RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588374.1

EFTUD2-211, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 524 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-211ENST00000588374 HOXA9P31269 272 aa7.27□□□□□ -1.25
EFTUD2-211ENST00000588374 GTF2H1P32780 548 aa7.27□□□□□ -1.25
EFTUD2-211ENST00000588374 TUFMP49411 452 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
EFTUD2-211ENST00000588374 EPHB3P54753 998 aa7.27□□□□□ -1.25
EFTUD2-211ENST00000588374 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
EFTUD2-211ENST00000588374 CYP27A1Q02318 531 aa7.27□□□□□ -1.25
EFTUD2-211ENST00000588374 ENPEPQ07075 957 aa7.27□□□□□ -1.25
EFTUD2-211ENST00000588374 LRMPQ12912 555 aa7.27□□□□□ -1.25
EFTUD2-211ENST00000588374 TAF12Q16514 161 aa7.27□□□□□ -1.25
EFTUD2-211ENST00000588374 CCDC142Q17RM4 750 aa7.27□□□□□ -1.25
EFTUD2-211ENST00000588374 DPCR1Q3MIW9 517 aa7.27□□□□□ -1.25
EFTUD2-211ENST00000588374 CBWD6Q4V339 395 aa7.27□□□□□ -1.25
EFTUD2-211ENST00000588374 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
EFTUD2-211ENST00000588374 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa7.27□□□□□ -1.25
EFTUD2-211ENST00000588374 WDR44Q5JSH3 913 aa7.27□□□□□ -1.25
EFTUD2-211ENST00000588374 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
EFTUD2-211ENST00000588374 CBWD3Q5JTY5 395 aa7.27□□□□□ -1.25
EFTUD2-211ENST00000588374 CBWD5Q5RIA9 395 aa7.27□□□□□ -1.25
EFTUD2-211ENST00000588374 SDHAF4Q5VUM1 108 aa7.27□□□□□ -1.25
EFTUD2-211ENST00000588374 IQCEQ6IPM2 695 aa7.27□□□□□ -1.25
EFTUD2-211ENST00000588374 SASS6Q6UVJ0 657 aa7.27□□□□□ -1.25
EFTUD2-211ENST00000588374 RTL10Q7L3V2 364 aa7.27□□□□□ -1.25
EFTUD2-211ENST00000588374 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
EFTUD2-211ENST00000588374 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
EFTUD2-211ENST00000588374 SCN4BQ8IWT1 228 aa7.27□□□□□ -1.25
EFTUD2-211ENST00000588374 FBXL13Q8NEE6 735 aa7.27□□□□□ -1.25
EFTUD2-211ENST00000588374 ITFG1Q8TB96 612 aa7.27□□□□□ -1.25
EFTUD2-211ENST00000588374 SPPL2BQ8TCT7 592 aa7.27□□□□□ -1.25
EFTUD2-211ENST00000588374 ING5Q8WYH8 240 aa7.27□□□□□ -1.25
EFTUD2-211ENST00000588374 TAF4BQ92750 862 aa7.27□□□□□ -1.25
EFTUD2-211ENST00000588374 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP7.27□□□□□ -1.25
EFTUD2-211ENST00000588374 MCRS1Q96EZ8 462 aa7.27□□□□□ -1.25
EFTUD2-211ENST00000588374 MYADMQ96S97 322 aa7.27□□□□□ -1.25
EFTUD2-211ENST00000588374 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
EFTUD2-211ENST00000588374 SYT15Q9BQS2 421 aa7.27□□□□□ -1.25
EFTUD2-211ENST00000588374 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa7.27□□□□□ -1.25
EFTUD2-211ENST00000588374 IMPG2Q9BZV3 1241 aa7.27□□□□□ -1.25
EFTUD2-211ENST00000588374 DPEP3Q9H4B8 488 aa7.27□□□□□ -1.25
EFTUD2-211ENST00000588374 SMYD3Q9H7B4 428 aa7.27□□□□□ -1.25
EFTUD2-211ENST00000588374 VRTNQ9H8Y1 702 aa7.27□□□□□ -1.25
EFTUD2-211ENST00000588374 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
EFTUD2-211ENST00000588374 CRTAC1Q9NQ79 661 aa7.27□□□□□ -1.25
EFTUD2-211ENST00000588374 RAB20Q9NX57 234 aa7.27□□□□□ -1.25
EFTUD2-211ENST00000588374 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
EFTUD2-211ENST00000588374 CDH9Q9ULB4 789 aa7.27□□□□□ -1.25
EFTUD2-211ENST00000588374 NME7Q9Y5B8 376 aa7.27□□□□□ -1.25
EFTUD2-211ENST00000588374 C5orf42Q9H799 3197 aa7.27□□□□□ -1.25
EFTUD2-211ENST00000588374 CLUHO75153 1309 aa7.27□□□□□ -1.25
