RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592483.5

CAPNS1-214, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene CAPNS1, Length 431 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-214ENST00000592483 SCNN1GP51170 649 aa25.36■■□□□ 1.65
CAPNS1-214ENST00000592483 SPEM2Q0P670 501 aa25.36■■□□□ 1.65
CAPNS1-214ENST00000592483 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa25.36■■□□□ 1.65
CAPNS1-214ENST00000592483 TSSK4Q6SA08 328 aa25.36■■□□□ 1.65
CAPNS1-214ENST00000592483 EFCAB13Q8IY85 973 aa25.36■■□□□ 1.65
CAPNS1-214ENST00000592483 UROC1Q96N76 676 aa25.36■■□□□ 1.65
CAPNS1-214ENST00000592483 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP25.36■■□□□ 1.65
CAPNS1-214ENST00000592483 NELL2Q99435 816 aa25.36■■□□□ 1.65
CAPNS1-214ENST00000592483 TMEM8AQ9HCN3 771 aa25.36■■□□□ 1.65
CAPNS1-214ENST00000592483 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP25.36■■□□□ 1.65
CAPNS1-214ENST00000592483 CEP295Q9C0D2 2601 aa25.36■■□□□ 1.65
CAPNS1-214ENST00000592483 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP25.36■■□□□ 1.65
CAPNS1-214ENST00000592483 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP25.35■■□□□ 1.65
CAPNS1-214ENST00000592483 FASNP49327 2511 aaKnown RBP25.35■■□□□ 1.65
CAPNS1-214ENST00000592483 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP25.35■■□□□ 1.65
CAPNS1-214ENST00000592483 LRP3O75074 770 aa25.35■■□□□ 1.65
CAPNS1-214ENST00000592483 NFICP08651 508 aa25.35■■□□□ 1.65
CAPNS1-214ENST00000592483 FSHRP23945 695 aa25.35■■□□□ 1.65
CAPNS1-214ENST00000592483 RPS9P46781 194 aaKnown RBP25.35■■□□□ 1.65
CAPNS1-214ENST00000592483 GLUD2P49448 558 aa25.35■■□□□ 1.65
CAPNS1-214ENST00000592483 WNT7BP56706 349 aa25.35■■□□□ 1.65
CAPNS1-214ENST00000592483 DLG4P78352 724 aa25.35■■□□□ 1.65
CAPNS1-214ENST00000592483 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP25.35■■□□□ 1.65
CAPNS1-214ENST00000592483 PFKPQ01813 784 aa25.35■■□□□ 1.65
CAPNS1-214ENST00000592483 CETN1Q12798 172 aa25.35■■□□□ 1.65
CAPNS1-214ENST00000592483 FILIP1LQ4L180 1135 aa25.35■■□□□ 1.65
CAPNS1-214ENST00000592483 VWA3BQ502W6 1294 aa25.35■■□□□ 1.65
CAPNS1-214ENST00000592483 C1orf220Q5T0J3 134 aa25.35■■□□□ 1.65
CAPNS1-214ENST00000592483 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP25.35■■□□□ 1.65
CAPNS1-214ENST00000592483 ITGA11Q9UKX5 1188 aa25.35■■□□□ 1.65
CAPNS1-214ENST00000592483 RAB23Q9ULC3 237 aa25.35■■□□□ 1.65
CAPNS1-214ENST00000592483 PKD1L2Q7Z442 2459 aa25.35■■□□□ 1.65
CAPNS1-214ENST00000592483 COL4A3Q01955 1670 aa25.34■■□□□ 1.65
CAPNS1-214ENST00000592483 NCAM2O15394 837 aa25.34■■□□□ 1.65
CAPNS1-214ENST00000592483 TRIM49P0CI25 452 aa25.34■■□□□ 1.65
CAPNS1-214ENST00000592483 TRIM49CP0CI26 452 aa25.34■■□□□ 1.65
CAPNS1-214ENST00000592483 ATP1A3P13637 1013 aa25.34■■□□□ 1.65
CAPNS1-214ENST00000592483 MXI1P50539 228 aa25.34■■□□□ 1.65
CAPNS1-214ENST00000592483 COPB1P53618 953 aaKnown RBP25.34■■□□□ 1.65
CAPNS1-214ENST00000592483 KCNH2Q12809 1159 aa25.34■■□□□ 1.65
CAPNS1-214ENST00000592483 TUSC3Q13454 348 aa25.34■■□□□ 1.65
CAPNS1-214ENST00000592483 KRT39Q6A163 491 aa25.34■■□□□ 1.65
CAPNS1-214ENST00000592483 LAIR1Q6GTX8 287 aa25.34■■□□□ 1.65
CAPNS1-214ENST00000592483 PALB2Q86YC2 1186 aa25.34■■□□□ 1.65
CAPNS1-214ENST00000592483 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP25.34■■□□□ 1.65
CAPNS1-214ENST00000592483 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP25.34■■□□□ 1.65
