RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495129.2

RPL23AP54-201, Transcript of ribosomal protein L23a pseudogene 54, humanhuman

BASIC

Gene RPL23AP54, Length 419 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL23AP54-201ENST00000495129 RGMAQ96B86 450 aa2.24□□□□□ -2.05
RPL23AP54-201ENST00000495129 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP2.24□□□□□ -2.05
RPL23AP54-201ENST00000495129 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP2.24□□□□□ -2.05
RPL23AP54-201ENST00000495129 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa2.24□□□□□ -2.05
RPL23AP54-201ENST00000495129 TCF7L1Q9HCS4 588 aa2.24□□□□□ -2.05
RPL23AP54-201ENST00000495129 SERHLQ9NQF3 203 aa2.24□□□□□ -2.05
RPL23AP54-201ENST00000495129 ARHGEF3Q9NR81 526 aa2.24□□□□□ -2.05
RPL23AP54-201ENST00000495129 ST6GALNAC1Q9NSC7 600 aaPredicted RBP2.24□□□□□ -2.05
RPL23AP54-201ENST00000495129 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP2.24□□□□□ -2.05
RPL23AP54-201ENST00000495129 DKK3Q9UBP4 350 aa2.24□□□□□ -2.05
RPL23AP54-201ENST00000495129 HESX1Q9UBX0 185 aa2.24□□□□□ -2.05
RPL23AP54-201ENST00000495129 BTBD3Q9Y2F9 522 aa2.24□□□□□ -2.05
RPL23AP54-201ENST00000495129 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa2.24□□□□□ -2.05
RPL23AP54-201ENST00000495129 H0YIZ8 118 aa2.23□□□□□ -2.05
RPL23AP54-201ENST00000495129 KCNAB3O43448 404 aa2.23□□□□□ -2.05
RPL23AP54-201ENST00000495129 IL6RP08887 468 aaPredicted RBP2.23□□□□□ -2.05
RPL23AP54-201ENST00000495129 FAM163BP0C2L3 166 aa2.23□□□□□ -2.05
RPL23AP54-201ENST00000495129 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP2.23□□□□□ -2.05
RPL23AP54-201ENST00000495129 PRR35P0CG20 571 aa2.23□□□□□ -2.05
RPL23AP54-201ENST00000495129 NDUFB7P17568 137 aa2.23□□□□□ -2.05
RPL23AP54-201ENST00000495129 VCAM1P19320 739 aa2.23□□□□□ -2.05
RPL23AP54-201ENST00000495129 KELP23276 732 aa2.23□□□□□ -2.05
RPL23AP54-201ENST00000495129 CCND1P24385 295 aa2.23□□□□□ -2.05
RPL23AP54-201ENST00000495129 AKAP5P24588 427 aa2.23□□□□□ -2.05
RPL23AP54-201ENST00000495129 PTGER1P34995 402 aa2.23□□□□□ -2.05
RPL23AP54-201ENST00000495129 VIPR2P41587 438 aa2.23□□□□□ -2.05
RPL23AP54-201ENST00000495129 ALDH9A1P49189 494 aa2.23□□□□□ -2.05
RPL23AP54-201ENST00000495129 MAP2K6P52564 334 aa2.23□□□□□ -2.05
RPL23AP54-201ENST00000495129 LOXL3P58215 753 aa2.23□□□□□ -2.05
RPL23AP54-201ENST00000495129 TUBA4AP68366 448 aa2.23□□□□□ -2.05
RPL23AP54-201ENST00000495129 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP2.23□□□□□ -2.05
RPL23AP54-201ENST00000495129 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP2.23□□□□□ -2.05
RPL23AP54-201ENST00000495129 VPS53Q5VIR6 699 aa2.23□□□□□ -2.05
RPL23AP54-201ENST00000495129 MTHFD1LQ6UB35 978 aa2.23□□□□□ -2.05
RPL23AP54-201ENST00000495129 SLC29A4Q7RTT9 530 aa2.23□□□□□ -2.05
RPL23AP54-201ENST00000495129 PPP1R3BQ86XI6 285 aa2.23□□□□□ -2.05
RPL23AP54-201ENST00000495129 CPA6Q8N4T0 437 aa2.23□□□□□ -2.05
RPL23AP54-201ENST00000495129 FBXO41Q8TF61 875 aa2.23□□□□□ -2.05
RPL23AP54-201ENST00000495129 DDB2Q92466 427 aa2.23□□□□□ -2.05
RPL23AP54-201ENST00000495129 PTDSS2Q9BVG9 487 aa2.23□□□□□ -2.05
RPL23AP54-201ENST00000495129 LMBRD1Q9NUN5 540 aa2.23□□□□□ -2.05
RPL23AP54-201ENST00000495129 DLL3Q9NYJ7 618 aa2.23□□□□□ -2.05
RPL23AP54-201ENST00000495129 ABCF2Q9UG63 623 aa2.23□□□□□ -2.05
RPL23AP54-201ENST00000495129 TISP43B9A030 160 aa2.22□□□□□ -2.05
RPL23AP54-201ENST00000495129 H7C1Q1 480 aa2.22□□□□□ -2.05
RPL23AP54-201ENST00000495129 M0QYG6 137 aa2.22□□□□□ -2.05
RPL23AP54-201ENST00000495129 PPP6CO00743 305 aa2.22□□□□□ -2.05
RPL23AP54-201ENST00000495129 ADAMTS3O15072 1205 aa2.22□□□□□ -2.05
