RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000086471.11

Suds3-201, Transcript of Sin3 histone deacetylase corepressor complex component SDS3, mousemouse

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene Suds3, Length 2,425 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Suds3-201ENSMUST00000086471 Pyhin1Q8BV49 420 aa24.39■■□□□ 1.49
Suds3-201ENSMUST00000086471 Vmn1r64Q8R2B8 320 aa24.39■■□□□ 1.49
Suds3-201ENSMUST00000086471 Olfr1502Q8VG66 316 aa24.39■■□□□ 1.49
Suds3-201ENSMUST00000086471 Lekr1B2RVN1 116 aa24.38■■□□□ 1.49
Suds3-201ENSMUST00000086471 Metap1Q8BP48 386 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
Suds3-201ENSMUST00000086471 Sbk1Q8QZX0 417 aa24.38■■□□□ 1.49
Suds3-201ENSMUST00000086471 Q9CQC3 228 aa24.38■■□□□ 1.49
Suds3-201ENSMUST00000086471 Rnf135Q9CWS1 417 aa24.38■■□□□ 1.49
Suds3-201ENSMUST00000086471 Fam212aQ9CX62 282 aa24.38■■□□□ 1.49
Suds3-201ENSMUST00000086471 Nme7Q9QXL8 395 aa24.38■■□□□ 1.49
Suds3-201ENSMUST00000086471 Pcsk1nQ9QXV0 258 aa24.38■■□□□ 1.49
Suds3-201ENSMUST00000086471 Cntnap4Q99P47 1310 aa24.38■■□□□ 1.49
Suds3-201ENSMUST00000086471 Myl1P05977 188 aa24.37■■□□□ 1.49
Suds3-201ENSMUST00000086471 Abcb1bP06795 1276 aa24.37■■□□□ 1.49
Suds3-201ENSMUST00000086471 Cyp2b9P12790 491 aa24.37■■□□□ 1.49
Suds3-201ENSMUST00000086471 Itgb7P26011 806 aa24.37■■□□□ 1.49
Suds3-201ENSMUST00000086471 Olfr1046Q7TR79 316 aa24.37■■□□□ 1.49
Suds3-201ENSMUST00000086471 Zdhhc19Q810M5 347 aa24.37■■□□□ 1.49
Suds3-201ENSMUST00000086471 Ppm1kQ8BXN7 372 aa24.37■■□□□ 1.49
Suds3-201ENSMUST00000086471 Pak2Q8CIN4 524 aa24.37■■□□□ 1.49
Suds3-201ENSMUST00000086471 Ulbp1Q8HWA3 334 aa24.37■■□□□ 1.49
Suds3-201ENSMUST00000086471 Mrpl4Q9DCU6 294 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
Suds3-201ENSMUST00000086471 Edf1Q9JMG1 148 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
Suds3-201ENSMUST00000086471 Nr1h3Q9Z0Y9 445 aa24.37■■□□□ 1.49
Suds3-201ENSMUST00000086471 Gm15262A0A140LIQ5 728 aa24.37■■□□□ 1.49
Suds3-201ENSMUST00000086471 Olfr1305A2AVW3 312 aa24.37■■□□□ 1.49
Suds3-201ENSMUST00000086471 Rdh7O88451 316 aa24.37■■□□□ 1.49
Suds3-201ENSMUST00000086471 Acsbg2Q2XU92 667 aa24.37■■□□□ 1.49
Suds3-201ENSMUST00000086471 Cfhr2Q4LDF6 332 aa24.37■■□□□ 1.49
Suds3-201ENSMUST00000086471 Arhgap11aQ80Y19 987 aa24.37■■□□□ 1.49
