RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532751.1

PTPRK-222, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 4

Gene PTPRK, Length 563 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-222ENST00000532751 BDP1A6H8Y1 2624 aa23.46■■□□□ 1.35
PTPRK-222ENST00000532751 A8MXQ7 604 aa23.46■■□□□ 1.35
PTPRK-222ENST00000532751 PI4K2BG5E9Z4 385 aa23.46■■□□□ 1.35
PTPRK-222ENST00000532751 HCRTO43612 131 aa23.46■■□□□ 1.35
PTPRK-222ENST00000532751 FAM171BQ6P995 826 aa23.46■■□□□ 1.35
PTPRK-222ENST00000532751 TTC9BQ8N6N2 239 aa23.46■■□□□ 1.35
PTPRK-222ENST00000532751 FBXL13Q8NEE6 735 aa23.46■■□□□ 1.35
PTPRK-222ENST00000532751 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP23.46■■□□□ 1.35
PTPRK-222ENST00000532751 PKMYT1Q99640 499 aa23.46■■□□□ 1.35
PTPRK-222ENST00000532751 PI4K2AQ9BTU6 479 aa23.46■■□□□ 1.35
PTPRK-222ENST00000532751 SMYD3Q9H7B4 428 aa23.46■■□□□ 1.35
PTPRK-222ENST00000532751 ABCB6Q9NP58 842 aa23.46■■□□□ 1.35
PTPRK-222ENST00000532751 EPS15L1Q9UBC2 864 aa23.46■■□□□ 1.35
PTPRK-222ENST00000532751 DACH1Q9UI36 760 aa23.46■■□□□ 1.35
PTPRK-222ENST00000532751 MYBPHLA2RUH7 354 aa23.45■■□□□ 1.34
PTPRK-222ENST00000532751 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
PTPRK-222ENST00000532751 CDR1P51861 262 aa23.45■■□□□ 1.34
PTPRK-222ENST00000532751 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
PTPRK-222ENST00000532751 NOP14P78316 857 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
PTPRK-222ENST00000532751 TAF12Q16514 161 aa23.45■■□□□ 1.34
PTPRK-222ENST00000532751 SPOPLQ6IQ16 392 aa23.45■■□□□ 1.34
PTPRK-222ENST00000532751 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP23.45■■□□□ 1.342e-6■■□□□ 14.2
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PTPRK-222ENST00000532751 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
PTPRK-222ENST00000532751 CDH7Q9ULB5 785 aa23.45■■□□□ 1.34
PTPRK-222ENST00000532751 PTPRDP23468 1912 aa23.44■■□□□ 1.34
PTPRK-222ENST00000532751 SOAT2O75908 522 aa23.44■■□□□ 1.34
PTPRK-222ENST00000532751 LAMP2P13473 410 aa23.44■■□□□ 1.34
PTPRK-222ENST00000532751 RAP1GAPP47736 663 aa23.44■■□□□ 1.34
PTPRK-222ENST00000532751 CDH8P55286 799 aa23.44■■□□□ 1.34
PTPRK-222ENST00000532751 NLRP12P59046 1061 aa23.44■■□□□ 1.34
PTPRK-222ENST00000532751 CFAP221Q4G0U5 840 aa23.44■■□□□ 1.34
PTPRK-222ENST00000532751 ITFG1Q8TB96 612 aa23.44■■□□□ 1.34
PTPRK-222ENST00000532751 FGF13Q92913 245 aa23.44■■□□□ 1.34
PTPRK-222ENST00000532751 PSMG2Q969U7 264 aa23.44■■□□□ 1.34
PTPRK-222ENST00000532751 SLC35C1Q96A29 364 aa23.44■■□□□ 1.34
PTPRK-222ENST00000532751 ELMO3Q96BJ8 720 aa23.44■■□□□ 1.34
PTPRK-222ENST00000532751 DNAJC25Q9H1X3 360 aa23.44■■□□□ 1.34
PTPRK-222ENST00000532751 CRTAC1Q9NQ79 661 aa23.44■■□□□ 1.34
PTPRK-222ENST00000532751 RAB20Q9NX57 234 aa23.44■■□□□ 1.34
PTPRK-222ENST00000532751 IGSF9Q9P2J2 1179 aa23.44■■□□□ 1.34
PTPRK-222ENST00000532751 ATP2C2O75185 946 aa23.43■■□□□ 1.34
PTPRK-222ENST00000532751 MICAL2O94851 1124 aa23.43■■□□□ 1.34
PTPRK-222ENST00000532751 CCDC192P0DO97 292 aa23.43■■□□□ 1.34
PTPRK-222ENST00000532751 MYL4P12829 197 aa23.43■■□□□ 1.34
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PTPRK-222ENST00000532751 EPHA5P54756 1037 aa23.43■■□□□ 1.34
PTPRK-222ENST00000532751 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
PTPRK-222ENST00000532751 PTPN21Q16825 1174 aa23.43■■□□□ 1.34
