RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511947.2

AP001790.1-201, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene AP001790.1, Length 570 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP001790.1-201ENST00000511947 KLHL10Q6JEL2 608 aa16.04■□□□□ 0.16
AP001790.1-201ENST00000511947 PARM1Q6UWI2 310 aa16.04■□□□□ 0.16
AP001790.1-201ENST00000511947 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
AP001790.1-201ENST00000511947 SLC44A3Q8N4M1 653 aa16.04■□□□□ 0.16
AP001790.1-201ENST00000511947 TAF4BQ92750 862 aa16.04■□□□□ 0.16
AP001790.1-201ENST00000511947 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
AP001790.1-201ENST00000511947 LPIN3Q9BQK8 851 aa16.04■□□□□ 0.16
AP001790.1-201ENST00000511947 MMRN2Q9H8L6 949 aa16.04■□□□□ 0.16
AP001790.1-201ENST00000511947 VRTNQ9H8Y1 702 aa16.04■□□□□ 0.16
AP001790.1-201ENST00000511947 ABCB6Q9NP58 842 aa16.04■□□□□ 0.16
AP001790.1-201ENST00000511947 MYBPHLA2RUH7 354 aa16.03■□□□□ 0.16
AP001790.1-201ENST00000511947 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
AP001790.1-201ENST00000511947 STX10O60499 249 aa16.03■□□□□ 0.16
AP001790.1-201ENST00000511947 ATP2C2O75185 946 aa16.03■□□□□ 0.16
AP001790.1-201ENST00000511947 FGF19O95750 216 aa16.03■□□□□ 0.16
AP001790.1-201ENST00000511947 HLA-DRAP01903 254 aa16.03■□□□□ 0.16
AP001790.1-201ENST00000511947 ATF6P18850 670 aa16.03■□□□□ 0.16
AP001790.1-201ENST00000511947 CCNE1P24864 410 aa16.03■□□□□ 0.16
AP001790.1-201ENST00000511947 CYP2F1P24903 491 aa16.03■□□□□ 0.16
AP001790.1-201ENST00000511947 PMS1P54277 932 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
AP001790.1-201ENST00000511947 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
AP001790.1-201ENST00000511947 PPP3CAQ08209 521 aa16.03■□□□□ 0.16
AP001790.1-201ENST00000511947 MORC3Q14149 939 aa16.03■□□□□ 0.16
AP001790.1-201ENST00000511947 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa16.03■□□□□ 0.16
AP001790.1-201ENST00000511947 C4orf50Q6ZRC1 276 aa16.03■□□□□ 0.16
AP001790.1-201ENST00000511947 HFE2Q6ZVN8 426 aa16.03■□□□□ 0.16
AP001790.1-201ENST00000511947 GIPC2Q8TF65 315 aa16.03■□□□□ 0.16
AP001790.1-201ENST00000511947 FGF14Q92915 247 aa16.03■□□□□ 0.16
AP001790.1-201ENST00000511947 PBXIP1Q96AQ6 731 aa16.03■□□□□ 0.16
AP001790.1-201ENST00000511947 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
AP001790.1-201ENST00000511947 PKMYT1Q99640 499 aa16.03■□□□□ 0.16
AP001790.1-201ENST00000511947 IMPG2Q9BZV3 1241 aa16.03■□□□□ 0.16
AP001790.1-201ENST00000511947 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa16.03■□□□□ 0.16
AP001790.1-201ENST00000511947 SMYD3Q9H7B4 428 aa16.03■□□□□ 0.16
AP001790.1-201ENST00000511947 FBXL21Q9UKT6 434 aa16.03■□□□□ 0.16
AP001790.1-201ENST00000511947 DUSP12Q9UNI6 340 aa16.03■□□□□ 0.16
AP001790.1-201ENST00000511947 A0A1W2PRU2 124 aa16.02■□□□□ 0.16
AP001790.1-201ENST00000511947 TRIM49BA6NDI0 452 aa16.02■□□□□ 0.16
AP001790.1-201ENST00000511947 A8MXQ7 604 aa16.02■□□□□ 0.16
AP001790.1-201ENST00000511947 CD44P16070 742 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
AP001790.1-201ENST00000511947 GJA1P17302 382 aa16.02■□□□□ 0.16
AP001790.1-201ENST00000511947 BMP6P22004 513 aa16.02■□□□□ 0.16
AP001790.1-201ENST00000511947 GTF2H1P32780 548 aa16.02■□□□□ 0.16
AP001790.1-201ENST00000511947 CYP27A1Q02318 531 aa16.02■□□□□ 0.16
AP001790.1-201ENST00000511947 CCDC142Q17RM4 750 aa16.02■□□□□ 0.16
AP001790.1-201ENST00000511947 CFAP221Q4G0U5 840 aa16.02■□□□□ 0.16
AP001790.1-201ENST00000511947 TCERG1LQ5VWI1 586 aa16.02■□□□□ 0.16
AP001790.1-201ENST00000511947 FAM171BQ6P995 826 aa16.02■□□□□ 0.16
AP001790.1-201ENST00000511947 CLEC17AQ6ZS10 378 aa16.02■□□□□ 0.16
AP001790.1-201ENST00000511947 TMC8Q8IU68 726 aa16.02■□□□□ 0.16
