RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000223129.8

RPA3-201, Transcript of replication protein A3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RPA3, Length 2,020 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA3-201ENST00000223129 CYP26A1O43174 497 aa15.94■□□□□ 0.14
RPA3-201ENST00000223129 TBX10O75333 385 aa15.94■□□□□ 0.14
RPA3-201ENST00000223129 C8AP07357 584 aa15.94■□□□□ 0.14
RPA3-201ENST00000223129 CD19P15391 556 aa15.94■□□□□ 0.14
RPA3-201ENST00000223129 RFX1P22670 979 aa15.94■□□□□ 0.14
RPA3-201ENST00000223129 ADORA2BP29275 332 aa15.94■□□□□ 0.14
RPA3-201ENST00000223129 LTBRP36941 435 aa15.94■□□□□ 0.14
RPA3-201ENST00000223129 SMARCB1Q12824 385 aa15.94■□□□□ 0.14
RPA3-201ENST00000223129 MGAT5BQ3V5L5 792 aa15.94■□□□□ 0.14
RPA3-201ENST00000223129 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa15.94■□□□□ 0.14
RPA3-201ENST00000223129 C4orf50Q6ZRC1 276 aa15.94■□□□□ 0.14
RPA3-201ENST00000223129 TCEAL8Q8IYN2 117 aa15.94■□□□□ 0.14
RPA3-201ENST00000223129 FUKQ8N0W3 1084 aa15.94■□□□□ 0.14
RPA3-201ENST00000223129 SPPL2BQ8TCT7 592 aa15.94■□□□□ 0.14
RPA3-201ENST00000223129 TFAP2BQ92481 460 aa15.94■□□□□ 0.14
RPA3-201ENST00000223129 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
RPA3-201ENST00000223129 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
RPA3-201ENST00000223129 MED10Q9BTT4 135 aa15.94■□□□□ 0.14
RPA3-201ENST00000223129 APOL5Q9BWW9 433 aa15.94■□□□□ 0.14
RPA3-201ENST00000223129 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa15.94■□□□□ 0.14
RPA3-201ENST00000223129 SPDYE4A6NLX3 237 aa15.94■□□□□ 0.14
RPA3-201ENST00000223129 F8VZ95 297 aa15.94■□□□□ 0.14
RPA3-201ENST00000223129 C1RP00736 705 aa15.94■□□□□ 0.14
RPA3-201ENST00000223129 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
RPA3-201ENST00000223129 CLCN1P35523 988 aa15.94■□□□□ 0.14
RPA3-201ENST00000223129 GPR15P49685 360 aa15.94■□□□□ 0.14
RPA3-201ENST00000223129 CACNA2D1P54289 1103 aa15.94■□□□□ 0.14
RPA3-201ENST00000223129 JAM2P57087 298 aa15.94■□□□□ 0.14
RPA3-201ENST00000223129 LIN9Q5TKA1 542 aa15.94■□□□□ 0.14
RPA3-201ENST00000223129 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa15.94■□□□□ 0.14
RPA3-201ENST00000223129 FAM71AQ8IYT1 594 aa15.94■□□□□ 0.14
RPA3-201ENST00000223129 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
RPA3-201ENST00000223129 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
RPA3-201ENST00000223129 SPAG5Q96R06 1193 aa15.94■□□□□ 0.14
RPA3-201ENST00000223129 ZSWIM1Q9BR11 485 aa15.94■□□□□ 0.14
RPA3-201ENST00000223129 CEP72Q9P209 647 aa15.94■□□□□ 0.14
RPA3-201ENST00000223129 NCK2O43639 380 aa15.93■□□□□ 0.14
RPA3-201ENST00000223129 PAEPP09466 180 aa15.93■□□□□ 0.14
RPA3-201ENST00000223129 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
RPA3-201ENST00000223129 BRD2P25440 801 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
RPA3-201ENST00000223129 COL19A1Q14993 1142 aa15.93■□□□□ 0.14
RPA3-201ENST00000223129 CFAP221Q4G0U5 840 aa15.93■□□□□ 0.14
RPA3-201ENST00000223129 SDHAF4Q5VUM1 108 aa15.93■□□□□ 0.14
RPA3-201ENST00000223129 ANKRD54Q6NXT1 300 aa15.93■□□□□ 0.14
RPA3-201ENST00000223129 CPLX3Q8WVH0 158 aa15.93■□□□□ 0.14
RPA3-201ENST00000223129 TTYH3Q9C0H2 523 aa15.93■□□□□ 0.14
RPA3-201ENST00000223129 TMEM30AQ9NV96 361 aa15.93■□□□□ 0.14
RPA3-201ENST00000223129 INSL5Q9Y5Q6 135 aa15.93■□□□□ 0.14