Suds3-201ENSMUST00000086471 Lrsam1Q80ZI6 727 aa24.37■■□□□ 1.49
Suds3-201ENSMUST00000086471 Trim6Q8BGE7 488 aa24.37■■□□□ 1.49
Suds3-201ENSMUST00000086471 Micall1Q8BGT6 870 aa24.37■■□□□ 1.49
Suds3-201ENSMUST00000086471 Mob2Q8VI63 235 aa24.37■■□□□ 1.49
Suds3-201ENSMUST00000086471 Tmem86aQ9D8N3 241 aa24.37■■□□□ 1.49
Suds3-201ENSMUST00000086471 Bpifb9bA2AJD1 591 aa24.36■■□□□ 1.49
Suds3-201ENSMUST00000086471 Gm10720D3Z1I5 223 aa24.36■■□□□ 1.49
Suds3-201ENSMUST00000086471 Apol11aE9PZG0 334 aa24.36■■□□□ 1.49
Suds3-201ENSMUST00000086471 Slc6a20bO88575 635 aa24.36■■□□□ 1.49
Suds3-201ENSMUST00000086471 Vps41Q5KU39 853 aa24.36■■□□□ 1.49
Suds3-201ENSMUST00000086471 Dusp11Q6NXK5 321 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
Suds3-201ENSMUST00000086471 Bpifb9aQ80XI7 591 aa24.36■■□□□ 1.49
Suds3-201ENSMUST00000086471 Fam155aQ8CCS2 467 aa24.36■■□□□ 1.49
Suds3-201ENSMUST00000086471 Olfr1352Q8VGX5 309 aa24.36■■□□□ 1.49
Suds3-201ENSMUST00000086471 Gabbr1Q9WV18 960 aa24.36■■□□□ 1.49
Suds3-201ENSMUST00000086471 Tbkbp1A2A9T0 611 aa24.36■■□□□ 1.49
Suds3-201ENSMUST00000086471 Gm13128L7MU96 475 aa24.36■■□□□ 1.49
Suds3-201ENSMUST00000086471 Zfpm1O35615 995 aa24.36■■□□□ 1.49
Suds3-201ENSMUST00000086471 P01650 108 aa24.36■■□□□ 1.49
Suds3-201ENSMUST00000086471 P01653 108 aa24.36■■□□□ 1.49
Suds3-201ENSMUST00000086471 Vav1P27870 845 aa24.36■■□□□ 1.49
Suds3-201ENSMUST00000086471 Ptk2P34152 1090 aa24.36■■□□□ 1.49
Suds3-201ENSMUST00000086471 Rbm20Q3UQS8 1199 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
Suds3-201ENSMUST00000086471 Vps51Q3UVL4 782 aa24.36■■□□□ 1.49
Suds3-201ENSMUST00000086471 Dact1Q8R4A3 778 aa24.36■■□□□ 1.49
Suds3-201ENSMUST00000086471 Lpin3Q99PI4 848 aa24.36■■□□□ 1.49
Suds3-201ENSMUST00000086471 Chordc1Q9D1P4 331 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
Suds3-201ENSMUST00000086471 Wdr83Q9DAJ4 315 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
Suds3-201ENSMUST00000086471 Trim30bE9PVL6 203 aa24.35■■□□□ 1.49
Suds3-201ENSMUST00000086471 Gm5926E9PWJ8 236 aa24.35■■□□□ 1.49
Suds3-201ENSMUST00000086471 Gm3739L7N296 216 aa24.35■■□□□ 1.49
Suds3-201ENSMUST00000086471 Gdf6P43028 454 aa24.35■■□□□ 1.49
Suds3-201ENSMUST00000086471 Sppl2bQ3TD49 578 aa24.35■■□□□ 1.49
Suds3-201ENSMUST00000086471 Lrrc4cQ8C031 640 aa24.35■■□□□ 1.49
Suds3-201ENSMUST00000086471 Ankrd54Q91WK7 299 aa24.35■■□□□ 1.49
