RNA–Protein interactions for RNA: YOR115C

TRS33, Transcript of Core component of transport protein particle (TRAPP) complexes I-III, yeast

Gene TRS33, Length 807 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TRS33	YOR115C	PAA1	Q12447	191 aa	Known RBP	3.96	□□□□□ -1.78
TRS33	YOR115C	HTB1	P02293	131 aa	Known RBP	3.95	□□□□□ -1.78
TRS33	YOR115C	PIS1	P06197	220 aa	Known RBP	3.95	□□□□□ -1.78
TRS33	YOR115C	DAL80	P26343	269 aa		3.95	□□□□□ -1.78
TRS33	YOR115C	YGP1	P38616	354 aa	Known RBP	3.95	□□□□□ -1.78
TRS33	YOR115C	ECM14	P38836	430 aa		3.95	□□□□□ -1.78
TRS33	YOR115C	YAR068W	P39564	161 aa		3.95	□□□□□ -1.78
TRS33	YOR115C	CYB5	P40312	120 aa		3.95	□□□□□ -1.78
TRS33	YOR115C	YJL118W	P47022	219 aa		3.95	□□□□□ -1.78
TRS33	YOR115C	YMR166C	Q03829	368 aa		3.95	□□□□□ -1.78
TRS33	YOR115C	YOL024W	Q08172	172 aa		3.95	□□□□□ -1.78
TRS33	YOR115C	YOR105W	Q08504	108 aa		3.95	□□□□□ -1.78
TRS33	YOR115C	YLR112W	Q12130	139 aa		3.95	□□□□□ -1.78
TRS33	YOR115C	CRC1	Q12289	327 aa		3.95	□□□□□ -1.78
TRS33	YOR115C	YCR024C-B	Q3E7Z8	88 aa		3.95	□□□□□ -1.78
TRS33	YOR115C	YCL001W-B	Q96VH2	84 aa		3.95	□□□□□ -1.78
TRS33	YOR115C	YBR056W-A	I2HB52	66 aa		3.94	□□□□□ -1.78
TRS33	YOR115C	SOD1	P00445	154 aa	Known RBP	3.94	□□□□□ -1.78
TRS33	YOR115C	ILV5	P06168	395 aa	Known RBP	3.94	□□□□□ -1.78
TRS33	YOR115C	CUP2	P15315	225 aa		3.94	□□□□□ -1.78
TRS33	YOR115C	SUA7	P29055	345 aa	Predicted RBP	3.94	□□□□□ -1.78
TRS33	YOR115C	YKL075C	P36083	450 aa		3.94	□□□□□ -1.78
TRS33	YOR115C	YKR045C	P36138	183 aa		3.94	□□□□□ -1.78
TRS33	YOR115C	LSM2	P38203	95 aa	Known RBP	3.94	□□□□□ -1.78
TRS33	YOR115C	YER134C	P40081	178 aa		3.94	□□□□□ -1.78
TRS33	YOR115C	LST8	P41318	303 aa		3.94	□□□□□ -1.78
TRS33	YOR115C	YGR018C	P53211	109 aa		3.94	□□□□□ -1.78
TRS33	YOR115C	CPD1	P53314	239 aa		3.94	□□□□□ -1.78
TRS33	YOR115C	TOM7	P53507	60 aa		3.94	□□□□□ -1.78
TRS33	YOR115C	RAV2	Q03956	351 aa		3.94	□□□□□ -1.78
TRS33	YOR115C	MCH1	Q07376	486 aa		3.94	□□□□□ -1.78
TRS33	YOR115C	NDE2	Q07500	545 aa		3.94	□□□□□ -1.78
TRS33	YOR115C	FIT2	Q08906	153 aa		3.94	□□□□□ -1.78
TRS33	YOR115C	YPL278C	Q08990	100 aa		3.94	□□□□□ -1.78
TRS33	YOR115C	COA6	Q3E846	104 aa		3.94	□□□□□ -1.78
TRS33	YOR115C	YCR022C	P25620	114 aa		3.93	□□□□□ -1.78
TRS33	YOR115C	ACP1	P32463	125 aa		3.93	□□□□□ -1.78
TRS33	YOR115C	SOR1	P35497	357 aa	Known RBP	3.93	□□□□□ -1.78
TRS33	YOR115C	MIX23	P38162	196 aa		3.93	□□□□□ -1.78
TRS33	YOR115C	DOG2	P38773	246 aa		3.93	□□□□□ -1.78
TRS33	YOR115C	DOG1	P38774	246 aa		3.93	□□□□□ -1.78
TRS33	YOR115C	BDH1	P39714	382 aa		3.93	□□□□□ -1.78
TRS33	YOR115C	YER121W	P40076	114 aa		3.93	□□□□□ -1.78
TRS33	YOR115C	YJL213W	P40896	331 aa		3.93	□□□□□ -1.78
TRS33	YOR115C	SAS2	P40963	338 aa		3.93	□□□□□ -1.78
TRS33	YOR115C	CDC40	P40968	455 aa	Predicted RBP	3.93	□□□□□ -1.78
TRS33	YOR115C	SSU72	P53538	206 aa	Predicted RBP	3.93	□□□□□ -1.78
TRS33	YOR115C	YNL234W	P53857	426 aa		3.93	□□□□□ -1.78
