RNA–Protein interactions for RNA: YER103W

SSA4, Transcript of Heat shock protein that is highly induced upon stress, yeastyeast

Gene SSA4, Length 1,929 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSA4YER103W Q0144Q9ZZW2 109 aa10.66□□□□□ -0.7
SSA4YER103W FAS1P07149 2051 aaKnown RBP10.66□□□□□ -0.7
SSA4YER103W HYP2P23301 157 aaKnown RBP10.66□□□□□ -0.7
SSA4YER103W REC104P33323 182 aa10.66□□□□□ -0.7
SSA4YER103W PRS4P38063 326 aaPredicted RBP10.66□□□□□ -0.7
SSA4YER103W REE1P40893 198 aa10.66□□□□□ -0.7
SSA4YER103W VPS63O13549 108 aa10.65□□□□□ -0.7
SSA4YER103W NUD1P32336 851 aa10.65□□□□□ -0.7
SSA4YER103W PRE3P38624 215 aa10.65□□□□□ -0.7
SSA4YER103W PGU1P47180 361 aa10.65□□□□□ -0.7
SSA4YER103W GLT1Q12680 2145 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
SSA4YER103W HSP12P22943 109 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
SSA4YER103W TOM40P23644 387 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
SSA4YER103W YDR215CQ12240 137 aa10.64□□□□□ -0.71
SSA4YER103W YHR214C-DP0CX93 97 aa10.64□□□□□ -0.71
SSA4YER103W OST1P41543 476 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
SSA4YER103W API2Q04413 109 aa10.64□□□□□ -0.71
SSA4YER103W YDL129WQ07555 291 aa10.64□□□□□ -0.71
SSA4YER103W POL2P21951 2222 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
SSA4YER103W ICS2P38284 255 aa10.63□□□□□ -0.71
SSA4YER103W HUA1P40325 198 aa10.63□□□□□ -0.71
SSA4YER103W HSK3P69852 69 aa10.63□□□□□ -0.71
SSA4YER103W YMR31P19955 123 aa10.62□□□□□ -0.71
SSA4YER103W YKL097CP34245 136 aa10.62□□□□□ -0.71
SSA4YER103W SOR1P35497 357 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
SSA4YER103W CRZ1P53968 678 aa10.62□□□□□ -0.71
SSA4YER103W SOR2Q07786 357 aa10.62□□□□□ -0.71
SSA4YER103W ACC1Q00955 2233 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
SSA4YER103W FZF1P32805 299 aa10.62□□□□□ -0.71
SSA4YER103W DOG2P38773 246 aa10.62□□□□□ -0.71
SSA4YER103W GZF3P42944 551 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
SSA4YER103W DIA1P54005 336 aa10.62□□□□□ -0.71
SSA4YER103W UTP23Q12339 254 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
SSA4YER103W FAB1P34756 2278 aa10.61□□□□□ -0.71
SSA4YER103W TOM7P53507 60 aa10.61□□□□□ -0.71
SSA4YER103W FIT2Q08906 153 aa10.61□□□□□ -0.71
SSA4YER103W SNU13P39990 126 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
SSA4YER103W TIM18Q08749 192 aa10.6□□□□□ -0.71
SSA4YER103W MRPL31P14063 131 aaPredicted RBP10.6□□□□□ -0.71
SSA4YER103W YPI1P43587 155 aa10.6□□□□□ -0.71
SSA4YER103W CYC3P06182 269 aa10.59□□□□□ -0.71
SSA4YER103W SDC1Q03323 175 aa10.59□□□□□ -0.71
SSA4YER103W ATG33Q06485 197 aa10.59□□□□□ -0.71
SSA4YER103W RAF1Q06891 181 aa10.59□□□□□ -0.71
SSA4YER103W AYT1Q12226 474 aa10.59□□□□□ -0.71
