RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495350.5

CBX1-205, Transcript of chromobox 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CBX1, Length 550 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1-205ENST00000495350 CSH1P0DML2 217 aa6.67□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 CSH2P0DML3 217 aa6.67□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 CXCL8P10145 99 aa6.67□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 ATF6P18850 670 aa6.67□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 ITPKAP23677 461 aa6.67□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 NMT1P30419 496 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 LRPAP1P30533 357 aa6.67□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 P2RY2P41231 377 aa6.67□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 PTGER3P43115 390 aa6.67□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 FAM160A1Q05DH4 1040 aa6.67□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 PPP2R3AQ06190 1150 aa6.67□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 SMARCB1Q12824 385 aa6.67□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 NR5A1Q13285 461 aa6.67□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 CRY1Q16526 586 aa6.67□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 SPDYCQ5MJ68 293 aa6.67□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 TXNDC8Q6A555 127 aa6.67□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 RUFY3Q7L099 469 aa6.67□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 CCDC33Q8N5R6 958 aa6.67□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 MDM1Q8TC05 714 aa6.67□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 SPPL2BQ8TCT7 592 aa6.67□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 USP33Q8TEY7 942 aa6.67□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 OSCP1Q8WVF1 389 aa6.67□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa6.67□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 BICD1Q96G01 975 aa6.67□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 TMEM134Q9H6X4 195 aa6.67□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa6.67□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 IL21Q9HBE4 155 aa6.67□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 TRPC7Q9HCX4 862 aa6.67□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 KMT5AQ9NQR1 393 aa6.67□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 DSEQ9UL01 958 aa6.67□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa6.67□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 WNT6Q9Y6F9 365 aa6.67□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 STK36Q9NRP7 1315 aa6.67□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa6.66□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 FAM205CA6NFA0 338 aa6.66□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 CLDN3O15551 220 aa6.66□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 TOM1L1O75674 476 aa6.66□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 USP17L7P0C7H9 530 aa6.66□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 CYP3A5P20815 502 aa6.66□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 MUTP22033 750 aa6.66□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 PAX3P23760 479 aa6.66□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 RPA1P27694 616 aa6.66□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 ABCG1P45844 678 aa6.66□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 NPTX2P47972 431 aa6.66□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP6.66□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 NLRP12P59046 1061 aa6.66□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 FAM193AP78312 1265 aa6.66□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
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CBX1-205ENST00000495350 SLC14A1Q13336 389 aa6.66□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 TRIM29Q14134 588 aa6.66□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 KCNB1Q14721 858 aa6.66□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 SLC10A6Q3KNW5 377 aa6.66□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
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CBX1-205ENST00000495350 EOGTQ5NDL2 527 aa6.66□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 SLC36A4Q6YBV0 504 aa6.66□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 MON1AQ86VX9 555 aa6.66□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 THEM5Q8N1Q8 247 aa6.66□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 FSIP1Q8NA03 581 aa6.66□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 HMGB4Q8WW32 186 aa6.66□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 KCNB2Q92953 911 aa6.66□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 SENP8Q96LD8 212 aa6.66□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 MTMR9Q96QG7 549 aa6.66□□□□□ -1.34
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CBX1-205ENST00000495350 POLD4Q9HCU8 107 aa6.66□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 PTPRHQ9HD43 1115 aa6.66□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 FSCN3Q9NQT6 498 aa6.66□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 TMEM74BQ9NUR3 256 aa6.66□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 PILRBQ9UKJ0 227 aa6.66□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa6.65□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 MYMKA6NI61 221 aa6.65□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 TK2O00142 265 aa6.65□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 ARHGAP33O14559 1287 aa6.65□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 SLC16A4O15374 487 aa6.65□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 SH3BP5O60239 455 aa6.65□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 REC8O95072 547 aa6.65□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 CAPNS1P04632 268 aa6.65□□□□□ -1.34
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