RNA–Protein interactions for RNA: YPL212C

PUS1, Transcript of tRNA:pseudouridine synthase, yeast

Gene PUS1, Length 1,635 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PUS1	YPL212C	SDH7	Q04401	133 aa		4.21	□□□□□ -1.73
PUS1	YPL212C	WIP1	Q2V2P8	89 aa		4.21	□□□□□ -1.73
PUS1	YPL212C	YCR024C-B	Q3E7Z8	88 aa		4.21	□□□□□ -1.73
PUS1	YPL212C	BRR2	P32639	2163 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.73
PUS1	YPL212C	YPR117W	Q06116	2489 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PUS1	YPL212C	COX2	P00410	251 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PUS1	YPL212C	TIR1	P10863	254 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PUS1	YPL212C	YCR007C	P25354	239 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PUS1	YPL212C	ZRT1	P32804	376 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PUS1	YPL212C	YBR220C	P38318	560 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PUS1	YPL212C	TEM1	P38987	245 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PUS1	YPL212C	COX18	P53239	316 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PUS1	YPL212C	MRX11	Q03079	207 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PUS1	YPL212C	FIT2	Q08906	153 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PUS1	YPL212C	TPT1	Q12272	230 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
PUS1	YPL212C	CDC39	P25655	2108 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
PUS1	YPL212C	RPL39	P04650	51 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PUS1	YPL212C	VMA16	P23968	213 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PUS1	YPL212C	YPT10	P38146	199 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PUS1	YPL212C	CSH1	P38287	376 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PUS1	YPL212C	DOG2	P38773	246 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PUS1	YPL212C	BDH1	P39714	382 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PUS1	YPL212C	MOT3	P54785	490 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
PUS1	YPL212C	NDE2	Q07500	545 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PUS1	YPL212C	PAU23	Q07987	124 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PUS1	YPL212C	CSM4	Q08955	156 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PUS1	YPL212C	PAU17	Q12370	124 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PUS1	YPL212C	MRS1	P07266	363 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PUS1	YPL212C	SEC4	P07560	215 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
PUS1	YPL212C	SFT2	P38166	215 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PUS1	YPL212C	YBR090C	P38253	122 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PUS1	YPL212C	RAV2	Q03956	351 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PUS1	YPL212C	TVP18	Q04767	167 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PUS1	YPL212C	RKI1	Q12189	258 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PUS1	YPL212C	YMR105W-A	Q8TGS8	64 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PUS1	YPL212C	GSP1	P32835	219 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
PUS1	YPL212C	GSP2	P32836	220 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
PUS1	YPL212C	PAU7	P39545	55 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PUS1	YPL212C	LST8	P41318	303 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PUS1	YPL212C	YIP1	P53039	248 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PUS1	YPL212C	SDS23	P53172	527 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PUS1	YPL212C	TOM7	P53507	60 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PUS1	YPL212C	GAT3	Q07928	141 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PUS1	YPL212C	CSI2	Q08054	341 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PUS1	YPL212C	HTL1	Q9URQ5	78 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PUS1	YPL212C	SEC16	P48415	2195 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
PUS1	YPL212C	YCR022C	P25620	114 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PUS1	YPL212C	FEN2	P25621	512 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
PUS1	YPL212C	YER121W	P40076	114 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PUS1	YPL212C	MSL1	P40567	111 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
PUS1	YPL212C	HAC1	P41546	238 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PUS1	YPL212C	YJL028W	P47062	111 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PUS1	YPL212C	YNL046W	P53956	172 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PUS1	YPL212C	YPL162C	Q12042	273 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PUS1	YPL212C	YDL157C	Q12082	118 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PUS1	YPL212C	YDL009C	Q12210	107 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PUS1	YPL212C	DAD1	Q12248	94 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PUS1	YPL212C	COX17	Q12287	69 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PUS1	YPL212C	FMP27	Q06179	2628 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PUS1	YPL212C	ACC1	Q00955	2233 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
PUS1	YPL212C	RPL23A	P0CX41	137 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
PUS1	YPL212C	RPL23B	P0CX42	137 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
PUS1	YPL212C	MRPL31	P14063	131 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
PUS1	YPL212C	TIR2	P33890	251 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PUS1	YPL212C	LSM2	P38203	95 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
PUS1	YPL212C	SGN1	P40561	250 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.17	□□□□□ -1.74	not detected
PUS1	YPL212C	YFL015C	P43578	164 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PUS1	YPL212C	YFR045W	P43617	309 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PUS1	YPL212C	YGL230C	P53074	147 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PUS1	YPL212C	YGR018C	P53211	109 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PUS1	YPL212C	THG1	P53215	237 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
PUS1	YPL212C	HST4	P53688	370 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PUS1	YPL212C	YDR366C	P87287	132 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PUS1	YPL212C	ARC18	Q05933	178 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
PUS1	YPL212C	IRC25	Q07951	179 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PUS1	YPL212C	HTB2	P02294	131 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PUS1	YPL212C	CYC3	P06182	269 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PUS1	YPL212C	DDI2	P0CH63	225 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PUS1	YPL212C	DDI3	P0CH64	225 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PUS1	YPL212C	MDM10	P18409	493 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PUS1	YPL212C	MRPL20	P22354	195 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
PUS1	YPL212C	UTR5	P32630	166 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PUS1	YPL212C	PRS4	P38063	326 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
PUS1	YPL212C	RRT1	P38192	103 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PUS1	YPL212C	YHL037C	P38733	133 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PUS1	YPL212C	HUA1	P40325	198 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PUS1	YPL212C	YFL051C	P43552	160 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PUS1	YPL212C	COX16	P47081	118 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PUS1	YPL212C	DAD4	P69851	72 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PUS1	YPL212C	SED1	Q01589	338 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PUS1	YPL212C	FSF1	Q12029	327 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
PUS1	YPL212C	YLR050C	Q12155	161 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
PUS1	YPL212C	YOR029W	Q12243	111 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PUS1	YPL212C	CSF1	Q12150	2958 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PUS1	YPL212C	YFL068W	P0CX99	160 aa		4.15	□□□□□ -1.74
PUS1	YPL212C	YLL066W-A	P0CY00	160 aa		4.15	□□□□□ -1.74
PUS1	YPL212C	YLL067W-A	P0CY01	160 aa		4.15	□□□□□ -1.74
PUS1	YPL212C	FZF1	P32805	299 aa		4.15	□□□□□ -1.74
PUS1	YPL212C	CTR2	P38865	189 aa		4.15	□□□□□ -1.74
PUS1	YPL212C	MIC26	P50087	233 aa		4.15	□□□□□ -1.74

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