RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515965.1

RNU6-377P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 377, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-377P, Length 102 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-377P-201ENST00000515965 CRIP3Q6Q6R5 217 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 SYNE4Q8N205 404 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 LNX2Q8N448 690 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 ATP11CQ8NB49 1132 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 PARD3BQ8TEW8 1205 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 BRI3BPQ8WY22 251 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 GJA10Q969M2 543 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 RNF31Q96EP0 1072 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 CCDC138Q96M89 665 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 MYD88Q99836 296 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 PTDSS2Q9BVG9 487 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 BRIP1Q9BX63 1249 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 CHST8Q9H2A9 424 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 SERHL2Q9H4I8 314 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 STARD7Q9NQZ5 370 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 SNX13Q9Y5W8 968 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 A0A0B4J269 797 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 RASA4BC9J798 803 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 F5H697 171 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 TOR1BO14657 336 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 AREL1O15033 823 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 KPNA5O15131 536 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 RASA4O43374 803 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 PROM1O43490 865 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 TRIAP1O43715 76 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 FGF18O76093 207 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 MYL3P08590 195 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 TXNP10599 105 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 TSHRP16473 764 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 TNFRSF1AP19438 455 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 BTF3P20290 206 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 ITGALP20701 1170 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 MAKP20794 623 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 KLRC1P26715 233 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 LRPAP1P30533 357 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 NPTX2P47972 431 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 NDUFV1P49821 464 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP3.29□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 DGKEP52429 567 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 TAP1Q03518 808 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 TUBB3Q13509 450 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 PLA1AQ53H76 456 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 FAM209BQ5JX69 171 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 ABHD17BQ5VST6 288 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 SFRP4Q6FHJ7 346 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 ZDHHC24Q6UX98 284 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 TMEM108Q6UXF1 575 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 UNC13DQ70J99 1090 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 FAM186BQ8IYM0 893 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 ULK2Q8IYT8 1036 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP3.29□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 SNX19Q92543 992 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 SPSB4Q96A44 273 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 SNX22Q96L94 193 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 SGCZQ96LD1 299 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 GDF15Q99988 308 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 MLST8Q9BVC4 326 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 WDR11Q9BZH6 1224 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 VPS11Q9H270 941 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 MMRN2Q9H8L6 949 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 PNPLA8Q9NP80 782 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 SYBUQ9NX95 663 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 FNIP2Q9P278 1114 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 PADI4Q9UM07 663 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 CORO2BQ9UQ03 480 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 SHOC2Q9UQ13 582 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 MAST3O60307 1309 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 TRGV11A0A075B6L2 103 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 A0A1W2PPC4 97 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 POM121BA6NF01 834 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 UNC119BA6NIH7 251 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 NPIPB8E9PQR5 432 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 ANXA2P07355 339 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 CHRM3P20309 590 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 KCNA3P22001 575 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 TGM1P22735 817 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 TNFSF4P23510 183 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 PPIFP30405 207 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 STT3AP46977 705 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 PXNP49023 591 aaPredicted RBP3.28□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 LOXL3P58215 753 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 LILRA4P59901 499 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 BLOC1S1P78537 153 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 MORC3Q14149 939 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 PTPAQ15257 358 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 LONRF1Q17RB8 773 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP3.28□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.5 ms