EFTUD2-211ENST00000588374 UNC80Q8N2C7 3258 aa7.26□□□□□ -1.25
EFTUD2-211ENST00000588374 CLDN5O00501 218 aa7.26□□□□□ -1.25
EFTUD2-211ENST00000588374 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
EFTUD2-211ENST00000588374 PAPLNO95428 1278 aa7.26□□□□□ -1.25
EFTUD2-211ENST00000588374 GNA14O95837 355 aa7.26□□□□□ -1.25
EFTUD2-211ENST00000588374 ASGR2P07307 311 aa7.26□□□□□ -1.25
EFTUD2-211ENST00000588374 RHOP08100 348 aa7.26□□□□□ -1.25
EFTUD2-211ENST00000588374 CCDC192P0DO97 292 aa7.26□□□□□ -1.25
EFTUD2-211ENST00000588374 GJA1P17302 382 aa7.26□□□□□ -1.25
EFTUD2-211ENST00000588374 CD58P19256 250 aa7.26□□□□□ -1.25
EFTUD2-211ENST00000588374 BDNFP23560 247 aa7.26□□□□□ -1.25
EFTUD2-211ENST00000588374 GRIK1P39086 918 aa7.26□□□□□ -1.25
EFTUD2-211ENST00000588374 FMO5P49326 533 aa7.26□□□□□ -1.25
EFTUD2-211ENST00000588374 GPR15P49685 360 aa7.26□□□□□ -1.25
EFTUD2-211ENST00000588374 MXI1P50539 228 aa7.26□□□□□ -1.25
EFTUD2-211ENST00000588374 NDST1P52848 882 aa7.26□□□□□ -1.25
EFTUD2-211ENST00000588374 KCNH2Q12809 1159 aa7.26□□□□□ -1.25
EFTUD2-211ENST00000588374 SMARCB1Q12824 385 aa7.26□□□□□ -1.25
EFTUD2-211ENST00000588374 ORC1Q13415 861 aa7.26□□□□□ -1.25
EFTUD2-211ENST00000588374 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
EFTUD2-211ENST00000588374 DDR2Q16832 855 aa7.26□□□□□ -1.25
EFTUD2-211ENST00000588374 MDH1BQ5I0G3 518 aa7.26□□□□□ -1.25
EFTUD2-211ENST00000588374 CCDC183Q5T5S1 534 aa7.26□□□□□ -1.25
EFTUD2-211ENST00000588374 CYP4A22Q5TCH4 519 aa7.26□□□□□ -1.25
EFTUD2-211ENST00000588374 FAM171BQ6P995 826 aa7.26□□□□□ -1.25
EFTUD2-211ENST00000588374 FOXR2Q6PJQ5 311 aa7.26□□□□□ -1.25
EFTUD2-211ENST00000588374 OTOP3Q7RTS5 596 aa7.26□□□□□ -1.25
EFTUD2-211ENST00000588374 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
EFTUD2-211ENST00000588374 ACOT1Q86TX2 421 aa7.26□□□□□ -1.25
EFTUD2-211ENST00000588374 IRF2BP1Q8IU81 584 aa7.26□□□□□ -1.25
EFTUD2-211ENST00000588374 GPIHBP1Q8IV16 184 aa7.26□□□□□ -1.25
EFTUD2-211ENST00000588374 PLCD3Q8N3E9 789 aa7.26□□□□□ -1.25
EFTUD2-211ENST00000588374 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
EFTUD2-211ENST00000588374 EHBP1Q8NDI1 1231 aa7.26□□□□□ -1.25
EFTUD2-211ENST00000588374 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa7.26□□□□□ -1.25
EFTUD2-211ENST00000588374 SPATA18Q8TC71 538 aa7.26□□□□□ -1.25
EFTUD2-211ENST00000588374 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
EFTUD2-211ENST00000588374 RSAD2Q8WXG1 361 aa7.26□□□□□ -1.25
EFTUD2-211ENST00000588374 SLC35C1Q96A29 364 aa7.26□□□□□ -1.25
EFTUD2-211ENST00000588374 TCEAL4Q96EI5 215 aa7.26□□□□□ -1.25
EFTUD2-211ENST00000588374 MED10Q9BTT4 135 aa7.26□□□□□ -1.25
EFTUD2-211ENST00000588374 B3GNT5Q9BYG0 378 aa7.26□□□□□ -1.25
EFTUD2-211ENST00000588374 EPHX3Q9H6B9 360 aa7.26□□□□□ -1.25
EFTUD2-211ENST00000588374 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP7.26□□□□□ -1.25
EFTUD2-211ENST00000588374 TMEM63CQ9P1W3 806 aa7.26□□□□□ -1.25
EFTUD2-211ENST00000588374 DACH1Q9UI36 760 aa7.26□□□□□ -1.25
EFTUD2-211ENST00000588374 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
EFTUD2-211ENST00000588374 USTQ9Y2C2 406 aa7.26□□□□□ -1.25
EFTUD2-211ENST00000588374 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
EFTUD2-211ENST00000588374 YIPF1Q9Y548 306 aa7.26□□□□□ -1.25
EFTUD2-211ENST00000588374 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP7.26□□□□□ -1.25
EFTUD2-211ENST00000588374 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.2 ms