Suds3-201ENSMUST00000086471 Clstn3Q99JH7 956 aa24.35■■□□□ 1.49
Suds3-201ENSMUST00000086471 Mcrs1Q99L90 462 aa24.35■■□□□ 1.49
Suds3-201ENSMUST00000086471 ArpinQ9D0A3 226 aa24.35■■□□□ 1.49
Suds3-201ENSMUST00000086471 Dydc1Q9D9T0 175 aa24.35■■□□□ 1.49
Suds3-201ENSMUST00000086471 Gm13276A0A087WR18 182 aa24.35■■□□□ 1.49
Suds3-201ENSMUST00000086471 Vmn2r1O70410 912 aa24.35■■□□□ 1.49
Suds3-201ENSMUST00000086471 Rasgrf1P27671 1262 aa24.35■■□□□ 1.49
Suds3-201ENSMUST00000086471 Usp4P35123 962 aa24.35■■□□□ 1.49
Suds3-201ENSMUST00000086471 Slitrk1Q810C1 696 aa24.35■■□□□ 1.49
Suds3-201ENSMUST00000086471 Uba6Q8C7R4 1053 aa24.35■■□□□ 1.49
Suds3-201ENSMUST00000086471 MrgpreQ91ZB7 310 aa24.35■■□□□ 1.49
Suds3-201ENSMUST00000086471 Fam122aQ9DB52 284 aa24.35■■□□□ 1.49
Suds3-201ENSMUST00000086471 ParvaQ9EPC1 372 aa24.35■■□□□ 1.49
Suds3-201ENSMUST00000086471 Bnip3lQ9Z2F7 218 aa24.35■■□□□ 1.49
Suds3-201ENSMUST00000086471 AlpiF8VPQ6 554 aa24.34■■□□□ 1.49
Suds3-201ENSMUST00000086471 Olfr356Q8VFP5 315 aa24.34■■□□□ 1.49
Suds3-201ENSMUST00000086471 Zcchc14Q8VIG0 956 aa24.34■■□□□ 1.49
Suds3-201ENSMUST00000086471 Fuca2Q99KR8 461 aa24.34■■□□□ 1.49
Suds3-201ENSMUST00000086471 TfgQ9Z1A1 397 aa24.34■■□□□ 1.49
Suds3-201ENSMUST00000086471 Trim12cD3Z3L3 497 aa24.34■■□□□ 1.49
Suds3-201ENSMUST00000086471 Fgf15O35622 218 aa24.34■■□□□ 1.49
Suds3-201ENSMUST00000086471 CcnoP0C242 352 aa24.34■■□□□ 1.49
Suds3-201ENSMUST00000086471 Nr2c2P49117 596 aa24.34■■□□□ 1.49
Suds3-201ENSMUST00000086471 Pick1Q62083 416 aa24.34■■□□□ 1.49
Suds3-201ENSMUST00000086471 Znf512Q69Z99 562 aa24.34■■□□□ 1.49
Suds3-201ENSMUST00000086471 Gpsm1Q6IR34 673 aa24.34■■□□□ 1.49
Suds3-201ENSMUST00000086471 March4Q80TE3 409 aa24.34■■□□□ 1.49
Suds3-201ENSMUST00000086471 Cct8l1Q80YT3 562 aa24.34■■□□□ 1.49
Suds3-201ENSMUST00000086471 Efl1Q8C0D5 1127 aa24.34■■□□□ 1.49
Suds3-201ENSMUST00000086471 Dpp3Q99KK7 738 aa24.34■■□□□ 1.49
Suds3-201ENSMUST00000086471 Anapc7Q9WVM3 565 aa24.34■■□□□ 1.49
Suds3-201ENSMUST00000086471 Hoxd10P28359 340 aa24.33■■□□□ 1.49
Suds3-201ENSMUST00000086471 Stmn1P54227 149 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.49
Suds3-201ENSMUST00000086471 Gabrb2P63137 512 aa24.33■■□□□ 1.49
Suds3-201ENSMUST00000086471 Tspyl3Q3UYP3 334 aa24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 18.4 ms