RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489895.5

NISCH-213, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 5,350 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-213ENST00000489895 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa17.79■□□□□ 0.44
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NISCH-213ENST00000489895 PTK6Q13882 451 aa17.79■□□□□ 0.44
NISCH-213ENST00000489895 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP17.79■□□□□ 0.44
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NISCH-213ENST00000489895 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP17.79■□□□□ 0.44
NISCH-213ENST00000489895 ZNF263O14978 683 aa17.79■□□□□ 0.44
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NISCH-213ENST00000489895 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa17.79■□□□□ 0.44
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NISCH-213ENST00000489895 ACOT1Q86TX2 421 aa17.77■□□□□ 0.44
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NISCH-213ENST00000489895 ETNK1Q9HBU6 452 aa17.77■□□□□ 0.44
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NISCH-213ENST00000489895 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP17.77■□□□□ 0.43
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NISCH-213ENST00000489895 GRIK4Q16099 956 aa17.76■□□□□ 0.43
NISCH-213ENST00000489895 TMEM119Q4V9L6 283 aa17.76■□□□□ 0.43
NISCH-213ENST00000489895 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP17.76■□□□□ 0.43
NISCH-213ENST00000489895 NT5DC4Q86YG4 428 aa17.76■□□□□ 0.43
NISCH-213ENST00000489895 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP17.76■□□□□ 0.43
NISCH-213ENST00000489895 TMEM176AQ96HP8 235 aa17.76■□□□□ 0.43
NISCH-213ENST00000489895 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP17.76■□□□□ 0.43
NISCH-213ENST00000489895 AKR1A1P14550 325 aa17.76■□□□□ 0.43
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