SSA4YER103W CDC43P18898 376 aa10.58□□□□□ -0.72
SSA4YER103W NIS1P53939 407 aa10.58□□□□□ -0.72
SSA4YER103W PIS1P06197 220 aaKnown RBP10.58□□□□□ -0.72
SSA4YER103W ECM14P38836 430 aa10.58□□□□□ -0.72
SSA4YER103W HTL1Q9URQ5 78 aa10.58□□□□□ -0.72
SSA4YER103W MDM10P18409 493 aa10.57□□□□□ -0.72
SSA4YER103W YPT10P38146 199 aa10.57□□□□□ -0.72
SSA4YER103W PAU7P39545 55 aa10.57□□□□□ -0.72
SSA4YER103W YFR045WP43617 309 aa10.57□□□□□ -0.72
SSA4YER103W YCR006CP25350 157 aa10.56□□□□□ -0.72
SSA4YER103W EGT2P42835 1041 aa10.56□□□□□ -0.72
SSA4YER103W ELC1Q03071 99 aa10.56□□□□□ -0.72
SSA4YER103W IRC25Q07951 179 aa10.56□□□□□ -0.72
SSA4YER103W YIL046W-AQ3E7Z4 54 aa10.56□□□□□ -0.72
SSA4YER103W SFT2P38166 215 aa10.56□□□□□ -0.72
SSA4YER103W YNL184CP53876 108 aa10.56□□□□□ -0.72
SSA4YER103W YDR391CQ04170 232 aa10.56□□□□□ -0.72
SSA4YER103W YDL218WQ07629 317 aa10.56□□□□□ -0.72
SSA4YER103W YOS1Q3E834 85 aa10.56□□□□□ -0.72
SSA4YER103W RPL7AP05737 244 aaKnown RBP10.55□□□□□ -0.72
SSA4YER103W YPS1P32329 569 aa10.55□□□□□ -0.72
SSA4YER103W YAR1P46683 200 aa10.55□□□□□ -0.72
SSA4YER103W YJR096WP47137 282 aa10.55□□□□□ -0.72
SSA4YER103W SUN4P53616 420 aa10.55□□□□□ -0.72
SSA4YER103W ATG21Q02887 496 aa10.55□□□□□ -0.72
SSA4YER103W FPR2P32472 135 aa10.54□□□□□ -0.72
SSA4YER103W MIX14Q04341 121 aa10.54□□□□□ -0.72
SSA4YER103W YLR296WQ05898 108 aa10.54□□□□□ -0.72
SSA4YER103W BET2P20133 325 aa10.54□□□□□ -0.72
SSA4YER103W HEM4P06174 275 aa10.53□□□□□ -0.72
SSA4YER103W APS1P35181 156 aa10.53□□□□□ -0.72
SSA4YER103W YKL044WP36092 106 aa10.53□□□□□ -0.72
SSA4YER103W YJL163CP46996 555 aa10.53□□□□□ -0.72
SSA4YER103W PRM3Q08931 133 aa10.53□□□□□ -0.72
SSA4YER103W MRX11Q03079 207 aa10.52□□□□□ -0.73
SSA4YER103W YKL023C-AQ2V2P3 75 aa10.52□□□□□ -0.73
SSA4YER103W YCR023CP25351 611 aa10.51□□□□□ -0.73
SSA4YER103W MIX17Q03667 156 aa10.5□□□□□ -0.73
SSA4YER103W LIP2Q06005 328 aa10.5□□□□□ -0.73
SSA4YER103W MST28P39552 234 aa10.5□□□□□ -0.73
SSA4YER103W BEM2P39960 2167 aaKnown RBP10.49□□□□□ -0.73
SSA4YER103W GAR1P28007 205 aaKnown RBP10.49□□□□□ -0.73
SSA4YER103W CMC1P36064 111 aa10.49□□□□□ -0.73
SSA4YER103W YGP1P38616 354 aaKnown RBP10.49□□□□□ -0.73
SSA4YER103W SNF11P38956 169 aa10.49□□□□□ -0.73
SSA4YER103W YIL014C-AQ02598 104 aa10.49□□□□□ -0.73
SSA4YER103W SNA4Q07549 140 aa10.49□□□□□ -0.73
SSA4YER103W RFM1Q12192 310 aa10.49□□□□□ -0.73
SSA4YER103W MRPS5P33759 307 aa10.48□□□□□ -0.73
SSA4YER103W YDR042CQ03205 200 aa10.48□□□□□ -0.73
SSA4YER103W RRS1Q08746 203 aaKnown RBP10.48□□□□□ -0.73
SSA4YER103W YOR376WQ08900 122 aa10.48□□□□□ -0.73
SSA4YER103W YCR075W-AQ3E830 75 aa10.48□□□□□ -0.73
SSA4YER103W RPL27BP0C2H7 136 aaKnown RBP10.48□□□□□ -0.73
SSA4YER103W DUT1P33317 147 aa10.48□□□□□ -0.73
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