RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512194.1

HERC3-210, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 836 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-210ENST00000512194 OTOP3Q7RTS5 596 aa8.11□□□□□ -1.11
HERC3-210ENST00000512194 CABP7Q86V35 215 aa8.11□□□□□ -1.11
HERC3-210ENST00000512194 PLA2G4DQ86XP0 818 aa8.11□□□□□ -1.11
HERC3-210ENST00000512194 TDHQ8IZJ6 230 aa8.11□□□□□ -1.11
HERC3-210ENST00000512194 ABRAQ8N0Z2 381 aa8.11□□□□□ -1.11
HERC3-210ENST00000512194 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa8.11□□□□□ -1.11
HERC3-210ENST00000512194 FSIP1Q8NA03 581 aa8.11□□□□□ -1.11
HERC3-210ENST00000512194 ERMNQ8TAM6 284 aa8.11□□□□□ -1.11
HERC3-210ENST00000512194 TBC1D5Q92609 795 aa8.11□□□□□ -1.11
HERC3-210ENST00000512194 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP8.11□□□□□ -1.11
HERC3-210ENST00000512194 IFT22Q9H7X7 185 aa8.11□□□□□ -1.11
HERC3-210ENST00000512194 CRTAC1Q9NQ79 661 aa8.11□□□□□ -1.11
HERC3-210ENST00000512194 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP8.11□□□□□ -1.11
HERC3-210ENST00000512194 PXMP2Q9NR77 195 aa8.11□□□□□ -1.11
HERC3-210ENST00000512194 USP25Q9UHP3 1055 aa8.11□□□□□ -1.11
HERC3-210ENST00000512194 PCDHA12Q9UN75 941 aa8.11□□□□□ -1.11
HERC3-210ENST00000512194 RIPK3Q9Y572 518 aa8.11□□□□□ -1.11
HERC3-210ENST00000512194 MYH6P13533 1939 aa8.1□□□□□ -1.11
HERC3-210ENST00000512194 ASB14A6NK59 587 aa8.1□□□□□ -1.11
HERC3-210ENST00000512194 CTAGE5O15320 804 aa8.1□□□□□ -1.11
HERC3-210ENST00000512194 SLC26A4O43511 780 aa8.1□□□□□ -1.11
HERC3-210ENST00000512194 PSPNO60542 156 aa8.1□□□□□ -1.11
HERC3-210ENST00000512194 CNMDO75829 334 aa8.1□□□□□ -1.11
HERC3-210ENST00000512194 TFRCP02786 760 aaKnown RBP8.1□□□□□ -1.11
HERC3-210ENST00000512194 MSL3P1P0C860 447 aa8.1□□□□□ -1.11
HERC3-210ENST00000512194 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP8.1□□□□□ -1.11
HERC3-210ENST00000512194 BPIP17213 487 aa8.1□□□□□ -1.11
HERC3-210ENST00000512194 HOXD10P28358 340 aa8.1□□□□□ -1.11
HERC3-210ENST00000512194 TXKP42681 527 aa8.1□□□□□ -1.11
HERC3-210ENST00000512194 SYKP43405 635 aa8.1□□□□□ -1.11
HERC3-210ENST00000512194 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP8.1□□□□□ -1.11
HERC3-210ENST00000512194 LRP8Q14114 963 aa8.1□□□□□ -1.11
HERC3-210ENST00000512194 PDIA5Q14554 519 aa8.1□□□□□ -1.11
HERC3-210ENST00000512194 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP8.1□□□□□ -1.11
HERC3-210ENST00000512194 STXBP2Q15833 593 aa8.1□□□□□ -1.11
HERC3-210ENST00000512194 PRR16Q569H4 304 aa8.1□□□□□ -1.11
HERC3-210ENST00000512194 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP8.1□□□□□ -1.11
HERC3-210ENST00000512194 KCNV1Q6PIU1 500 aa8.1□□□□□ -1.11
HERC3-210ENST00000512194 PLEKHH3Q7Z736 793 aa8.1□□□□□ -1.11
HERC3-210ENST00000512194 DPP9Q86TI2 863 aa8.1□□□□□ -1.11
HERC3-210ENST00000512194 MYLIPQ8WY64 445 aa8.1□□□□□ -1.11
HERC3-210ENST00000512194 CALML4Q96GE6 196 aa8.1□□□□□ -1.11
HERC3-210ENST00000512194 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa8.1□□□□□ -1.11
HERC3-210ENST00000512194 MBOAT7Q96N66 472 aa8.1□□□□□ -1.11
HERC3-210ENST00000512194 TAAR1Q96RJ0 339 aa8.1□□□□□ -1.11
HERC3-210ENST00000512194 MXRA8Q9BRK3 442 aa8.1□□□□□ -1.11
HERC3-210ENST00000512194 SDF4Q9BRK5 362 aa8.1□□□□□ -1.11
HERC3-210ENST00000512194 PDCD2LQ9BRP1 358 aa8.1□□□□□ -1.11