RPL23AP54-201ENST00000495129 DCLK1O15075 740 aa2.22□□□□□ -2.05
RPL23AP54-201ENST00000495129 ERC2O15083 957 aa2.22□□□□□ -2.05
RPL23AP54-201ENST00000495129 PPM1DO15297 605 aa2.22□□□□□ -2.05
RPL23AP54-201ENST00000495129 MOSPD3O75425 235 aa2.22□□□□□ -2.05
RPL23AP54-201ENST00000495129 DNAJB5O75953 348 aa2.22□□□□□ -2.05
RPL23AP54-201ENST00000495129 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP2.22□□□□□ -2.05
RPL23AP54-201ENST00000495129 FTLP02792 175 aaPredicted RBP2.22□□□□□ -2.05
RPL23AP54-201ENST00000495129 TUBB4AP04350 444 aa2.22□□□□□ -2.05
RPL23AP54-201ENST00000495129 CHRM3P20309 590 aa2.22□□□□□ -2.05
RPL23AP54-201ENST00000495129 CTGFP29279 349 aa2.22□□□□□ -2.05
RPL23AP54-201ENST00000495129 ZNF134P52741 427 aa2.22□□□□□ -2.05
RPL23AP54-201ENST00000495129 EEFSECP57772 596 aaKnown RBP2.22□□□□□ -2.05
RPL23AP54-201ENST00000495129 GTF2H3Q13889 308 aa2.22□□□□□ -2.05
RPL23AP54-201ENST00000495129 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP2.22□□□□□ -2.05
RPL23AP54-201ENST00000495129 PGS1Q32NB8 556 aa2.22□□□□□ -2.05
RPL23AP54-201ENST00000495129 LONRF3Q496Y0 759 aa2.22□□□□□ -2.05
RPL23AP54-201ENST00000495129 MTX3Q5HYI7 312 aa2.22□□□□□ -2.05
RPL23AP54-201ENST00000495129 ZNF626Q68DY1 528 aa2.22□□□□□ -2.05
RPL23AP54-201ENST00000495129 TMEM108Q6UXF1 575 aa2.22□□□□□ -2.05
RPL23AP54-201ENST00000495129 ZNF66Q6ZN08 573 aa2.22□□□□□ -2.05
RPL23AP54-201ENST00000495129 MAVSQ7Z434 540 aa2.22□□□□□ -2.05
RPL23AP54-201ENST00000495129 FAM46DQ8NEK8 389 aa2.22□□□□□ -2.05
RPL23AP54-201ENST00000495129 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP2.22□□□□□ -2.05
RPL23AP54-201ENST00000495129 BRIX1Q8TDN6 353 aaKnown RBP2.22□□□□□ -2.05
RPL23AP54-201ENST00000495129 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP2.22□□□□□ -2.05
RPL23AP54-201ENST00000495129 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP2.22□□□□□ -2.05
RPL23AP54-201ENST00000495129 CHMP4CQ96CF2 233 aa2.22□□□□□ -2.05
RPL23AP54-201ENST00000495129 SLC46A1Q96NT5 459 aa2.22□□□□□ -2.05
RPL23AP54-201ENST00000495129 MOGAT1Q96PD6 335 aa2.22□□□□□ -2.05
RPL23AP54-201ENST00000495129 FSD1LQ9BXM9 530 aa2.22□□□□□ -2.05
RPL23AP54-201ENST00000495129 BRINP2Q9C0B6 783 aa2.22□□□□□ -2.05
RPL23AP54-201ENST00000495129 SLAMF7Q9NQ25 335 aa2.22□□□□□ -2.05
RPL23AP54-201ENST00000495129 NRIP3Q9NQ35 241 aa2.22□□□□□ -2.05
RPL23AP54-201ENST00000495129 DUSP22Q9NRW4 184 aa2.22□□□□□ -2.05
RPL23AP54-201ENST00000495129 PNPOQ9NVS9 261 aa2.22□□□□□ -2.05
RPL23AP54-201ENST00000495129 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa2.22□□□□□ -2.05
RPL23AP54-201ENST00000495129 PLEKHM1Q9Y4G2 1056 aa2.22□□□□□ -2.05
RPL23AP54-201ENST00000495129 PRRT4C9JH25 899 aa2.21□□□□□ -2.06
RPL23AP54-201ENST00000495129 QSOX1O00391 747 aa2.21□□□□□ -2.06
RPL23AP54-201ENST00000495129 TP73O15350 636 aa2.21□□□□□ -2.06
RPL23AP54-201ENST00000495129 VPS4BO75351 444 aa2.21□□□□□ -2.06
RPL23AP54-201ENST00000495129 AHSGP02765 367 aa2.21□□□□□ -2.06
RPL23AP54-201ENST00000495129 THP07101 528 aa2.21□□□□□ -2.06
RPL23AP54-201ENST00000495129 CYP2C9P11712 490 aa2.21□□□□□ -2.06
RPL23AP54-201ENST00000495129 EPHB2P29323 1055 aa2.21□□□□□ -2.06
RPL23AP54-201ENST00000495129 CYP2C18P33260 490 aa2.21□□□□□ -2.06
RPL23AP54-201ENST00000495129 LIPAP38571 399 aa2.21□□□□□ -2.06
RPL23AP54-201ENST00000495129 PHKA1P46020 1223 aa2.21□□□□□ -2.06
RPL23AP54-201ENST00000495129 PXNP49023 591 aaPredicted RBP2.21□□□□□ -2.06
RPL23AP54-201ENST00000495129 WNT3P56703 355 aa2.21□□□□□ -2.06
RPL23AP54-201ENST00000495129 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP2.21□□□□□ -2.06
RPL23AP54-201ENST00000495129 PLS1Q14651 629 aa2.21□□□□□ -2.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.6 ms