RNA–Protein interactions for RNA: YGR028W

MSP1, Transcript of Highly-conserved N-terminally anchored AAA-ATPase, yeast

Gene MSP1, Length 1,089 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MSP1	YGR028W	CKS1	P20486	150 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
MSP1	YGR028W	ACB1	P31787	87 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MSP1	YGR028W	LSM2	P38203	95 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
MSP1	YGR028W	SWM2	P40342	146 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MSP1	YGR028W	MIC27	P50945	234 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MSP1	YGR028W	YIP3	P53633	176 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MSP1	YGR028W	UBC7	Q02159	165 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MSP1	YGR028W	YMR007W	Q03675	126 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MSP1	YGR028W	SAR1	P20606	190 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
MSP1	YGR028W	SFT2	P38166	215 aa		4.71	□□□□□ -1.66
MSP1	YGR028W	BOR1	P53838	576 aa		4.71	□□□□□ -1.66
MSP1	YGR028W	YMR244W	Q04018	355 aa		4.71	□□□□□ -1.66
MSP1	YGR028W	YOL160W	Q08321	113 aa		4.71	□□□□□ -1.66
MSP1	YGR028W	ISN1	Q99312	450 aa		4.71	□□□□□ -1.66
MSP1	YGR028W	GCN3	P14741	305 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MSP1	YGR028W	VMA16	P23968	213 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MSP1	YGR028W	TIR2	P33890	251 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MSP1	YGR028W	YER135C	P40082	130 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MSP1	YGR028W	SCM3	Q12334	223 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MSP1	YGR028W	SPO13	P23624	291 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MSP1	YGR028W	CDC50	P25656	391 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MSP1	YGR028W	YBL059W	P34224	193 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MSP1	YGR028W	DER1	P38307	211 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MSP1	YGR028W	PET100	P38958	111 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MSP1	YGR028W	MIG3	P39943	394 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MSP1	YGR028W	AIM24	P47127	394 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MSP1	YGR028W	BER1	Q06688	274 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
MSP1	YGR028W	FCF2	Q12035	217 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
MSP1	YGR028W	YNL146C-A	Q3E7Z1	64 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MSP1	YGR028W	ZRC1	P20107	442 aa		4.68	□□□□□ -1.66
MSP1	YGR028W	RPS2	P25443	254 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
MSP1	YGR028W	YEA4	P40004	342 aa		4.68	□□□□□ -1.66
MSP1	YGR028W	MRPS8	Q03799	155 aa		4.68	□□□□□ -1.66
MSP1	YGR028W	YGL194C-A	Q2V2P6	80 aa		4.68	□□□□□ -1.66
MSP1	YGR028W	YCR001W	P25347	104 aa		4.67	□□□□□ -1.66
MSP1	YGR028W	YFR035C	P43608	114 aa		4.67	□□□□□ -1.66
MSP1	YGR028W	TAD2	P47058	250 aa		4.67	□□□□□ -1.66
MSP1	YGR028W	AVO2	Q04749	426 aa		4.67	□□□□□ -1.66
MSP1	YGR028W	YLR179C	Q06252	201 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
MSP1	YGR028W	MAG1	P22134	296 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
MSP1	YGR028W	PHD1	P36093	366 aa		4.66	□□□□□ -1.66
MSP1	YGR028W	VMA22	P38784	181 aa		4.66	□□□□□ -1.66
MSP1	YGR028W	PRE5	P40302	234 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
MSP1	YGR028W	HUA1	P40325	198 aa		4.66	□□□□□ -1.66
MSP1	YGR028W	SAS2	P40963	338 aa		4.66	□□□□□ -1.66
MSP1	YGR028W	ORM1	P53224	222 aa		4.66	□□□□□ -1.66
MSP1	YGR028W	HAL1	Q01766	294 aa		4.66	□□□□□ -1.66
MSP1	YGR028W	YPL162C	Q12042	273 aa		4.66	□□□□□ -1.66
MSP1	YGR028W	YDR157W	A0A023PZE8	133 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MSP1	YGR028W	AHT1	P29589	182 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MSP1	YGR028W	MBB1	P39534	108 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MSP1	YGR028W	MCM22	P47167	239 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MSP1	YGR028W	DSK2	P48510	373 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MSP1	YGR028W	LOA1	Q06508	300 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MSP1	YGR028W	YOL085C	Q99345	113 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MSP1	YGR028W	DDI2	P0CH63	225 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MSP1	YGR028W	DDI3	P0CH64	225 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MSP1	YGR028W	QCR9	P22289	66 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MSP1	YGR028W	EMP24	P32803	203 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
MSP1	YGR028W	ANT1	Q06497	328 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MSP1	YGR028W	FIT2	Q08906	153 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MSP1	YGR028W	YOR015W	Q12169	119 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MSP1	YGR028W	ERV2	Q12284	196 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MSP1	YGR028W	RPS11A	P0CX47	156 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
MSP1	YGR028W	RPS11B	P0CX48	156 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
MSP1	YGR028W	RPB3	P16370	318 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
MSP1	YGR028W	YNR066C	P53752	436 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MSP1	YGR028W	RPL2A	P0CX45	254 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
MSP1	YGR028W	RPL2B	P0CX46	254 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
MSP1	YGR028W	TRS20	P38334	175 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MSP1	YGR028W	JAC1	P53193	184 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MSP1	YGR028W	MRPL50	P53724	139 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MSP1	YGR028W	SGF11	Q03067	99 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MSP1	YGR028W	ATC1	Q04005	294 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MSP1	YGR028W	YPR145C-A	Q2V2P0	78 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MSP1	YGR028W	UBI4	P0CG63	381 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
MSP1	YGR028W	HSP12	P22943	109 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
MSP1	YGR028W	YHR022C	P38763	256 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MSP1	YGR028W	ASP1	P38986	381 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
MSP1	YGR028W	SNX4	P47057	423 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MSP1	YGR028W	TOM7	P53507	60 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MSP1	YGR028W	FMP41	P53889	259 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
MSP1	YGR028W	ADD37	Q03233	198 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MSP1	YGR028W	MRPS17	Q03246	237 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
MSP1	YGR028W	SDO1	Q07953	250 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
MSP1	YGR028W	YPR063C	Q12160	140 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MSP1	YGR028W	HTB2	P02294	131 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MSP1	YGR028W	RPS0A	P32905	252 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
MSP1	YGR028W	GCV3	P39726	170 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
MSP1	YGR028W	CAF40	P53829	373 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MSP1	YGR028W	MRX11	Q03079	207 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MSP1	YGR028W	VAM10	Q08474	114 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MSP1	YGR028W	CCW12	Q12127	133 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MSP1	YGR028W	YMR141C	P40211	102 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MSP1	YGR028W	RPR2	P40571	144 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MSP1	YGR028W	RIB4	P50861	169 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
MSP1	YGR028W	TMA23	Q03525	211 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MSP1	YGR028W	RAV2	Q03956	351 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MSP1	YGR028W	YBR126W-A	Q8TGU7	68 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MSP1	YGR028W	ECM25	P32525	599 aa		4.58	□□□□□ -1.68

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