RPA3-201ENST00000223129 FSD2A1L4K1 749 aa15.92■□□□□ 0.14
RPA3-201ENST00000223129 ZMYND10O75800 440 aa15.92■□□□□ 0.14
RPA3-201ENST00000223129 GFPT2O94808 682 aa15.92■□□□□ 0.14
RPA3-201ENST00000223129 VDRP11473 427 aa15.92■□□□□ 0.14
RPA3-201ENST00000223129 TWF1Q12792 350 aa15.92■□□□□ 0.14
RPA3-201ENST00000223129 DDR2Q16832 855 aa15.92■□□□□ 0.14
RPA3-201ENST00000223129 SGO2Q562F6 1265 aa15.92■□□□□ 0.14
RPA3-201ENST00000223129 PPM1LQ5SGD2 360 aa15.92■□□□□ 0.14
RPA3-201ENST00000223129 SYCE2Q6PIF2 218 aa15.92■□□□□ 0.14
RPA3-201ENST00000223129 TMC5Q6UXY8 1006 aa15.92■□□□□ 0.14
RPA3-201ENST00000223129 CCDC149Q6ZUS6 474 aa15.92■□□□□ 0.14
RPA3-201ENST00000223129 FAM35AQ86V20 835 aa15.92■□□□□ 0.14
RPA3-201ENST00000223129 SLC47A2Q86VL8 602 aa15.92■□□□□ 0.14
RPA3-201ENST00000223129 VSTM4Q8IW00 320 aa15.92■□□□□ 0.14
RPA3-201ENST00000223129 SCN4BQ8IWT1 228 aa15.92■□□□□ 0.14
RPA3-201ENST00000223129 STKLD1Q8NE28 680 aa15.92■□□□□ 0.14
RPA3-201ENST00000223129 GPR152Q8TDT2 470 aa15.92■□□□□ 0.14
RPA3-201ENST00000223129 HDAC7Q8WUI4 952 aa15.92■□□□□ 0.14
RPA3-201ENST00000223129 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP15.92■□□□□ 0.14
RPA3-201ENST00000223129 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
RPA3-201ENST00000223129 DNAI2Q9GZS0 605 aa15.92■□□□□ 0.14
RPA3-201ENST00000223129 YIPF1Q9Y548 306 aa15.92■□□□□ 0.14
RPA3-201ENST00000223129 PTPRDP23468 1912 aa15.92■□□□□ 0.14
RPA3-201ENST00000223129 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa15.92■□□□□ 0.14
RPA3-201ENST00000223129 CCL16O15467 120 aa15.92■□□□□ 0.14
RPA3-201ENST00000223129 BEST1O76090 585 aa15.92■□□□□ 0.14
RPA3-201ENST00000223129 GRIK1P39086 918 aa15.92■□□□□ 0.14
RPA3-201ENST00000223129 ZNF75DP51815 510 aa15.92■□□□□ 0.14
RPA3-201ENST00000223129 CLUL1Q15846 466 aa15.92■□□□□ 0.14
RPA3-201ENST00000223129 BAP1Q92560 729 aa15.92■□□□□ 0.14
RPA3-201ENST00000223129 KCNK16Q96T55 309 aa15.92■□□□□ 0.14
RPA3-201ENST00000223129 ABCB6Q9NP58 842 aa15.92■□□□□ 0.14
RPA3-201ENST00000223129 DPP7Q9UHL4 492 aa15.92■□□□□ 0.14
RPA3-201ENST00000223129 CDH22Q9UJ99 828 aa15.92■□□□□ 0.14
RPA3-201ENST00000223129 MAFFQ9ULX9 164 aa15.92■□□□□ 0.14
RPA3-201ENST00000223129 H3BQ06 376 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
RPA3-201ENST00000223129 SRGAP2BP0DMP2 458 aa15.91■□□□□ 0.14
RPA3-201ENST00000223129 ATF6P18850 670 aa15.91■□□□□ 0.14
RPA3-201ENST00000223129 GNA15P30679 374 aa15.91■□□□□ 0.14
RPA3-201ENST00000223129 SOX5P35711 763 aa15.91■□□□□ 0.14
RPA3-201ENST00000223129 STAT1P42224 750 aa15.91■□□□□ 0.14
RPA3-201ENST00000223129 TUFMP49411 452 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
RPA3-201ENST00000223129 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
RPA3-201ENST00000223129 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa15.91■□□□□ 0.14
RPA3-201ENST00000223129 GIPC2Q8TF65 315 aa15.91■□□□□ 0.14
RPA3-201ENST00000223129 NUP58Q9BVL2 599 aa15.91■□□□□ 0.14
RPA3-201ENST00000223129 PRDM6Q9NQX0 595 aa15.91■□□□□ 0.14
RPA3-201ENST00000223129 KRT82Q9NSB4 513 aa15.91■□□□□ 0.14
RPA3-201ENST00000223129 DZANK1Q9NVP4 752 aa15.91■□□□□ 0.14
RPA3-201ENST00000223129 HSFX1Q9UBD0 423 aa15.91■□□□□ 0.14
RPA3-201ENST00000223129 TSPAN16Q9UKR8 245 aa15.91■□□□□ 0.14
RPA3-201ENST00000223129 KIAA1257Q9ULG3 409 aa15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.4 ms