RNA–Protein interactions for RNA: tT(AGU)B

tT(AGU)B, Transcript of Threonine tRNA (tRNA-Thr), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tT(AGU)B, Length 73 nt, Biotype tRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tT(AGU)BtT(AGU)B MRPL20P22354 195 aaPredicted RBP0.5□□□□□ -2.33
tT(AGU)BtT(AGU)B SPO13P23624 291 aa0.5□□□□□ -2.33
tT(AGU)BtT(AGU)B TIP1P27654 210 aaPredicted RBP0.5□□□□□ -2.33
tT(AGU)BtT(AGU)B AGA1P32323 725 aa0.5□□□□□ -2.33
tT(AGU)BtT(AGU)B HMX1P32339 317 aa0.5□□□□□ -2.33
tT(AGU)BtT(AGU)B QRI5P32344 111 aa0.5□□□□□ -2.33
tT(AGU)BtT(AGU)B PHD1P36093 366 aa0.5□□□□□ -2.33
tT(AGU)BtT(AGU)B DER1P38307 211 aa0.5□□□□□ -2.33
tT(AGU)BtT(AGU)B TRS20P38334 175 aa0.5□□□□□ -2.33
tT(AGU)BtT(AGU)B SHG1P38337 142 aa0.5□□□□□ -2.33
tT(AGU)BtT(AGU)B YBR292CP38357 123 aa0.5□□□□□ -2.33
tT(AGU)BtT(AGU)B PAU13P38725 120 aa0.5□□□□□ -2.33
tT(AGU)BtT(AGU)B YHR022CP38763 256 aa0.5□□□□□ -2.33
tT(AGU)BtT(AGU)B VMA22P38784 181 aa0.5□□□□□ -2.33
tT(AGU)BtT(AGU)B KRE9P39005 276 aa0.5□□□□□ -2.33
tT(AGU)BtT(AGU)B MBB1P39534 108 aa0.5□□□□□ -2.33
tT(AGU)BtT(AGU)B MST28P39552 234 aa0.5□□□□□ -2.33
tT(AGU)BtT(AGU)B RRT13P40042 185 aa0.5□□□□□ -2.33
tT(AGU)BtT(AGU)B YER135CP40082 130 aa0.5□□□□□ -2.33
tT(AGU)BtT(AGU)B YMR141CP40211 102 aa0.5□□□□□ -2.33
tT(AGU)BtT(AGU)B PRE5P40302 234 aaKnown RBP0.5□□□□□ -2.33
tT(AGU)BtT(AGU)B CYB5P40312 120 aa0.5□□□□□ -2.33
tT(AGU)BtT(AGU)B SIM1P40472 476 aa0.5□□□□□ -2.33
tT(AGU)BtT(AGU)B RPR2P40571 144 aa0.5□□□□□ -2.33
tT(AGU)BtT(AGU)B ATG27P46989 271 aa0.5□□□□□ -2.33
tT(AGU)BtT(AGU)B COX16P47081 118 aa0.5□□□□□ -2.33
tT(AGU)BtT(AGU)B PUS4P48567 403 aaKnown RBP0.5□□□□□ -2.33
tT(AGU)BtT(AGU)B PHO23P50947 330 aa0.5□□□□□ -2.33
tT(AGU)BtT(AGU)B MST27P53176 234 aa0.5□□□□□ -2.33
tT(AGU)BtT(AGU)B TIM21P53220 239 aa0.5□□□□□ -2.33
tT(AGU)BtT(AGU)B PAU4P53427 120 aa0.5□□□□□ -2.33
tT(AGU)BtT(AGU)B YNR071CP53757 342 aa0.5□□□□□ -2.33
tT(AGU)BtT(AGU)B FMP41P53889 259 aaKnown RBP0.5□□□□□ -2.33
tT(AGU)BtT(AGU)B YDR366CP87287 132 aa0.5□□□□□ -2.33
tT(AGU)BtT(AGU)B UBC7Q02159 165 aa0.5□□□□□ -2.33
tT(AGU)BtT(AGU)B PAU10Q03050 120 aa0.5□□□□□ -2.33
tT(AGU)BtT(AGU)B YMR181CQ03231 154 aa0.5□□□□□ -2.33
tT(AGU)BtT(AGU)B ADD37Q03233 198 aa0.5□□□□□ -2.33
tT(AGU)BtT(AGU)B MRPS17Q03246 237 aaPredicted RBP0.5□□□□□ -2.33
tT(AGU)BtT(AGU)B TMA23Q03525 211 aa0.5□□□□□ -2.33
tT(AGU)BtT(AGU)B YMR007WQ03675 126 aa0.5□□□□□ -2.33
tT(AGU)BtT(AGU)B SDH7Q04401 133 aa0.5□□□□□ -2.33
tT(AGU)BtT(AGU)B SHH3Q04487 196 aa0.5□□□□□ -2.33
tT(AGU)BtT(AGU)B ARC18Q05933 178 aaKnown RBP0.5□□□□□ -2.33
tT(AGU)BtT(AGU)B CTR3Q06686 241 aa0.5□□□□□ -2.33
tT(AGU)BtT(AGU)B PAU20Q08322 120 aa0.5□□□□□ -2.33
tT(AGU)BtT(AGU)B VTS1Q08831 523 aaKnown RBP RIP-Chip data0.5□□□□□ -2.33not detected
tT(AGU)BtT(AGU)B YPL162CQ12042 273 aa0.5□□□□□ -2.33
tT(AGU)BtT(AGU)B YLR122CQ12312 125 aa0.5□□□□□ -2.33