PTPRK-222ENST00000532751 WDR44Q5JSH3 913 aa23.43■■□□□ 1.34
PTPRK-222ENST00000532751 HS6ST3Q8IZP7 471 aa23.43■■□□□ 1.34
PTPRK-222ENST00000532751 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa23.43■■□□□ 1.34
PTPRK-222ENST00000532751 NXPE3Q969Y0 559 aa23.43■■□□□ 1.34
PTPRK-222ENST00000532751 MYLPFQ96A32 169 aa23.43■■□□□ 1.34
PTPRK-222ENST00000532751 TNIP3Q96KP6 325 aa23.43■■□□□ 1.34
PTPRK-222ENST00000532751 NIF3L1Q9GZT8 377 aa23.43■■□□□ 1.34
PTPRK-222ENST00000532751 EPHX3Q9H6B9 360 aa23.43■■□□□ 1.34
PTPRK-222ENST00000532751 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP23.43■■□□□ 1.34
PTPRK-222ENST00000532751 SORCS3Q9UPU3 1222 aa23.43■■□□□ 1.34
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PTPRK-222ENST00000532751 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
PTPRK-222ENST00000532751 ATF6P18850 670 aa23.42■■□□□ 1.34
PTPRK-222ENST00000532751 CYP2F1P24903 491 aa23.42■■□□□ 1.34
PTPRK-222ENST00000532751 ASPAP45381 313 aa23.42■■□□□ 1.34
PTPRK-222ENST00000532751 CYP27A1Q02318 531 aa23.42■■□□□ 1.34
PTPRK-222ENST00000532751 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
PTPRK-222ENST00000532751 SLC5A9Q2M3M2 681 aa23.42■■□□□ 1.34
PTPRK-222ENST00000532751 CBWD6Q4V339 395 aa23.42■■□□□ 1.34
PTPRK-222ENST00000532751 MDH1BQ5I0G3 518 aa23.42■■□□□ 1.34
PTPRK-222ENST00000532751 CBWD3Q5JTY5 395 aa23.42■■□□□ 1.34
PTPRK-222ENST00000532751 PRSS36Q5K4E3 855 aa23.42■■□□□ 1.34
PTPRK-222ENST00000532751 CBWD5Q5RIA9 395 aa23.42■■□□□ 1.34
PTPRK-222ENST00000532751 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
PTPRK-222ENST00000532751 ING5Q8WYH8 240 aa23.42■■□□□ 1.34
PTPRK-222ENST00000532751 FAXDC2Q96IV6 333 aa23.42■■□□□ 1.34
PTPRK-222ENST00000532751 LPIN3Q9BQK8 851 aa23.42■■□□□ 1.34
PTPRK-222ENST00000532751 BCO2Q9BYV7 579 aa23.42■■□□□ 1.34
PTPRK-222ENST00000532751 CYP3A43Q9HB55 503 aa23.42■■□□□ 1.34
PTPRK-222ENST00000532751 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
PTPRK-222ENST00000532751 NME7Q9Y5B8 376 aa23.42■■□□□ 1.34
PTPRK-222ENST00000532751 ASGR2P07307 311 aa23.41■■□□□ 1.34
PTPRK-222ENST00000532751 MAGEA11P43364 429 aa23.41■■□□□ 1.34
PTPRK-222ENST00000532751 MARSP56192 900 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
PTPRK-222ENST00000532751 CETN1Q12798 172 aa23.41■■□□□ 1.34
PTPRK-222ENST00000532751 MTMR3Q13615 1198 aa23.41■■□□□ 1.34
PTPRK-222ENST00000532751 CCDC142Q17RM4 750 aa23.41■■□□□ 1.34
PTPRK-222ENST00000532751 UNC93AQ86WB7 457 aa23.41■■□□□ 1.34
PTPRK-222ENST00000532751 NPAS3Q8IXF0 933 aa23.41■■□□□ 1.34
PTPRK-222ENST00000532751 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa23.41■■□□□ 1.34
PTPRK-222ENST00000532751 GIPC2Q8TF65 315 aa23.41■■□□□ 1.34
PTPRK-222ENST00000532751 SEMA4DQ92854 862 aa23.41■■□□□ 1.34
PTPRK-222ENST00000532751 PCED1BQ96HM7 432 aa23.41■■□□□ 1.34
PTPRK-222ENST00000532751 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa23.41■■□□□ 1.34
PTPRK-222ENST00000532751 DNAI2Q9GZS0 605 aa23.41■■□□□ 1.34
PTPRK-222ENST00000532751 SDCBP2Q9H190 292 aa23.41■■□□□ 1.34
PTPRK-222ENST00000532751 DPEP3Q9H4B8 488 aa23.41■■□□□ 1.34
PTPRK-222ENST00000532751 KCNK12Q9HB15 430 aa23.41■■□□□ 1.34
PTPRK-222ENST00000532751 GDE1Q9NZC3 331 aa23.41■■□□□ 1.34
PTPRK-222ENST00000532751 COQ4Q9Y3A0 265 aa23.41■■□□□ 1.34
PTPRK-222ENST00000532751 CSH1P0DML2 217 aa23.4■■□□□ 1.34
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