AP001790.1-201ENST00000511947 CCDC150Q8NCX0 1101 aa16.02■□□□□ 0.16
AP001790.1-201ENST00000511947 SHKBP1Q8TBC3 707 aa16.02■□□□□ 0.16
AP001790.1-201ENST00000511947 GPR152Q8TDT2 470 aa16.02■□□□□ 0.16
AP001790.1-201ENST00000511947 ELMO3Q96BJ8 720 aa16.02■□□□□ 0.16
AP001790.1-201ENST00000511947 ASIC4Q96FT7 647 aa16.02■□□□□ 0.16
AP001790.1-201ENST00000511947 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP16.02■□□□□ 0.16
AP001790.1-201ENST00000511947 KXD1Q9BQD3 176 aa16.02■□□□□ 0.16
AP001790.1-201ENST00000511947 LRRC3Q9BY71 257 aa16.02■□□□□ 0.16
AP001790.1-201ENST00000511947 TMEM8AQ9HCN3 771 aa16.02■□□□□ 0.16
AP001790.1-201ENST00000511947 KIAA1468Q9P260 1216 aa16.02■□□□□ 0.16
AP001790.1-201ENST00000511947 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
AP001790.1-201ENST00000511947 BICDL2A1A5D9 508 aa16.01■□□□□ 0.15
AP001790.1-201ENST00000511947 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa16.01■□□□□ 0.15
AP001790.1-201ENST00000511947 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
AP001790.1-201ENST00000511947 NARSO43776 548 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
AP001790.1-201ENST00000511947 ASS1P00966 412 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
AP001790.1-201ENST00000511947 SRFP11831 508 aa16.01■□□□□ 0.15
AP001790.1-201ENST00000511947 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
AP001790.1-201ENST00000511947 GABRR2P28476 465 aa16.01■□□□□ 0.15
AP001790.1-201ENST00000511947 RAP1GAPP47736 663 aa16.01■□□□□ 0.15
AP001790.1-201ENST00000511947 CDH8P55286 799 aa16.01■□□□□ 0.15
AP001790.1-201ENST00000511947 TEAD2Q15562 447 aa16.01■□□□□ 0.15
AP001790.1-201ENST00000511947 DDR2Q16832 855 aa16.01■□□□□ 0.15
AP001790.1-201ENST00000511947 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
AP001790.1-201ENST00000511947 MDH1BQ5I0G3 518 aa16.01■□□□□ 0.15
AP001790.1-201ENST00000511947 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa16.01■□□□□ 0.15
AP001790.1-201ENST00000511947 SCN4BQ8IWT1 228 aa16.01■□□□□ 0.15
AP001790.1-201ENST00000511947 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
AP001790.1-201ENST00000511947 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa16.01■□□□□ 0.15
AP001790.1-201ENST00000511947 TAS1R2Q8TE23 839 aa16.01■□□□□ 0.15
AP001790.1-201ENST00000511947 NELFBQ8WX92 580 aa16.01■□□□□ 0.15
AP001790.1-201ENST00000511947 MYLPFQ96A32 169 aa16.01■□□□□ 0.15
AP001790.1-201ENST00000511947 GBP4Q96PP9 640 aa16.01■□□□□ 0.15
AP001790.1-201ENST00000511947 GCNAQ96QF7 691 aa16.01■□□□□ 0.15
AP001790.1-201ENST00000511947 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
AP001790.1-201ENST00000511947 GPR88Q9GZN0 384 aa16.01■□□□□ 0.15
AP001790.1-201ENST00000511947 ATXN3LQ9H3M9 355 aa16.01■□□□□ 0.15
AP001790.1-201ENST00000511947 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
AP001790.1-201ENST00000511947 CRTAC1Q9NQ79 661 aa16.01■□□□□ 0.15
AP001790.1-201ENST00000511947 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP16.01■□□□□ 0.15
AP001790.1-201ENST00000511947 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
AP001790.1-201ENST00000511947 MOSPD3O75425 235 aa16■□□□□ 0.15
AP001790.1-201ENST00000511947 CFHP08603 1231 aa16■□□□□ 0.15
AP001790.1-201ENST00000511947 MAGEA11P43364 429 aa16■□□□□ 0.15
AP001790.1-201ENST00000511947 GPR15P49685 360 aa16■□□□□ 0.15
AP001790.1-201ENST00000511947 MXI1P50539 228 aa16■□□□□ 0.15
AP001790.1-201ENST00000511947 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa16■□□□□ 0.15
AP001790.1-201ENST00000511947 FAM78AQ5JUQ0 283 aa16■□□□□ 0.15
AP001790.1-201ENST00000511947 SDHAF4Q5VUM1 108 aa16■□□□□ 0.15
AP001790.1-201ENST00000511947 KRT39Q6A163 491 aa16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51 ms