HERC3-210ENST00000512194 WDR11Q9BZH6 1224 aa8.1□□□□□ -1.11
HERC3-210ENST00000512194 SLC6A20Q9NP91 592 aa8.1□□□□□ -1.11
HERC3-210ENST00000512194 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP8.1□□□□□ -1.11
HERC3-210ENST00000512194 CTNND2Q9UQB3 1225 aa8.1□□□□□ -1.11
HERC3-210ENST00000512194 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP8.1□□□□□ -1.11
HERC3-210ENST00000512194 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa8.09□□□□□ -1.11
HERC3-210ENST00000512194 KRIT1O00522 736 aa8.09□□□□□ -1.11
HERC3-210ENST00000512194 ADAMTS3O15072 1205 aa8.09□□□□□ -1.11
HERC3-210ENST00000512194 ADAMTS4O75173 837 aa8.09□□□□□ -1.11
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HERC3-210ENST00000512194 TDP2O95551 362 aa8.09□□□□□ -1.11
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HERC3-210ENST00000512194 TECP42680 631 aa8.09□□□□□ -1.11
HERC3-210ENST00000512194 SLC6A11P48066 632 aa8.09□□□□□ -1.11
HERC3-210ENST00000512194 ERVFC1P60507 584 aa8.09□□□□□ -1.11
HERC3-210ENST00000512194 OCRLQ01968 901 aa8.09□□□□□ -1.11
HERC3-210ENST00000512194 MTMR1Q13613 665 aa8.09□□□□□ -1.11
HERC3-210ENST00000512194 PGM5Q15124 567 aa8.09□□□□□ -1.11
HERC3-210ENST00000512194 ZNF792Q3KQV3 632 aa8.09□□□□□ -1.11
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HERC3-210ENST00000512194 RESP18Q5W5W9 173 aa8.09□□□□□ -1.11
HERC3-210ENST00000512194 KRT79Q5XKE5 535 aa8.09□□□□□ -1.11
HERC3-210ENST00000512194 HAUS3Q68CZ6 603 aa8.09□□□□□ -1.11
HERC3-210ENST00000512194 SLC30A10Q6XR72 485 aa8.09□□□□□ -1.11
HERC3-210ENST00000512194 NECAB2Q7Z6G3 386 aa8.09□□□□□ -1.11
HERC3-210ENST00000512194 CEP57L1Q8IYX8 460 aa8.09□□□□□ -1.11
HERC3-210ENST00000512194 C4orf32Q8N8J7 132 aa8.09□□□□□ -1.11
HERC3-210ENST00000512194 IQUBQ8NA54 791 aa8.09□□□□□ -1.11
HERC3-210ENST00000512194 NETO2Q8NC67 525 aa8.09□□□□□ -1.11
HERC3-210ENST00000512194 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
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HERC3-210ENST00000512194 ZNF577Q9BSK1 485 aa8.09□□□□□ -1.11
HERC3-210ENST00000512194 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP8.09□□□□□ -1.11
HERC3-210ENST00000512194 CSRNP2Q9H175 543 aa8.09□□□□□ -1.11
HERC3-210ENST00000512194 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
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HERC3-210ENST00000512194 JADE2Q9NQC1 790 aa8.09□□□□□ -1.11
HERC3-210ENST00000512194 TBC1D22BQ9NU19 505 aa8.09□□□□□ -1.11
HERC3-210ENST00000512194 LRWD1Q9UFC0 647 aa8.09□□□□□ -1.11
HERC3-210ENST00000512194 NUB1Q9Y5A7 615 aa8.09□□□□□ -1.11
HERC3-210ENST00000512194 REV3LO60673 3130 aa8.09□□□□□ -1.11
HERC3-210ENST00000512194 FRMPD4Q14CM0 1322 aa8.08□□□□□ -1.12
HERC3-210ENST00000512194 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
HERC3-210ENST00000512194 A0A1B0GVL5 298 aa8.08□□□□□ -1.12
HERC3-210ENST00000512194 SLC15A5A6NIM6 579 aa8.08□□□□□ -1.12
HERC3-210ENST00000512194 MAFKO60675 156 aa8.08□□□□□ -1.12
HERC3-210ENST00000512194 GLI4P10075 376 aa8.08□□□□□ -1.12
HERC3-210ENST00000512194 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP8.08□□□□□ -1.12
HERC3-210ENST00000512194 EMC4Q5J8M3 183 aa8.08□□□□□ -1.12
HERC3-210ENST00000512194 LRCH2Q5VUJ6 765 aa8.08□□□□□ -1.12
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