TRS33	YOR115C	RPL15B	P54780	204 aa	Predicted RBP	3.93	□□□□□ -1.78
TRS33	YOR115C	IZH1	Q03419	316 aa		3.93	□□□□□ -1.78
TRS33	YOR115C	PKR1	Q03880	122 aa	Known RBP	3.93	□□□□□ -1.78
TRS33	YOR115C	SOR2	Q07786	357 aa		3.93	□□□□□ -1.78
TRS33	YOR115C	YDL009C	Q12210	107 aa		3.93	□□□□□ -1.78
TRS33	YOR115C	IRA2	P19158	3079 aa		3.93	□□□□□ -1.78
TRS33	YOR115C	HSP12	P22943	109 aa	Known RBP	3.92	□□□□□ -1.78
TRS33	YOR115C	QRI5	P32344	111 aa		3.92	□□□□□ -1.78
TRS33	YOR115C	PMU1	P36069	295 aa		3.92	□□□□□ -1.78
TRS33	YOR115C	YBL071C	P38185	102 aa		3.92	□□□□□ -1.78
TRS33	YOR115C	CSH1	P38287	376 aa		3.92	□□□□□ -1.78
TRS33	YOR115C	YHR173C	P38864	112 aa		3.92	□□□□□ -1.78
TRS33	YOR115C	RPB11	P38902	120 aa		3.92	□□□□□ -1.78
TRS33	YOR115C	YJL028W	P47062	111 aa		3.92	□□□□□ -1.78
TRS33	YOR115C	STD1	Q02794	444 aa		3.92	□□□□□ -1.78
TRS33	YOR115C	SNA4	Q07549	140 aa		3.92	□□□□□ -1.78
TRS33	YOR115C	YCL048W-A	Q2V2Q2	79 aa		3.92	□□□□□ -1.78
TRS33	YOR115C	IRA1	P18963	3092 aa		3.92	□□□□□ -1.78
TRS33	YOR115C	MDM10	P18409	493 aa		3.91	□□□□□ -1.78
TRS33	YOR115C	FPR2	P32472	135 aa		3.91	□□□□□ -1.78
TRS33	YOR115C	FZF1	P32805	299 aa		3.91	□□□□□ -1.78
TRS33	YOR115C	SFT2	P38166	215 aa		3.91	□□□□□ -1.78
TRS33	YOR115C	AIM24	P47127	394 aa		3.91	□□□□□ -1.78
TRS33	YOR115C	YNL046W	P53956	172 aa		3.91	□□□□□ -1.78
TRS33	YOR115C	MHR1	Q06630	226 aa		3.91	□□□□□ -1.78
TRS33	YOR115C	ATX2	Q12067	313 aa		3.91	□□□□□ -1.78
TRS33	YOR115C	FCY1	Q12178	158 aa		3.91	□□□□□ -1.78
TRS33	YOR115C	AYT1	Q12226	474 aa		3.91	□□□□□ -1.78
TRS33	YOR115C	ATO3	Q12359	275 aa		3.91	□□□□□ -1.78
TRS33	YOR115C	GCN1	P33892	2672 aa	Known RBP	3.9	□□□□□ -1.78
TRS33	YOR115C	SEC4	P07560	215 aa	Known RBP	3.9	□□□□□ -1.79
TRS33	YOR115C	YFL068W	P0CX99	160 aa		3.9	□□□□□ -1.79
TRS33	YOR115C	YLL066W-A	P0CY00	160 aa		3.9	□□□□□ -1.79
TRS33	YOR115C	YLL067W-A	P0CY01	160 aa		3.9	□□□□□ -1.79
TRS33	YOR115C	SPS100	P13130	326 aa		3.9	□□□□□ -1.79
TRS33	YOR115C	MIG1	P27705	504 aa		3.9	□□□□□ -1.79
TRS33	YOR115C	TCA17	P32613	152 aa		3.9	□□□□□ -1.79
TRS33	YOR115C	GAT2	P40209	560 aa		3.9	□□□□□ -1.79
TRS33	YOR115C	TDA4	P47153	279 aa		3.9	□□□□□ -1.79
TRS33	YOR115C	SDS23	P53172	527 aa		3.9	□□□□□ -1.79
TRS33	YOR115C	MIX17	Q03667	156 aa		3.9	□□□□□ -1.79
TRS33	YOR115C	IRC23	Q08416	157 aa		3.9	□□□□□ -1.79
TRS33	YOR115C	POM33	Q12164	279 aa		3.9	□□□□□ -1.79
TRS33	YOR115C	JID1	Q12350	301 aa		3.9	□□□□□ -1.79
TRS33	YOR115C	RPS22B	Q3E7Y3	130 aa	Known RBP	3.9	□□□□□ -1.79
TRS33	YOR115C	HMRA1	P0CY11	126 aa		3.89	□□□□□ -1.79
TRS33	YOR115C	TIR1	P10863	254 aa		3.89	□□□□□ -1.79
TRS33	YOR115C	IES6	P32617	166 aa		3.89	□□□□□ -1.79
TRS33	YOR115C	GSP1	P32835	219 aa	Known RBP	3.89	□□□□□ -1.79
TRS33	YOR115C	GSP2	P32836	220 aa	Known RBP	3.89	□□□□□ -1.79
TRS33	YOR115C	YKL187C	P34231	750 aa		3.89	□□□□□ -1.79
TRS33	YOR115C	AME1	P38313	324 aa		3.89	□□□□□ -1.79

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