RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522702.5

FAM49B-222, Transcript of family with sequence similarity 49 member B, human

TSL 4

Gene FAM49B, Length 544 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM49B-222	ENST00000522702	HEATR3	Q7Z4Q2	680 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	TBC1D1	Q86TI0	1168 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	TTC7B	Q86TV6	843 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	RHOT1	Q8IXI2	618 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	ELOA2	Q8IYF1	753 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	TRMT2A	Q8IZ69	625 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	IFI44	Q8TCB0	444 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	BRI3BP	Q8WY22	251 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	HDAC2	Q92769	488 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	ZBTB10	Q96DT7	871 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	ZC3H10	Q96K80	434 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	DDX24	Q9GZR7	859 aa	Known RBP eCLIP	4.62	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	ADARB2	Q9NS39	739 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	BLOC1S4	Q9NUP1	217 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	FEZ2	Q9UHY8	353 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	GJD2	Q9UKL4	321 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	PCDHA3	Q9Y5H8	950 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	USP19	O94966	1318 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	LGALS16	A8MUM7	142 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702		F8W8V4	182 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	ACKR2	O00590	384 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	TRIM38	O00635	465 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	ITGA10	O75578	1167 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	IPO13	O94829	963 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	GAST	P01350	101 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	JUN	P05412	331 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	POLB	P06746	335 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	GYPE	P15421	78 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	VEGFA	P15692	232 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	CAPN3	P20807	821 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	EEF1G	P26641	437 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	HK3	P52790	923 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	RABGGTB	P53611	331 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	ITGA8	P53708	1063 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	ARL4C	P56559	192 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	GALNT1	Q10472	559 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	PFKFB4	Q16877	469 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	TIGD6	Q17RP2	521 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	AGAP9	Q5VTM2	703 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	TTLL5	Q6EMB2	1281 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	FBXO38	Q6PIJ6	1188 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	KCNV1	Q6PIU1	500 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	C4orf50	Q6ZRC1	276 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	SESTD1	Q86VW0	696 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	PQLC1	Q8N2U9	271 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	ZGPAT	Q8N5A5	531 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	ESX1	Q8N693	406 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	C3orf20	Q8ND61	904 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	SNRNP27	Q8WVK2	155 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	C18orf8	Q96DM3	657 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	CYFIP2	Q96F07	1278 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	ZNF764	Q96H86	408 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	FAM167B	Q9BTA0	163 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	CENPO	Q9BU64	300 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	OSBPL5	Q9H0X9	879 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	MANSC1	Q9H8J5	431 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	ALG13	Q9NP73	1137 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	OBP2B	Q9NPH6	170 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	GJB4	Q9NTQ9	266 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	TDP1	Q9NUW8	608 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	ABCF2	Q9UG63	623 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	SLC39A10	Q9ULF5	831 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	SLC45A1	Q9Y2W3	748 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	ITIH6	Q6UXX5	1313 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	ATRNL1	Q5VV63	1379 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702		A0A1W2PPC4	97 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	GOLGA6L3	A6NEY3	463 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	RECQL4	O94761	1208 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	BAIAP3	O94812	1187 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	TH	P07101	528 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	XBP1	P17861	261 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	MCC	P23508	829 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	CD38	P28907	300 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	ELF1	P32519	619 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	TERF1	P54274	439 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	SUMO3	P55854	103 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	NKX6-1	P78426	367 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	FMO1	Q01740	532 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	TLE1	Q04724	770 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	MTM1	Q13496	603 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	PLS1	Q14651	629 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	RAB39A	Q14964	217 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	PRAMEF14	Q5SWL7	426 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	LRCH2	Q5VUJ6	765 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	SYCE2	Q6PIF2	218 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	RHOU	Q7L0Q8	258 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	HEATR4	Q86WZ0	1026 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	CELF5	Q8N6W0	485 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	MB21D1	Q8N884	522 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	RNF152	Q8N8N0	203 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	FANCB	Q8NB91	859 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	REPS2	Q8NFH8	660 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	RUBCN	Q92622	972 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	ANKS1A	Q92625	1134 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	IQCD	Q96DY2	449 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	CLPTM1L	Q96KA5	538 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	BARD1	Q99728	777 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	MLST8	Q9BVC4	326 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	COLEC11	Q9BWP8	271 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	STK33	Q9BYT3	514 aa		4.6	□□□□□ -1.67

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