38Q8TB03 319 aa22.93■■□□□ 1.26
SPI1-201ENST00000227163 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
SPI1-201ENST00000227163 PKMYT1Q99640 499 aa22.93■■□□□ 1.26
SPI1-201ENST00000227163 RTKNQ9BST9 563 aa22.93■■□□□ 1.26
SPI1-201ENST00000227163 HSPBP1Q9NZL4 362 aa22.93■■□□□ 1.26
SPI1-201ENST00000227163 PTPRJQ12913 1337 aa22.92■■□□□ 1.26
SPI1-201ENST00000227163 SPTLC2O15270 562 aa22.92■■□□□ 1.26
SPI1-201ENST00000227163 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP22.92■■□□□ 1.26
SPI1-201ENST00000227163 TADA3O75528 432 aa22.92■■□□□ 1.26
SPI1-201ENST00000227163 USP17L7P0C7H9 530 aa22.92■■□□□ 1.26
SPI1-201ENST00000227163 ARSAP15289 507 aa22.92■■□□□ 1.26
SPI1-201ENST00000227163 HOXA6P31267 233 aa22.92■■□□□ 1.26
SPI1-201ENST00000227163 IFNAR2P48551 515 aa22.92■■□□□ 1.26
SPI1-201ENST00000227163 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
SPI1-201ENST00000227163 FAM160A1Q05DH4 1040 aa22.92■■□□□ 1.26
SPI1-201ENST00000227163 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
SPI1-201ENST00000227163 CCDC142Q17RM4 750 aa22.92■■□□□ 1.26
SPI1-201ENST00000227163 DUOXA2Q1HG44 320 aa22.92■■□□□ 1.26
SPI1-201ENST00000227163 SOWAHAQ2M3V2 549 aa22.92■■□□□ 1.26
SPI1-201ENST00000227163 NETO1Q8TDF5 533 aa22.92■■□□□ 1.26
SPI1-201ENST00000227163 DHX58Q96C10 678 aa22.92■■□□□ 1.26
SPI1-201ENST00000227163 MYRFLQ96LU7 910 aa22.92■■□□□ 1.26
SPI1-201ENST00000227163 KIAA1586Q9HCI6 787 aa22.92■■□□□ 1.26
SPI1-201ENST00000227163 C2orf42Q9NWW7 574 aa22.92■■□□□ 1.26
SPI1-201ENST00000227163 SLC8A2Q9UPR5 921 aa22.92■■□□□ 1.26
SPI1-201ENST00000227163 GABRDO14764 452 aa22.91■■□□□ 1.26
SPI1-201ENST00000227163 HRO43593 1189 aa22.91■■□□□ 1.26
SPI1-201ENST00000227163 HCRTO43612 131 aa22.91■■□□□ 1.26
SPI1-201ENST00000227163 TGM1P22735 817 aa22.91■■□□□ 1.26
SPI1-201ENST00000227163 ANXA13P27216 316 aa22.91■■□□□ 1.26
SPI1-201ENST00000227163 MAGEA11P43364 429 aa22.91■■□□□ 1.26
SPI1-201ENST00000227163 PDE6CP51160 858 aa22.91■■□□□ 1.26
SPI1-201ENST00000227163 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
SPI1-201ENST00000227163 FSTL4Q6MZW2 842 aa22.91■■□□□ 1.26
SPI1-201ENST00000227163 WDR5BQ86VZ2 330 aa22.91■■□□□ 1.26
SPI1-201ENST00000227163 WDR49Q8IV35 697 aa22.91■■□□□ 1.26
SPI1-201ENST00000227163 LINC00301Q8NCQ3 95 aa22.91■■□□□ 1.26
SPI1-201ENST00000227163 OR5B17Q8NGF7 314 aa22.91■■□□□ 1.26
SPI1-201ENST00000227163 ATP2A3Q93084 1043 aa22.91■■□□□ 1.26
SPI1-201ENST00000227163 HPS3Q969F9 1004 aa22.91■■□□□ 1.26
SPI1-201ENST00000227163 MYLPFQ96A32 169 aa22.91■■□□□ 1.26
SPI1-201ENST00000227163 TRIM9Q9C026 710 aa22.91■■□□□ 1.26
SPI1-201ENST00000227163 SEMA4GQ9NTN9 838 aa22.91■■□□□ 1.26
SPI1-201ENST00000227163 CDH9Q9ULB4 789 aa22.91■■□□□ 1.26
SPI1-201ENST00000227163 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
SPI1-201ENST00000227163 UBE4BO95155 1302 aa22.9■■□□□ 1.26
SPI1-201ENST00000227163 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
SPI1-201ENST00000227163 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
SPI1-201ENST00000227163 USP4Q13107 963 aa22.9■■□□□ 1.26
SPI1-201ENST00000227163 FAM26FQ5R3K3 315 aa22.9■■□□□ 1.26
SPI1-201ENST00000227163 DPH6Q7L8W6 267 aa22.9■■□□□ 1.26
SPI1-201ENST00000227163 IQUBQ8NA54 791 aa22.9■■□□□ 1.26
SPI1-201ENST00000227163 GLIS3Q8NEA6 775 aa22.9■■□□□ 1.26
SPI1-201ENST00000227163 FNBP1Q96RU3 617 aa22.9■■□□□ 1.26
SPI1-201ENST00000227163 MMS19Q96T76 1030 aa22.9■■□□□ 1.26
SPI1-201ENST00000227163 P2RY13Q9BPV8 354 aa22.9■■□□□ 1.26
SPI1-201ENST00000227163 KBTBD4Q9NVX7 518 aa22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.5 ms