RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461219.5

SCAF8-204, Transcript of SR-related CTD associated factor 8, humanhuman

TSL 5

Gene SCAF8, Length 677 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF8-204ENST00000461219 GBP4Q96PP9 640 aa21.92■■□□□ 1.1
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SCAF8-204ENST00000461219 MKNK1Q9BUB5 465 aa21.92■■□□□ 1.1
SCAF8-204ENST00000461219 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
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SCAF8-204ENST00000461219 DENND4CQ5VZ89 1909 aa21.92■■□□□ 1.1
SCAF8-204ENST00000461219 A8MXQ7 604 aa21.91■■□□□ 1.1
SCAF8-204ENST00000461219 HTR4Q13639 388 aa21.91■■□□□ 1.1
SCAF8-204ENST00000461219 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa21.91■■□□□ 1.1
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SCAF8-204ENST00000461219 SV2AQ7L0J3 742 aa21.91■■□□□ 1.1
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SCAF8-204ENST00000461219 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa21.91■■□□□ 1.1
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SCAF8-204ENST00000461219 PSMG2Q969U7 264 aa21.91■■□□□ 1.1
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SCAF8-204ENST00000461219 MICAL2O94851 1124 aa21.9■■□□□ 1.1
SCAF8-204ENST00000461219 HLA-DRAP01903 254 aa21.9■■□□□ 1.1
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SCAF8-204ENST00000461219 CCNE1P24864 410 aa21.9■■□□□ 1.1
SCAF8-204ENST00000461219 LMO2P25791 158 aa21.9■■□□□ 1.1
SCAF8-204ENST00000461219 ANXA13P27216 316 aa21.9■■□□□ 1.1
SCAF8-204ENST00000461219 PRSS36Q5K4E3 855 aa21.9■■□□□ 1.1
SCAF8-204ENST00000461219 PARM1Q6UWI2 310 aa21.9■■□□□ 1.1
SCAF8-204ENST00000461219 SLC44A3Q8N4M1 653 aa21.9■■□□□ 1.1
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SCAF8-204ENST00000461219 ATXN3LQ9H3M9 355 aa21.9■■□□□ 1.1
SCAF8-204ENST00000461219 ABCB6Q9NP58 842 aa21.9■■□□□ 1.1
SCAF8-204ENST00000461219 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP21.9■■□□□ 1.12e-6■■■■■ 56.3
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SCAF8-204ENST00000461219 A0A1W2PRU2 124 aa21.89■■□□□ 1.09
SCAF8-204ENST00000461219 MYBPHLA2RUH7 354 aa21.89■■□□□ 1.09
SCAF8-204ENST00000461219 GOLGA6L22H0YM25 854 aa21.89■■□□□ 1.09
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SCAF8-204ENST00000461219 ATP8B3O60423 1300 aa21.87■■□□□ 1.09
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SCAF8-204ENST00000461219 CSH1P0DML2 217 aa21.87■■□□□ 1.09
SCAF8-204ENST00000461219 CSH2P0DML3 217 aa21.87■■□□□ 1.09
SCAF8-204ENST00000461219 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
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SCAF8-204ENST00000461219 CDH8P55286 799 aa21.87■■□□□ 1.09
SCAF8-204ENST00000461219 DDR2Q16832 855 aa21.87■■□□□ 1.09
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