RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000089378.4

Sh3bp1-203, Transcript of SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Sh3bp1, Length 2,001 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Svs3aF2Z472 265 aa22.09■■□□□ 1.13
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 F6Y6L6 278 aa22.09■■□□□ 1.13
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm3371F7CQW8 167 aa22.09■■□□□ 1.13
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Serpinb2P12388 415 aa22.09■■□□□ 1.13
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Slc1a2P43006 572 aa22.09■■□□□ 1.13
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ptprn2P80560 1001 aa22.09■■□□□ 1.13
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 SelpQ01102 768 aa22.09■■□□□ 1.13
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cdc14aQ6GQT0 603 aa22.09■■□□□ 1.13
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Sec23ipQ6NZC7 998 aa22.09■■□□□ 1.13
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Crybg3Q80W49 1005 aa22.09■■□□□ 1.13
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Vmn2r43Q80Z08 845 aa22.09■■□□□ 1.13
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Svs3bQ8BZH8 265 aa22.09■■□□□ 1.13
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ccdc186Q8C9S4 917 aa22.09■■□□□ 1.13
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ppp1r16bQ8VHQ3 568 aa22.09■■□□□ 1.13
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Pcdha10Q91Y20 946 aa22.09■■□□□ 1.13
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Rtfdc1Q99K95 307 aa22.09■■□□□ 1.13
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Mcrs1Q99L90 462 aa22.09■■□□□ 1.13
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Znf654Q9DAU9 571 aa22.09■■□□□ 1.13
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Bub1bQ9Z1S0 1052 aa22.09■■□□□ 1.13
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ssxb9A2BI93 185 aa22.09■■□□□ 1.13
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ccdc170D3YXL0 722 aa22.09■■□□□ 1.13
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Lrrc10bG3XA50 292 aa22.09■■□□□ 1.13
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Chrna1P04756 457 aa22.09■■□□□ 1.13
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Psmc4P54775 418 aa22.09■■□□□ 1.13
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 InscQ3HNM7 579 aa22.09■■□□□ 1.13
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Fam81aQ3UXZ6 364 aa22.09■■□□□ 1.13
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Celf6Q7TN33 460 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ubap2lQ80X50 1107 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Olfr397Q8VEZ6 315 aa22.09■■□□□ 1.13
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 PirQ9D711 290 aa22.09■■□□□ 1.13
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ppp1r12aQ9DBR7 1029 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Htra2Q9JIY5 458 aa22.09■■□□□ 1.13
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Per2O54943 1257 aa22.08■■□□□ 1.13
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Tspyl1O88852 379 aa22.08■■□□□ 1.13
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cdca2Q14B71 982 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ccdc33Q3ULW6 985 aa22.08■■□□□ 1.13
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Krt77Q6IFZ6 572 aa22.08■■□□□ 1.13
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Slc9a4Q8BUE1 797 aa22.08■■□□□ 1.13
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Rin1Q921Q7 763 aa22.08■■□□□ 1.13
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Golga1Q9CW79 758 aa22.08■■□□□ 1.13
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Sf3a3Q9D554 501 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 PigoQ9JJI6 1093 aa22.08■■□□□ 1.13
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ank3G5E8K5 1961 aa22.08■■□□□ 1.12
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Apold1E9Q0X2 246 aa22.07■■□□□ 1.12
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Tlk2O55047 718 aa22.07■■□□□ 1.12
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Zfp42P22227 288 aa22.07■■□□□ 1.12
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gjb1P28230 283 aa22.07■■□□□ 1.12
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Sesn2P58043 480 aa22.07■■□□□ 1.12
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ccndbp1Q3TVC7 356 aa22.07■■□□□ 1.12
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Hace1Q3U0D9 909 aa22.07■■□□□ 1.12
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ifnl2Q4VK74 193 aa22.07■■□□□ 1.12
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Icam5Q60625 917 aa22.07■■□□□ 1.12
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Klhl17Q6TDP3 640 aa22.07■■□□□ 1.12
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cdkn2aipQ8BI72 563 aa22.07■■□□□ 1.12
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 RbakQ8BQC8 711 aa22.07■■□□□ 1.12
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 CgasQ8C6L5 507 aa22.07■■□□□ 1.12
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Tk2Q9R088 270 aa22.07■■□□□ 1.12
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm28360A0A087WR25 190 aa22.07■■□□□ 1.12
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ms4a14A0A087WSD2 1232 aa22.07■■□□□ 1.12
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Capn6O35646 641 aa22.07■■□□□ 1.12
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Hoxb8P09632 243 aa22.07■■□□□ 1.12
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Eno1P17182 434 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 RarbP22605 482 aa22.07■■□□□ 1.12
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Arf4P61750 180 aa22.07■■□□□ 1.12
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Mylk3Q3UIZ8 795 aa22.07■■□□□ 1.12
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Znf185Q62394 352 aa22.07■■□□□ 1.12
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ugt1a1Q63886 535 aa22.07■■□□□ 1.12
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Npdc1Q64322 332 aa22.07■■□□□ 1.12
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gemin4Q6P6L6 1058 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Kif11Q6P9P6 1052 aa22.07■■□□□ 1.12
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 MogsQ80UM7 834 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Kctd15Q8K0E1 283 aa22.07■■□□□ 1.12
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Trps1Q925H1 1281 aa22.07■■□□□ 1.12
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Elp3Q9CZX0 547 aa22.07■■□□□ 1.12
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 IqcdQ9D3V1 458 aa22.07■■□□□ 1.12
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Nop56Q9D6Z1 580 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 AmhP27106 555 aa22.06■■□□□ 1.12
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Rab21P35282 222 aa22.06■■□□□ 1.12
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ect2Q07139 913 aa22.06■■□□□ 1.12
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Pnpla5Q32LZ8 432 aa22.06■■□□□ 1.12
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Mphosph8Q3TYA6 858 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Serpinb6Q60854 378 aa22.06■■□□□ 1.12
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Tspan18Q80WR1 248 aa22.06■■□□□ 1.12
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Slc45a1Q8BIV7 751 aa22.06■■□□□ 1.12
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Aldh5a1Q8BWF0 523 aa22.06■■□□□ 1.12
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Mettl24Q8CCB5 363 aa22.06■■□□□ 1.12
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 CarfQ8VHI4 689 aa22.06■■□□□ 1.12
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 MutyhQ99P21 515 aa22.06■■□□□ 1.12
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Akt3Q9WUA6 479 aa22.06■■□□□ 1.12
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Scn1aA2APX8 2009 aa22.06■■□□□ 1.12
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 UtrnE9Q6R7 3430 aa22.06■■□□□ 1.12
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Trpm7Q923J1 1863 aa22.06■■□□□ 1.12
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ppargc1aO70343 797 aa22.06■■□□□ 1.12
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Mark2Q05512 776 aa22.06■■□□□ 1.12
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Znf112Q0VAW7 879 aa22.06■■□□□ 1.12
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Drc1Q3USS3 753 aa22.06■■□□□ 1.12
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Itga1Q3V3R4 1179 aa22.06■■□□□ 1.12
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Q6GQV0 436 aa22.06■■□□□ 1.12
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Rsl1d1Q8BVY0 452 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Abcf3Q8K268 709 aa22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 25.9 ms