RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628742.2

SOX9-AS1-218, SOX9 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SOX9-AS1, Length 733 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX9-AS1-218ENST00000628742 ABCA7Q8IZY2 2146 aa7.34□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-218ENST00000628742 A0A0A0MRY4 1105 aa7.34□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-218ENST00000628742 PIRO00625 290 aa7.34□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-218ENST00000628742 GIPC1O14908 333 aa7.34□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-218ENST00000628742 AXIN1O15169 862 aa7.34□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-218ENST00000628742 MARCH6O60337 910 aa7.34□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-218ENST00000628742 F11P03951 625 aa7.34□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-218ENST00000628742 CLTAP09496 248 aa7.34□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-218ENST00000628742 OR52Z1P0C646 297 aa7.34□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-218ENST00000628742 CPB1P15086 417 aa7.34□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-218ENST00000628742 CDC25CP30307 473 aa7.34□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-218ENST00000628742 HOXD12P35452 270 aa7.34□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-218ENST00000628742 LILRA4P59901 499 aa7.34□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-218ENST00000628742 ST3GAL1Q11201 340 aa7.34□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-218ENST00000628742 RUNX3Q13761 415 aa7.34□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-218ENST00000628742 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP7.34□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-218ENST00000628742 PTPAQ15257 358 aa7.34□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-218ENST00000628742 SPATA1Q5VX52 437 aa7.34□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-218ENST00000628742 HAUS3Q68CZ6 603 aa7.34□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-218ENST00000628742 RNF43Q68DV7 783 aa7.34□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-218ENST00000628742 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-218ENST00000628742 TCEAL6Q6IPX3 200 aa7.34□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-218ENST00000628742 MAEAQ7L5Y9 396 aa7.34□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-218ENST00000628742 ITIH5Q86UX2 942 aa7.34□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-218ENST00000628742 YAF2Q8IY57 180 aa7.34□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-218ENST00000628742 TTC9BQ8N6N2 239 aa7.34□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-218ENST00000628742 ATAD1Q8NBU5 361 aa7.34□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-218ENST00000628742 OR10T2Q8NGX3 314 aa7.34□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-218ENST00000628742 ERMNQ8TAM6 284 aa7.34□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-218ENST00000628742 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-218ENST00000628742 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-218ENST00000628742 TCEAL3Q969E4 200 aa7.34□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-218ENST00000628742 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-218ENST00000628742 ZFYVE19Q96K21 471 aa7.34□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-218ENST00000628742 DRC1Q96MC2 740 aa7.34□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-218ENST00000628742 EDEM2Q9BV94 578 aa7.34□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-218ENST00000628742 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa7.34□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-218ENST00000628742 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-218ENST00000628742 BRMS1Q9HCU9 246 aa7.34□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-218ENST00000628742 PDRG1Q9NUG6 133 aa7.34□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-218ENST00000628742 KCND2Q9NZV8 630 aa7.34□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-218ENST00000628742 KCNG1Q9UIX4 513 aa7.34□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-218ENST00000628742 MSRB2Q9Y3D2 182 aa7.34□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-218ENST00000628742 NUB1Q9Y5A7 615 aa7.34□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-218ENST00000628742 PCDH15Q96QU1 1955 aa7.33□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-218ENST00000628742 C4orf47A7E2U8 309 aa7.33□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-218ENST00000628742 TADA3O75528 432 aa7.33□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-218ENST00000628742 RHOBTB1O94844 696 aa7.33□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-218ENST00000628742 APBB3O95704 486 aa7.33□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-218ENST00000628742 CAVIN2O95810 425 aa7.33□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-218ENST00000628742 GABRR2P28476 465 aa7.33□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-218ENST00000628742 MCM4P33991 863 aa7.33□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-218ENST00000628742 ALDH1A3P47895 512 aa7.33□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-218ENST00000628742 TUFMP49411 452 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-218ENST00000628742 NOVA1P51513 510 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-218ENST00000628742 NLRP12P59046 1061 aa7.33□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-218ENST00000628742 AMPD2Q01433 879 aa7.33□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-218ENST00000628742 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa7.33□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-218ENST00000628742 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP7.33□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-218ENST00000628742 USP4Q13107 963 aa7.33□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-218ENST00000628742 STK3Q13188 491 aa7.33□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-218ENST00000628742 SEMA3BQ13214 749 aa7.33□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-218ENST00000628742 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-218ENST00000628742 PDGFRLQ15198 375 aa7.33□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-218ENST00000628742 ANKRD1Q15327 319 aa7.33□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-218ENST00000628742 ZNF77Q15935 545 aa7.33□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-218ENST00000628742 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-218ENST00000628742 KYAT1Q16773 422 aa7.33□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-218ENST00000628742 ME3Q16798 604 aa7.33□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-218ENST00000628742 GAB4Q2WGN9 574 aa7.33□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-218ENST00000628742 GPR158Q5T848 1215 aa7.33□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-218ENST00000628742 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa7.33□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-218ENST00000628742 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa7.33□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-218ENST00000628742 OVOS1Q6IE37 1185 aa7.33□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-218ENST00000628742 RINT1Q6NUQ1 792 aa7.33□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-218ENST00000628742 MON1AQ86VX9 555 aa7.33□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-218ENST00000628742 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-218ENST00000628742 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-218ENST00000628742 PKMYT1Q99640 499 aa7.33□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-218ENST00000628742 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-218ENST00000628742 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-218ENST00000628742 ABCB6Q9NP58 842 aa7.33□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-218ENST00000628742 GKN1Q9NS71 199 aa7.33□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-218ENST00000628742 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-218ENST00000628742 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-218ENST00000628742 CCL26Q9Y258 94 aa7.33□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-218ENST00000628742 DERAQ9Y315 318 aa7.33□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-218ENST00000628742 STYXL1Q9Y6J8 313 aa7.33□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-218ENST00000628742 NAV2Q8IVL1 2488 aa7.33□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-218ENST00000628742 MGAQ8IWI9 3026 aa7.33□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-218ENST00000628742 GON4LQ3T8J9 2241 aa7.32□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-218ENST00000628742 ZNF462Q96JM2 2506 aa7.32□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-218ENST00000628742 A0A0B4J269 797 aa7.32□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-218ENST00000628742 TNFRSF10BO14763 440 aa7.32□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-218ENST00000628742 HIP1RO75146 1068 aa7.32□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-218ENST00000628742 EGFP01133 1207 aa7.32□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-218ENST00000628742 OR4Q2P0C623 313 aa7.32□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-218ENST00000628742 CXCL8P10145 99 aa7.32□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-218ENST00000628742 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-218ENST00000628742 PLS3P13797 630 aa7.32□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 69.8 ms