CAPNS1-214ENST00000592483 NDST4Q9H3R1 872 aa25.34■■□□□ 1.65
CAPNS1-214ENST00000592483 CDH7Q9ULB5 785 aa25.34■■□□□ 1.65
CAPNS1-214ENST00000592483 TGM5O43548 720 aa25.33■■□□□ 1.65
CAPNS1-214ENST00000592483 EFEMP2O95967 443 aa25.33■■□□□ 1.65
CAPNS1-214ENST00000592483 CD72P21854 359 aa25.33■■□□□ 1.65
CAPNS1-214ENST00000592483 PAX3P23760 479 aa25.33■■□□□ 1.65
CAPNS1-214ENST00000592483 RPL9P32969 192 aaKnown RBP25.33■■□□□ 1.65
CAPNS1-214ENST00000592483 FMO5P49326 533 aa25.33■■□□□ 1.65
CAPNS1-214ENST00000592483 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP25.33■■□□□ 1.65
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CAPNS1-214ENST00000592483 ZACNQ401N2 412 aa25.33■■□□□ 1.65
CAPNS1-214ENST00000592483 GLRA4Q5JXX5 417 aa25.33■■□□□ 1.65
CAPNS1-214ENST00000592483 MTSS1LQ765P7 747 aa25.33■■□□□ 1.65
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CAPNS1-214ENST00000592483 MARCH5Q9NX47 278 aa25.33■■□□□ 1.65
CAPNS1-214ENST00000592483 MIOSQ9NXC5 875 aa25.33■■□□□ 1.65
CAPNS1-214ENST00000592483 PTPRJQ12913 1337 aa25.33■■□□□ 1.64
CAPNS1-214ENST00000592483 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP25.32■■□□□ 1.64
CAPNS1-214ENST00000592483 SERPINC1P01008 464 aa25.32■■□□□ 1.64
CAPNS1-214ENST00000592483 POMCP01189 267 aa25.32■■□□□ 1.64
CAPNS1-214ENST00000592483 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP25.32■■□□□ 1.64
CAPNS1-214ENST00000592483 LRPAP1P30533 357 aa25.32■■□□□ 1.64
CAPNS1-214ENST00000592483 DSG1Q02413 1049 aa25.32■■□□□ 1.64
CAPNS1-214ENST00000592483 PPP3CAQ08209 521 aa25.32■■□□□ 1.64
CAPNS1-214ENST00000592483 DSC1Q08554 894 aa25.32■■□□□ 1.64
CAPNS1-214ENST00000592483 MIIPQ5JXC2 388 aa25.32■■□□□ 1.64
CAPNS1-214ENST00000592483 LILRA6Q6PI73 481 aa25.32■■□□□ 1.64
CAPNS1-214ENST00000592483 SV2AQ7L0J3 742 aa25.32■■□□□ 1.64
CAPNS1-214ENST00000592483 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP25.32■■□□□ 1.64
CAPNS1-214ENST00000592483 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa25.32■■□□□ 1.64
CAPNS1-214ENST00000592483 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP25.32■■□□□ 1.64
CAPNS1-214ENST00000592483 OR5B17Q8NGF7 314 aa25.32■■□□□ 1.64
CAPNS1-214ENST00000592483 DPP3Q9NY33 737 aa25.32■■□□□ 1.64
CAPNS1-214ENST00000592483 TAB2Q9NYJ8 693 aa25.32■■□□□ 1.64
CAPNS1-214ENST00000592483 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP25.32■■□□□ 1.64
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CAPNS1-214ENST00000592483 RETP07949 1114 aa25.31■■□□□ 1.64
CAPNS1-214ENST00000592483 GCLMP48507 274 aa25.31■■□□□ 1.64
CAPNS1-214ENST00000592483 NRLP54845 237 aa25.31■■□□□ 1.64
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CAPNS1-214ENST00000592483 MYL7Q01449 175 aa25.31■■□□□ 1.64
CAPNS1-214ENST00000592483 BIRC3Q13489 604 aa25.31■■□□□ 1.64
CAPNS1-214ENST00000592483 FKBP15Q5T1M5 1219 aa25.31■■□□□ 1.64
CAPNS1-214ENST00000592483 SARM1Q6SZW1 724 aa25.31■■□□□ 1.64
CAPNS1-214ENST00000592483 ZNF516Q92618 1163 aa25.31■■□□□ 1.64
CAPNS1-214ENST00000592483 CXCL16Q9H2A7 254 aa25.31■■□□□ 1.64
CAPNS1-214ENST00000592483 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP25.31■■□□□ 1.64
CAPNS1-214ENST00000592483 COQ4Q9Y3A0 265 aa25.31■■□□□ 1.64
CAPNS1-214ENST00000592483 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP25.31■■□□□ 1.64
CAPNS1-214ENST00000592483 CBFA2T2O43439 604 aa25.3■■□□□ 1.64
CAPNS1-214ENST00000592483 PHACTR2O75167 634 aa25.3■■□□□ 1.64
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