tT(AGU)BtT(AGU)B PAA1Q12447 191 aaKnown RBP0.5□□□□□ -2.33
tT(AGU)BtT(AGU)B PRM7Q12459 698 aa0.5□□□□□ -2.33
tT(AGU)BtT(AGU)B YPR145C-AQ2V2P0 78 aa0.5□□□□□ -2.33
tT(AGU)BtT(AGU)B YBR200W-AQ3E755 54 aa0.5□□□□□ -2.33
tT(AGU)BtT(AGU)B PAU9Q3E770 120 aa0.5□□□□□ -2.33
tT(AGU)BtT(AGU)B YGR240C-AQ3E786 66 aa0.5□□□□□ -2.33
tT(AGU)BtT(AGU)B TFB5Q3E7C1 72 aaPredicted RBP0.5□□□□□ -2.33
tT(AGU)BtT(AGU)B YLR342W-AQ3E810 57 aa0.5□□□□□ -2.33
tT(AGU)BtT(AGU)B YPL229WQ99395 206 aa0.5□□□□□ -2.33
tT(AGU)BtT(AGU)B URA2P07259 2214 aaKnown RBP0.5□□□□□ -2.33
tT(AGU)BtT(AGU)B YBR085C-AO43137 85 aa0.49□□□□□ -2.33
tT(AGU)BtT(AGU)B DFR1P07807 211 aaKnown RBP RIP-Chip data0.49□□□□□ -2.33not detected
tT(AGU)BtT(AGU)B RPS22AP0C0W1 130 aaKnown RBP0.49□□□□□ -2.33
tT(AGU)BtT(AGU)B HMRA1P0CY11 126 aa0.49□□□□□ -2.33
tT(AGU)BtT(AGU)B NHP6AP11632 93 aaKnown RBP0.49□□□□□ -2.33
tT(AGU)BtT(AGU)B MRPL31P14063 131 aaPredicted RBP0.49□□□□□ -2.33
tT(AGU)BtT(AGU)B CUP2P15315 225 aa0.49□□□□□ -2.33
tT(AGU)BtT(AGU)B RPB3P16370 318 aaKnown RBP0.49□□□□□ -2.33
tT(AGU)BtT(AGU)B SEC59P20048 519 aa0.49□□□□□ -2.33
tT(AGU)BtT(AGU)B ZRC1P20107 442 aa0.49□□□□□ -2.33
tT(AGU)BtT(AGU)B MAG1P22134 296 aaKnown RBP0.49□□□□□ -2.33
tT(AGU)BtT(AGU)B HSP12P22943 109 aaKnown RBP0.49□□□□□ -2.33
tT(AGU)BtT(AGU)B CNB1P25296 175 aa0.49□□□□□ -2.33
tT(AGU)BtT(AGU)B YCR023CP25351 611 aa0.49□□□□□ -2.33
tT(AGU)BtT(AGU)B POF1P25576 258 aa0.49□□□□□ -2.33
tT(AGU)BtT(AGU)B COQ3P27680 312 aa0.49□□□□□ -2.33
tT(AGU)BtT(AGU)B LDS1P31379 325 aa0.49□□□□□ -2.33
tT(AGU)BtT(AGU)B MSK1P32048 576 aa0.49□□□□□ -2.33
tT(AGU)BtT(AGU)B MRP49P32388 137 aa0.49□□□□□ -2.33
tT(AGU)BtT(AGU)B FZF1P32805 299 aa0.49□□□□□ -2.33
tT(AGU)BtT(AGU)B RPS0AP32905 252 aaKnown RBP0.49□□□□□ -2.33
tT(AGU)BtT(AGU)B TIR2P33890 251 aa0.49□□□□□ -2.33
tT(AGU)BtT(AGU)B YRA2P36036 203 aaKnown RBP RIP-Chip data0.49□□□□□ -2.33not detected
tT(AGU)BtT(AGU)B CMC1P36064 111 aa0.49□□□□□ -2.33
tT(AGU)BtT(AGU)B RPL14AP36105 138 aaKnown RBP0.49□□□□□ -2.33
tT(AGU)BtT(AGU)B YPT10P38146 199 aa0.49□□□□□ -2.33
tT(AGU)BtT(AGU)B MIX23P38162 196 aa0.49□□□□□ -2.33
tT(AGU)BtT(AGU)B RPL14BP38754 138 aaKnown RBP0.49□□□□□ -2.33
tT(AGU)BtT(AGU)B SIT1P39980 628 aa0.49□□□□□ -2.33
tT(AGU)BtT(AGU)B SNU13P39990 126 aaKnown RBP0.49□□□□□ -2.33
tT(AGU)BtT(AGU)B IRC22P40006 225 aa0.49□□□□□ -2.33
tT(AGU)BtT(AGU)B GET2P40056 285 aa0.49□□□□□ -2.33
tT(AGU)BtT(AGU)B PGD1P40356 397 aa0.49□□□□□ -2.33
tT(AGU)BtT(AGU)B YIL077CP40508 320 aa0.49□□□□□ -2.33
tT(AGU)BtT(AGU)B EMC5P40540 141 aa0.49□□□□□ -2.33
tT(AGU)BtT(AGU)B PAU15P40585 124 aa0.49□□□□□ -2.33
tT(AGU)BtT(AGU)B DAN1P47178 298 aa0.49□□□□□ -2.33
tT(AGU)BtT(AGU)B SNN1P48232 102 aa0.49□□□□□ -2.33
tT(AGU)BtT(AGU)B YPS5P53057 165 aa0.49□□□□□ -2.33
tT(AGU)BtT(AGU)B PKP2P53170 491 aa0.49□□□□□ -2.33
tT(AGU)BtT(AGU)B YGR026WP53217 278 aa0.49□□□□□ -2.33
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 13.7 ms